MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaerococcus prevotii DSM 20548 chromosome

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013171	TTCTTT	2	12	10041	10052	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013171	TTTAAT	2	12	28458	28469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013171	GCTATG	2	12	71073	71084	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013171	TAAATA	2	12	71118	71129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013171	AAAGCG	2	12	83971	83982	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013171	GTGAAG	2	12	84048	84059	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013171	TATTTT	2	12	88002	88013	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013171	TGTTTC	2	12	106528	106539	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013171	TTATTT	2	12	121925	121936	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013171	TGGAAC	2	12	134160	134171	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013171	ATGAAT	2	12	135527	135538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013171	TTCCTT	2	12	153111	153122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013171	CTAAGC	2	12	207406	207417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013171	ATATAG	2	12	226482	226493	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013171	AAAGCG	2	12	238347	238358	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013171	GTGAAG	2	12	238424	238435	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013171	CGATTC	2	12	241330	241341	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013171	CCTATT	2	12	284984	284995	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013171	TAAAAA	2	12	292308	292319	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013171	CTATAT	2	12	295922	295933	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013171	TCCTAC	2	12	295947	295958	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013171	TTAAAA	2	12	312853	312864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013171	AAGTTA	2	12	319942	319953	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013171	TATAAA	2	12	324675	324686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013171	ATATTT	2	12	352269	352280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013171	AACTTA	2	12	364008	364019	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013171	TCAAAA	2	12	382959	382970	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013171	ACCCTT	2	12	384828	384839	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013171	ACTGGG	2	12	388684	388695	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013171	GATTCT	2	12	402416	402427	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013171	TTTTGA	2	12	407188	407199	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013171	TTTATA	2	12	428122	428133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013171	TTATAA	2	12	444113	444124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013171	TAAGGG	2	12	479794	479805	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013171	TATTTG	2	12	482311	482322	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013171	GACAAA	2	12	493651	493662	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013171	AAATAG	2	12	552092	552103	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013171	CAAAAT	2	12	596179	596190	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013171	ACTAAA	2	12	636188	636199	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013171	AAAGCG	2	12	645965	645976	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013171	GTGAAG	2	12	646042	646053	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013171	TAATTT	2	12	648935	648946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013171	TATATT	2	12	667978	667989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013171	AATATT	2	12	679184	679195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013171	TATTTT	2	12	783614	783625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013171	AAAAAT	2	12	793655	793666	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013171	AGATGA	2	12	796680	796691	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013171	TTTTTA	2	12	936607	936618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013171	ATATTT	2	12	1018664	1018675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013171	AATATA	2	12	1019010	1019021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013171	ATAAAA	2	12	1054409	1054420	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013171	ATTTTA	2	12	1061248	1061259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013171	TTTCTC	2	12	1127185	1127196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013171	GATAAG	2	12	1214615	1214626	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013171	ACTTTT	2	12	1225808	1225819	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013171	ATTTTT	2	12	1229751	1229762	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013171	ATATTT	2	12	1255380	1255391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013171	AAGCTT	2	12	1288652	1288663	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013171	TAAAAA	2	12	1324674	1324685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013171	TCCCCT	2	12	1328600	1328611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_013171	TATCAA	2	12	1340418	1340429	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013171	TAAGGT	2	12	1354139	1354150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013171	TTTTAC	2	12	1372023	1372034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013171	TAGAAA	2	12	1380735	1380746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013171	AAAAAC	2	12	1425864	1425875	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013171	CTTCAC	2	12	1429882	1429893	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013171	TCGCTT	2	12	1429958	1429969	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013171	ACTTTC	2	12	1430258	1430269	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013171	GACAAA	2	12	1475822	1475833	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013171	CTTTAT	2	12	1475938	1475949	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013171	AAGCCT	2	12	1518033	1518044	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013171	ATAAAT	2	12	1528622	1528633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013171	ATTTTG	2	12	1542598	1542609	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013171	CTTTTT	2	12	1564981	1564992	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_013171	TCTCAT	2	12	1570734	1570745	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013171	ATCTTT	2	12	1571431	1571442	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013171	TCTTTT	2	12	1576557	1576568	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013171	TTTTAT	2	12	1598766	1598777	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013171	CTTTCT	2	12	1636233	1636244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013171	ATAAAA	2	12	1648055	1648066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013171	CAAAAT	2	12	1651715	1651726	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013171	TTGTTT	2	12	1664009	1664020	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013171	TTGTTT	2	12	1664656	1664667	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013171	CTTATC	2	12	1794518	1794529	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013171	CTTTTT	2	12	1798232	1798243	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.