MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaerococcus prevotii DSM 20548 chromosome

Total Repeats: 300

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013171	GGAAG	2	10	20252	20261	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013171	TTTTG	2	10	26030	26039	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013171	TATAA	2	10	26055	26064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013171	TTATG	2	10	28486	28495	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013171	TTACA	2	10	28678	28687	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013171	TAATT	2	10	29499	29508	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013171	AATTT	2	10	32086	32095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013171	TTTAC	2	10	61326	61335	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013171	TTATA	2	10	66581	66590	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013171	TGATG	2	10	79867	79876	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013171	AGTTA	2	10	80263	80272	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013171	AATTT	2	10	80887	80896	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013171	AAATA	3	15	80926	80940	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013171	TCTAA	2	10	81179	81188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013171	TATGA	2	10	81878	81887	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013171	TCGTG	2	10	82744	82753	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013171	GAAAA	2	10	83604	83613	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013171	TAAGC	2	10	84996	85005	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013171	AAGAT	2	10	86302	86311	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013171	GAATA	2	10	93869	93878	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013171	ATTAT	2	10	93896	93905	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013171	TAAAA	2	10	103817	103826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013171	CTTAG	2	10	105745	105754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013171	TTTTA	2	10	112662	112671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013171	TTCTT	2	10	135514	135523	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013171	AAAAT	2	10	135677	135686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013171	TAAAA	2	10	140988	140997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013171	ATATA	2	10	165205	165214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013171	TATAA	2	10	183863	183872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013171	TTTTC	2	10	186257	186266	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013171	ACTTT	2	10	191084	191093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013171	AATAG	2	10	192722	192731	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013171	TATAA	2	10	201645	201654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013171	TTTTC	2	10	213501	213510	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013171	AGAAA	2	10	231853	231862	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013171	TATGA	2	10	236031	236040	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013171	TCGTG	2	10	236898	236907	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013171	TTAAA	2	10	237458	237467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013171	GCAAA	2	10	237579	237588	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013171	GAAAA	2	10	237980	237989	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013171	CAAAT	2	10	238965	238974	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013171	TAAGC	2	10	239362	239371	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013171	AAGAT	2	10	240668	240677	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013171	TATAG	2	10	240983	240992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013171	GCTTT	2	10	242083	242092	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013171	CATCT	2	10	243304	243313	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_013171	CATTC	2	10	243375	243384	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_013171	TCATT	2	10	243538	243547	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013171	TAATC	2	10	243759	243768	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013171	TAGTA	2	10	243800	243809	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013171	TTTCA	2	10	245480	245489	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013171	TAAAA	2	10	247842	247851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013171	CTTTT	2	10	253652	253661	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013171	TAAGT	2	10	267292	267301	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013171	CTTTT	2	10	290966	290975	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013171	AGACA	2	10	292751	292760	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013171	ATAGT	2	10	298135	298144	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013171	TTAAA	2	10	312498	312507	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013171	TTAAT	2	10	315232	315241	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013171	TATAA	2	10	316530	316539	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013171	TATAG	2	10	328839	328848	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013171	TATTT	2	10	328872	328881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013171	TATGA	2	10	330215	330224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013171	TAGTA	2	10	344482	344491	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013171	CATGT	2	10	346895	346904	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013171	AGCTA	2	10	346946	346955	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013171	AGCGA	2	10	347076	347085	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013171	TTTAC	2	10	348161	348170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013171	TAGTA	2	10	349489	349498	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013171	CTTCG	2	10	358172	358181	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_013171	ATTTT	2	10	358411	358420	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013171	TATAA	2	10	361347	361356	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013171	GCAAA	2	10	363691	363700	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013171	GAAAG	2	10	364142	364151	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013171	GAGCG	2	10	364203	364212	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013171	GCTTT	2	10	369930	369939	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_013171	TTTTA	2	10	372635	372644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013171	TCGAG	2	10	383099	383108	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013171	TCATT	2	10	384020	384029	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013171	AAATA	2	10	384138	384147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013171	TTAAG	2	10	384769	384778	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013171	TTTTA	2	10	385205	385214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013171	TATGA	2	10	387006	387015	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013171	GGGAC	2	10	391567	391576	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013171	ATAAG	2	10	391798	391807	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013171	TATTT	2	10	402586	402595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013171	AAGGA	2	10	430097	430106	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013171	AGATA	2	10	431695	431704	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013171	CTTAT	2	10	436390	436399	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_013171	CAAAA	2	10	443311	443320	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013171	TATAA	2	10	445556	445565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013171	ATTAA	2	10	450448	450457	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013171	AAAAC	2	10	454758	454767	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013171	TAGTA	2	10	455254	455263	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013171	CGCTC	2	10	465508	465517	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_013171	CCTCT	2	10	466784	466793	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_013171	TATAT	2	10	473603	473612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013171	GATTT	2	10	480368	480377	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013171	TCACC	2	10	484485	484494	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_013171	TTCCT	2	10	491127	491136	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_013171	AAATT	2	10	493955	493964	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013171	TAAAA	2	10	495044	495053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013171	TATAA	2	10	497464	497473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013171	TTTAT	2	10	513876	513885	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013171	AAAAG	2	10	521010	521019	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013171	GAAGC	2	10	525381	525390	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013171	TTAAT	2	10	525849	525858	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013171	TATAA	2	10	525928	525937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013171	AACTA	2	10	526093	526102	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_013171	TAAAA	2	10	545083	545092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013171	ACTAA	2	10	545117	545126	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_013171	AAAAT	2	10	546547	546556	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013171	AGTAT	2	10	546590	546599	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013171	GAAGA	2	10	557226	557235	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013171	AATTT	2	10	567635	567644	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013171	TAAAA	2	10	567712	567721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013171	AATTA	2	10	569005	569014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013171	AAAAG	2	10	593446	593455	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013171	TATAG	2	10	596389	596398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013171	TAATA	2	10	638524	638533	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013171	AATAT	2	10	643292	643301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013171	AATTA	2	10	643359	643368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013171	ATAAC	2	10	643377	643386	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_013171	TATGA	2	10	643678	643687	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013171	TCGTG	2	10	644544	644553	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013171	GCAAA	2	10	645192	645201	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013171	GAAAA	2	10	645598	645607	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013171	TAAGC	2	10	646990	646999	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013171	AAGAT	2	10	648296	648305	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013171	TAAAA	2	10	659851	659860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013171	TAAAA	2	10	670793	670802	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013171	ATAAA	2	10	671914	671923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013171	ATATT	2	10	672041	672050	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013171	TAAAG	2	10	679151	679160	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013171	CTTAA	2	10	681023	681032	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_013171	AAAAT	2	10	681072	681081	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013171	TATCT	2	10	682649	682658	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_013171	TAAAA	2	10	682784	682793	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013171	GGGGA	2	10	690012	690021	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013171	ATATA	2	10	690162	690171	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013171	ATTGC	2	10	691456	691465	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_013171	AAAAT	2	10	691496	691505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013171	AAAAG	2	10	691676	691685	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013171	TCTTA	2	10	701388	701397	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_013171	ACTAT	2	10	721674	721683	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_013171	AAATG	2	10	729301	729310	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013171	AATAG	2	10	741056	741065	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013171	AATAT	2	10	751782	751791	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_013171	TAAAA	2	10	1807069	1807078	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_013171	AAAAT	2	10	1807900	1807909	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_013171	CTATA	2	10	1833023	1833032	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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296	NC_013171	ATTTA	2	10	1847943	1847952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_013171	AAAAT	2	10	1861472	1861481	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_013171	TTATC	2	10	1863224	1863233	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
300	NC_013171	TATAA	2	10	1869776	1869785	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.