MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 5602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013124	GAG	3	9	1376597	1376605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_013124	GAG	2	6	1376611	1376616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_013124	TGGG	2	8	1376654	1376661	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_013124	CCA	3	9	1376671	1376679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_013124	TGC	2	6	1376764	1376769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_013124	CG	3	6	1376787	1376792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_013124	ACG	2	6	1376818	1376823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_013124	GGGCC	2	10	1376829	1376838	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3509	NC_013124	ACCC	2	8	1376874	1376881	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3510	NC_013124	GAGC	2	8	1376930	1376937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3511	NC_013124	AGCG	2	8	1376949	1376956	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3512	NC_013124	GCCT	2	8	1376957	1376964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_013124	CG	3	6	1377005	1377010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_013124	CCGG	2	8	1377080	1377087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3515	NC_013124	GCAC	2	8	1377090	1377097	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_013124	GGC	2	6	1377265	1377270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_013124	CTC	2	6	1377271	1377276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_013124	CACC	2	8	1378047	1378054	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3519	NC_013124	CTT	2	6	1378064	1378069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_013124	CGT	2	6	1378070	1378075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_013124	CCT	2	6	1379508	1379513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3522	NC_013124	GCC	2	6	1379612	1379617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_013124	GAT	2	6	1379624	1379629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_013124	CG	3	6	1380464	1380469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_013124	CG	3	6	1380480	1380485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_013124	CG	5	10	1380542	1380551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_013124	CGA	2	6	1380583	1380588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_013124	CGG	2	6	1385231	1385236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_013124	CGA	2	6	1385247	1385252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_013124	GAG	2	6	1385344	1385349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_013124	CGA	2	6	1385350	1385355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_013124	GC	3	6	1386775	1386780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_013124	CG	3	6	1386790	1386795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3534	NC_013124	GAT	2	6	1387950	1387955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_013124	GC	4	8	1388129	1388136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_013124	CGC	2	6	1388172	1388177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_013124	CGA	2	6	1388190	1388195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_013124	ACG	2	6	1388215	1388220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_013124	GTG	2	6	1388222	1388227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_013124	CG	3	6	1388230	1388235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_013124	GCC	2	6	1388297	1388302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_013124	CGAC	2	8	1388310	1388317	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_013124	GAA	2	6	1388421	1388426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_013124	GCC	2	6	1388433	1388438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_013124	GGA	3	9	1388439	1388447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_013124	CGG	2	6	1388469	1388474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_013124	CG	3	6	1388619	1388624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_013124	GTC	2	6	1388625	1388630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_013124	CGC	2	6	1389132	1389137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_013124	GAG	2	6	1389169	1389174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013124	GCC	2	6	1390188	1390193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3552	NC_013124	CGCC	2	8	1390295	1390302	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3553	NC_013124	CGA	2	6	1390324	1390329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_013124	GTCGC	2	10	1390344	1390353	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3555	NC_013124	G	6	6	1390387	1390392	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_013124	CGT	2	6	1390406	1390411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_013124	CT	3	6	1390670	1390675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_013124	CGA	2	6	1390694	1390699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_013124	CCT	2	6	1392395	1392400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_013124	AAT	2	6	1392440	1392445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_013124	AGA	2	6	1393368	1393373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_013124	GC	3	6	1393423	1393428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_013124	ACG	2	6	1393473	1393478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_013124	GACCC	2	10	1393495	1393504	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3565	NC_013124	CGA	2	6	1393514	1393519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_013124	TCG	2	6	1393530	1393535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_013124	GCCCC	2	10	1393547	1393556	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3568	NC_013124	GC	3	6	1393586	1393591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_013124	CTC	2	6	1393601	1393606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_013124	CG	3	6	1395601	1395606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_013124	CGCA	2	8	1395624	1395631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3572	NC_013124	CGT	2	6	1395671	1395676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_013124	AGA	2	6	1395767	1395772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_013124	GCG	2	6	1395775	1395780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_013124	GC	3	6	1396811	1396816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_013124	CTT	2	6	1396859	1396864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_013124	TGG	2	6	1397097	1397102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_013124	CCT	2	6	1397893	1397898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_013124	CGCCT	2	10	1397923	1397932	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3580	NC_013124	CG	3	6	1397978	1397983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_013124	GCCA	2	8	1397989	1397996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_013124	TGG	2	6	1398013	1398018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_013124	CGCA	2	8	1398019	1398026	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3584	NC_013124	GGT	2	6	1398092	1398097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_013124	GAG	2	6	1398235	1398240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_013124	GC	3	6	1398296	1398301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_013124	CGAG	2	8	1398341	1398348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3588	NC_013124	GCA	2	6	1399489	1399494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_013124	GA	3	6	1399506	1399511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_013124	CGA	2	6	1399529	1399534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_013124	GTC	2	6	1399604	1399609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_013124	CTC	2	6	1402308	1402313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3593	NC_013124	GTCG	2	8	1406060	1406067	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3594	NC_013124	CGG	2	6	1407444	1407449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_013124	GAG	2	6	1407507	1407512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_013124	AC	3	6	1407586	1407591	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3597	NC_013124	CCT	2	6	1413330	1413335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_013124	CCG	2	6	1413344	1413349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_013124	GGC	2	6	1417185	1417190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_013124	GGGT	2	8	1417202	1417209	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_013124	GAG	2	6	1417219	1417224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_013124	GGGA	2	8	1418076	1418083	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_013124	AT	3	6	1419172	1419177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_013124	AGG	2	6	1419186	1419191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_013124	CG	3	6	1419811	1419816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_013124	CAT	2	6	1420214	1420219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_013124	CGA	2	6	1420331	1420336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_013124	ACCG	2	8	1420384	1420391	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_013124	GTCG	2	8	1420392	1420399	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3610	NC_013124	GGAC	2	8	1420400	1420407	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_013124	G	6	6	1420422	1420427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_013124	TCA	2	6	1421953	1421958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_013124	AGGG	2	8	1421999	1422006	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_013124	GCCG	2	8	1422380	1422387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3615	NC_013124	CGGA	2	8	1422400	1422407	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3616	NC_013124	CTC	2	6	1422668	1422673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_013124	GGAT	2	8	1422733	1422740	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_013124	GC	3	6	1422782	1422787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_013124	TCC	2	6	1422798	1422803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_013124	GCACG	2	10	1422806	1422815	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3621	NC_013124	CCT	2	6	1428518	1428523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_013124	CGAC	2	8	1428558	1428565	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_013124	CGGT	3	12	1428566	1428577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3624	NC_013124	AGG	2	6	1428609	1428614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_013124	GAC	2	6	1432606	1432611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_013124	TCG	2	6	1432624	1432629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_013124	CGGC	2	8	1432646	1432653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_013124	ACG	2	6	1432721	1432726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_013124	CACC	2	8	1434082	1434089	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3630	NC_013124	ACC	2	6	1434169	1434174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_013124	TGG	2	6	1434210	1434215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_013124	GTG	2	6	1434231	1434236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3762	NC_013124	GGA	2	6	1462563	1462568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3763	NC_013124	GTT	2	6	1462569	1462574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3787	NC_013124	TCGA	2	8	1469294	1469301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3794	NC_013124	CT	3	6	1472197	1472202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3796	NC_013124	G	6	6	1473097	1473102	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3832	NC_013124	CCGA	2	8	1502400	1502407	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3872	NC_013124	CGAT	2	8	1507826	1507833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3873	NC_013124	TCG	2	6	1507839	1507844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3876	NC_013124	GCG	2	6	1507954	1507959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3880	NC_013124	GAC	2	6	1508047	1508052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3882	NC_013124	CAT	2	6	1508098	1508103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3885	NC_013124	GAT	2	6	1508151	1508156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3887	NC_013124	CGC	2	6	1510133	1510138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3888	NC_013124	CG	3	6	1510207	1510212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3889	NC_013124	G	6	6	1510257	1510262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3890	NC_013124	GTGTT	2	10	1510288	1510297	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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