MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 chromosome

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012913	AAAATA	2	12	17479	17490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012913	AATTAA	2	12	25990	26001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012913	AAAATA	2	12	59499	59510	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012913	GCAATA	2	12	252144	252155	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012913	GACCTT	2	12	283207	283218	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012913	CCGAAA	2	12	284136	284147	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012913	ACCATA	2	12	284557	284568	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012913	CCGGTT	2	12	311385	311396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012913	TGTAGC	2	12	342796	342807	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012913	ATAAAA	2	12	343049	343060	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012913	GAAATA	2	12	367285	367296	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012913	TGATAA	2	12	372305	372316	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012913	AAAGAA	2	12	391764	391775	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012913	AAAAAG	2	12	394033	394044	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012913	TTTTTA	2	12	405825	405836	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012913	CGTTAT	2	12	439662	439673	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012913	AAATTG	2	12	439720	439731	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012913	GTACTT	2	12	451358	451369	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012913	CGAAGG	2	12	451998	452009	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012913	GACAGA	2	12	453763	453774	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012913	TGAAAT	2	12	455489	455500	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012913	AAGACG	2	12	456294	456305	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012913	TAAATC	2	12	480829	480840	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012913	TAACGC	2	12	489351	489362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012913	GGCGGT	2	12	504599	504610	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012913	ACGATA	2	12	504762	504773	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012913	CGCTTG	2	12	504938	504949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012913	TGTTCA	2	12	508521	508532	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012913	CAGCTA	2	12	525598	525609	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012913	CAACGG	2	12	525664	525675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012913	TGGATT	2	12	578575	578586	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012913	GTACTT	2	12	591782	591793	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012913	CGAAGG	2	12	592422	592433	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012913	GACAGA	2	12	594187	594198	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012913	TGAAAT	2	12	595913	595924	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012913	AAGACG	2	12	596718	596729	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012913	TATTTA	2	12	615467	615478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012913	TTCTTT	2	12	629037	629048	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012913	TGATTC	2	12	635223	635234	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012913	AATTGG	2	12	635681	635692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012913	AGATCA	2	12	666499	666510	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012913	TTGTTT	2	12	666539	666550	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012913	TTTCTG	2	12	680858	680869	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012913	TTGAGC	2	12	701261	701272	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012913	CAAGTG	2	12	705743	705754	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_012913	GATCAC	2	12	717037	717048	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012913	ATCTCC	2	12	718765	718776	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012913	TGAAAA	2	12	728376	728387	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012913	TTCACC	2	12	746532	746543	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012913	TTATTT	2	12	808619	808630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012913	TTTTTA	2	12	910259	910270	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012913	GATCTC	2	12	930247	930258	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012913	TGAAAT	2	12	942204	942215	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012913	TCATTT	2	12	966553	966564	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_012913	CTAGGC	2	12	973330	973341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012913	AAAATG	2	12	973472	973483	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012913	AATAAA	2	12	981798	981809	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012913	GTTAAC	2	12	987970	987981	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012913	TTAACA	2	12	988018	988029	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012913	CAACCT	2	12	997764	997775	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012913	TCATTA	2	12	1013450	1013461	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012913	AAAGTT	2	12	1040987	1040998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012913	AAATTT	2	12	1048042	1048053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012913	AATATC	2	12	1055038	1055049	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012913	CTTAAT	2	12	1066628	1066639	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012913	ATGTTT	2	12	1077484	1077495	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012913	ATCACA	2	12	1101558	1101569	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012913	TGCAAA	2	12	1120835	1120846	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012913	CGAAAT	2	12	1133497	1133508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_012913	AATGTT	2	12	1193229	1193240	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012913	TTAATT	2	12	1226266	1226277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012913	GGATTA	2	12	1234045	1234056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012913	ATTTTA	2	12	1249412	1249423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012913	TATAAA	2	12	1268888	1268899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012913	ATTATA	2	12	1317496	1317507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012913	TTAAAA	2	12	1332250	1332261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012913	GCTTTT	2	12	1357184	1357195	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012913	GCTTTT	2	12	1357268	1357279	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012913	GTTTTT	2	12	1357567	1357578	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012913	TCACCA	2	12	1379771	1379782	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012913	AATAAA	2	12	1386886	1386897	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012913	CGTCTT	2	12	1423858	1423869	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012913	ATTTCA	2	12	1424663	1424674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_012913	CTCTGT	2	12	1426388	1426399	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012913	GCCTTC	2	12	1428153	1428164	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012913	AAGTAC	2	12	1428794	1428805	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012913	CGTTTT	2	12	1536016	1536027	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_012913	TTTCGG	2	12	1540597	1540608	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012913	AAGGTC	2	12	1541526	1541537	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012913	TAAAAA	2	12	1575976	1575987	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012913	AAAAAC	2	12	1612650	1612661	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_012913	TCGGCA	2	12	1681957	1681968	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012913	TTATTT	2	12	1684917	1684928	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012913	CGTCTT	2	12	1734725	1734736	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012913	ATTTCA	2	12	1735530	1735541	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012913	CTCTGT	2	12	1737255	1737266	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012913	GCCTTC	2	12	1739020	1739031	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012913	AAGTAC	2	12	1739661	1739672	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012913	CCGATC	2	12	1758165	1758176	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012913	TTTATC	2	12	1766018	1766029	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_012913	CTCCGA	2	12	1821215	1821226	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012913	CAAAAT	2	12	1824690	1824701	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_012913	CATGAA	2	12	1859864	1859875	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012913	CGTCTT	2	12	1916808	1916819	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012913	ATTTCA	2	12	1917613	1917624	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_012913	CTCTGT	2	12	1919338	1919349	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012913	GCCTTC	2	12	1921103	1921114	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012913	AAGTAC	2	12	1921744	1921755	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_012913	TTTAGA	2	12	1956996	1957007	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012913	TTTAAA	2	12	1963682	1963693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012913	TATTTT	2	12	1991085	1991096	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012913	AATAAA	2	12	2024047	2024058	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012913	ACGGCA	2	12	2026931	2026942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012913	CAAACG	2	12	2048408	2048419	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012913	AAAATA	2	12	2061879	2061890	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012913	CGATAA	2	12	2065576	2065587	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_012913	TATGTT	2	12	2071605	2071616	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012913	GTACTT	2	12	2103920	2103931	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_012913	CGAAGG	2	12	2104560	2104571	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_012913	GACAGA	2	12	2106325	2106336	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_012913	TGAAAT	2	12	2108051	2108062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012913	AAGACG	2	12	2108856	2108867	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_012913	TTTTAT	2	12	2116206	2116217	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012913	TTTAAA	2	12	2124069	2124080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012913	TGGTCT	2	12	2141178	2141189	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_012913	TTTTTA	2	12	2150568	2150579	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012913	ATTGAA	2	12	2185192	2185203	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012913	TAAAAA	2	12	2207413	2207424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012913	ACAGTC	2	12	2213557	2213568	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012913	TAACAT	2	12	2228875	2228886	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_012913	CAAAAT	2	12	2263000	2263011	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_012913	AATATG	2	12	2279868	2279879	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012913	AATTTT	2	12	2283994	2284005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012913	TGTAAT	2	12	2299765	2299776	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012913	ATCGGT	2	12	2309631	2309642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.