MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 chromosome

Total Repeats: 1081

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012913	CCAA	2	8	7830	7837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012913	ATCT	2	8	7896	7903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012913	ATTT	2	8	7917	7924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012913	GAAA	2	8	11490	11497	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012913	CTTT	2	8	12138	12145	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012913	TTTA	2	8	19999	20006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012913	TCTT	2	8	28256	28263	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012913	TCAA	2	8	36306	36313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012913	TTTA	2	8	40504	40511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012913	TTTG	2	8	40540	40547	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012913	AAAG	2	8	40586	40593	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012913	CAAA	2	8	40719	40726	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012913	ATGG	2	8	47848	47855	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012913	TTTA	2	8	50696	50703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012913	TTGC	2	8	55136	55143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012913	ACGA	2	8	55401	55408	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012913	AGTT	2	8	55493	55500	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012913	AATA	2	8	56250	56257	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012913	TATC	2	8	56977	56984	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012913	ATGG	2	8	57238	57245	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012913	TTCA	2	8	57285	57292	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_012913	TTGC	2	8	57515	57522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012913	TTGG	2	8	57604	57611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012913	TGGT	2	8	57798	57805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012913	AGAT	2	8	69316	69323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012913	CAAA	2	8	76123	76130	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012913	ATTT	2	8	77811	77818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012913	GAAA	2	8	80245	80252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012913	GAGC	2	8	80576	80583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_012913	GTTG	2	8	80632	80639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012913	AGTT	2	8	82495	82502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012913	TTTC	2	8	87520	87527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012913	TTAT	2	8	88867	88874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012913	AACA	2	8	90750	90757	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012913	TAAA	2	8	97331	97338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012913	ATTA	2	8	103211	103218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012913	AAAT	2	8	103255	103262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012913	AATT	2	8	103290	103297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012913	ATTG	2	8	103449	103456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012913	AATC	2	8	106439	106446	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_012913	GAAA	2	8	110673	110680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012913	GGAA	2	8	111668	111675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012913	CGTT	2	8	111684	111691	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012913	TCCT	2	8	111692	111699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012913	ACCG	2	8	116367	116374	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012913	CGGT	2	8	116400	116407	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012913	TCGG	2	8	125480	125487	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_012913	ATAA	2	8	127451	127458	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012913	ACCA	2	8	127808	127815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012913	CTTT	2	8	127826	127833	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012913	CTGC	2	8	128096	128103	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012913	GATT	2	8	128263	128270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012913	AGCG	2	8	139896	139903	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012913	ACCA	2	8	139933	139940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012913	ACCA	2	8	140152	140159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012913	TTAA	2	8	140294	140301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012913	AAGC	2	8	140501	140508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_012913	ATAG	2	8	140750	140757	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012913	TAAA	2	8	141380	141387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012913	ATAA	2	8	141410	141417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012913	TGCT	2	8	145740	145747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012913	TAAA	2	8	151123	151130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012913	TGTT	2	8	151217	151224	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012913	TTTA	2	8	151225	151232	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012913	TGAA	2	8	152799	152806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012913	CCAA	2	8	155556	155563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012913	TAAA	2	8	158306	158313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012913	GAAA	2	8	164874	164881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012913	TTTG	2	8	171156	171163	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012913	TAAA	2	8	173703	173710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012913	GTTT	2	8	183011	183018	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012913	GTTT	2	8	183023	183030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012913	ATTT	2	8	183074	183081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012913	TAAA	2	8	183097	183104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012913	AACT	2	8	192438	192445	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012913	AATA	2	8	198413	198420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012913	CAAA	2	8	200213	200220	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012913	AAAC	2	8	220016	220023	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_012913	GCTT	2	8	223321	223328	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_012913	TAAA	2	8	225561	225568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012913	GGTT	2	8	230102	230109	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012913	CGAA	2	8	234511	234518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_012913	GATT	2	8	234528	234535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012913	GTAA	2	8	234655	234662	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012913	ACGG	2	8	234699	234706	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012913	CAGG	2	8	234734	234741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_012913	TAAG	2	8	243124	243131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012913	TGTC	2	8	243306	243313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012913	GTTT	2	8	244362	244369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012913	TGTT	2	8	246007	246014	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012913	TAAT	2	8	246262	246269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012913	AGAA	2	8	246393	246400	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012913	ATTA	2	8	248283	248290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012913	AATT	2	8	248495	248502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012913	TAAA	2	8	248586	248593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012913	ATTT	2	8	248600	248607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012913	TGTT	2	8	248719	248726	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012913	AATT	2	8	248816	248823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012913	TTTA	2	8	248930	248937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012913	TCTT	2	8	249271	249278	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012913	CTTG	2	8	250868	250875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012913	GCAA	2	8	252278	252285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_012913	AACC	2	8	252305	252312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012913	AATA	2	8	252435	252442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012913	AAAC	2	8	258607	258614	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_012913	CTGA	2	8	258826	258833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012913	CTAT	2	8	258889	258896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_012913	TAAA	3	12	268589	268600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012913	TATT	2	8	269891	269898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012913	AAAT	2	8	273017	273024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012913	CTTT	2	8	273047	273054	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_012913	ATTT	2	8	273110	273117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012913	GTCA	2	8	284286	284293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012913	TGCA	2	8	284542	284549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_012913	TCAA	2	8	284950	284957	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_012913	AGTG	2	8	295308	295315	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012913	ATTT	2	8	296891	296898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012913	TTTC	2	8	296941	296948	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_012913	AGTA	2	8	297042	297049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012913	ATCT	2	8	298129	298136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012913	TAAA	2	8	298378	298385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012913	ATTC	2	8	304759	304766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_012913	ACCA	2	8	311418	311425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012913	ATAA	2	8	311742	311749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012913	GCAT	2	8	312471	312478	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_012913	AAAG	2	8	316673	316680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012913	ATGA	2	8	316814	316821	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012913	ATTT	2	8	320225	320232	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012913	TTGG	2	8	321447	321454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012913	GCTT	2	8	321814	321821	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_012913	CCGT	2	8	322840	322847	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_012913	CTTG	2	8	324878	324885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_012913	CTTT	2	8	325159	325166	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_012913	AAGT	2	8	331715	331722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012913	TTAT	2	8	331774	331781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012913	TAAA	2	8	331782	331789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012913	CCAA	2	8	336014	336021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012913	TTAT	2	8	342851	342858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012913	ATAA	2	8	360291	360298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012913	TTTG	2	8	360318	360325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012913	TTAA	2	8	360420	360427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012913	ATGA	2	8	362146	362153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012913	TTAT	2	8	362196	362203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012913	AACT	2	8	364224	364231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_012913	TTTA	2	8	365814	365821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012913	CAAG	2	8	373237	373244	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_012913	CAAG	2	8	383039	383046	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_012913	TAAA	2	8	391898	391905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012913	GAAA	2	8	393113	393120	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012913	ATTT	2	8	393222	393229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012913	CTTC	2	8	393588	393595	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_012913	TAAA	2	8	393875	393882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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