MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 1439

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011989	CCTG	2	8	20175	20182	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011989	AGGG	2	8	23938	23945	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011989	CCTG	2	8	26089	26096	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011989	TGCC	2	8	33411	33418	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011989	TTGC	2	8	34292	34299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011989	ATTG	2	8	36809	36816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011989	GCAG	2	8	39504	39511	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011989	TTCA	2	8	43823	43830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011989	ATGG	2	8	54087	54094	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011989	CGGG	2	8	54847	54854	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011989	CCTT	2	8	60108	60115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011989	AATT	2	8	61671	61678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011989	GAAC	2	8	61757	61764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011989	GTGA	2	8	62100	62107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011989	TCTT	2	8	63408	63415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011989	AGGA	2	8	64144	64151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011989	TCGT	2	8	64168	64175	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011989	GCGA	2	8	64925	64932	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011989	AGTT	2	8	65318	65325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011989	TCGA	2	8	65502	65509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011989	CGTC	2	8	65623	65630	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011989	AAAG	2	8	65746	65753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011989	GATT	2	8	66114	66121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011989	AACC	2	8	67303	67310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011989	ATCA	2	8	67800	67807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011989	AGGC	2	8	68177	68184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011989	ACGA	2	8	69954	69961	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011989	GGCA	2	8	75599	75606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011989	AAGC	2	8	75607	75614	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011989	TCGG	2	8	80403	80410	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011989	AAGC	2	8	80423	80430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011989	TCCC	2	8	80447	80454	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33	NC_011989	TTGA	2	8	84695	84702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011989	GGAT	2	8	92590	92597	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011989	TTCC	2	8	100272	100279	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011989	CCTC	2	8	103259	103266	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_011989	GGAA	2	8	104961	104968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011989	CCCG	2	8	105055	105062	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_011989	TGTC	2	8	114859	114866	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011989	TCAA	2	8	116857	116864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011989	GATT	2	8	116977	116984	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011989	GACG	2	8	123240	123247	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011989	GGCG	2	8	126106	126113	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011989	GGTT	2	8	126119	126126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011989	GGCA	2	8	126815	126822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011989	TTGG	2	8	126852	126859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011989	GTTC	2	8	127203	127210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011989	AGCA	2	8	127246	127253	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011989	TCTG	2	8	127380	127387	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011989	TGTC	2	8	129211	129218	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011989	CAGG	2	8	137734	137741	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011989	GATA	2	8	138512	138519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011989	TTGA	2	8	144285	144292	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011989	CCGA	2	8	154241	154248	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011989	CAGG	2	8	155141	155148	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011989	CTCG	2	8	157559	157566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011989	AAGG	2	8	162374	162381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011989	TGAA	2	8	162461	162468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011989	CTGT	2	8	165039	165046	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011989	ATTC	2	8	168840	168847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011989	CCAA	2	8	170327	170334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011989	TCCC	2	8	172424	172431	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_011989	TACT	2	8	172529	172536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011989	TTCG	2	8	172980	172987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011989	GACC	2	8	174413	174420	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011989	AAAT	2	8	180165	180172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011989	CGGT	2	8	180628	180635	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011989	TCGT	2	8	180940	180947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011989	ACAA	2	8	181181	181188	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011989	CATC	2	8	188249	188256	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011989	CGAG	2	8	189080	189087	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011989	ACAA	2	8	189963	189970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011989	AGGC	2	8	190053	190060	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011989	GCTC	2	8	198881	198888	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011989	CATG	2	8	212675	212682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011989	GGAT	2	8	214744	214751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011989	GACC	2	8	222164	222171	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011989	GAAG	2	8	222278	222285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011989	GATC	2	8	222293	222300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011989	AGGG	2	8	222380	222387	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011989	CGGG	2	8	222500	222507	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011989	CGGG	2	8	223212	223219	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011989	GGGC	2	8	223470	223477	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011989	GCTC	2	8	237974	237981	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011989	GCTT	2	8	242508	242515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011989	TCCT	2	8	248755	248762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011989	GATT	2	8	249033	249040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011989	ATCC	2	8	251304	251311	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011989	TTCC	2	8	255826	255833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011989	TCCA	2	8	259499	259506	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011989	GCAA	2	8	262143	262150	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011989	TGCC	2	8	262151	262158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011989	ATCG	2	8	270164	270171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011989	GTCT	2	8	273702	273709	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011989	CAGG	2	8	277784	277791	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011989	TCGT	2	8	277856	277863	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011989	GCGG	2	8	282818	282825	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011989	CTGC	2	8	283926	283933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011989	TGGA	2	8	284515	284522	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011989	ATCC	2	8	291176	291183	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011989	GAAT	2	8	292027	292034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011989	TGGC	2	8	294842	294849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011989	TAAT	2	8	296325	296332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011989	CGGA	2	8	298005	298012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011989	CAGC	2	8	298085	298092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011989	CAGC	2	8	301371	301378	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011989	ATTG	2	8	301436	301443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011989	GCCT	2	8	302786	302793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011989	CAGA	2	8	310317	310324	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011989	TTTG	2	8	316360	316367	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011989	CCGC	2	8	320460	320467	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
112	NC_011989	CCTT	2	8	323774	323781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011989	CAGA	2	8	324681	324688	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011989	GATC	2	8	335362	335369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011989	CTGG	2	8	342637	342644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011989	CTGG	2	8	350224	350231	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011989	GATT	2	8	350475	350482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011989	GGTC	2	8	350994	351001	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011989	GACA	2	8	361838	361845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011989	GCCT	2	8	366744	366751	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_011989	GCAG	2	8	376224	376231	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011989	TTGA	2	8	380736	380743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011989	GAGG	2	8	381153	381160	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011989	GCCT	2	8	383801	383808	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011989	TTGC	2	8	384710	384717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011989	GAGC	2	8	387011	387018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011989	CTGC	2	8	388753	388760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_011989	TTTG	2	8	391692	391699	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011989	AACC	2	8	394780	394787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011989	GCCA	2	8	398200	398207	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011989	GACG	2	8	400869	400876	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011989	TCCG	2	8	400925	400932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011989	TGGC	2	8	401944	401951	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011989	CTTG	2	8	403836	403843	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011989	TGCC	2	8	404647	404654	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011989	TGTC	2	8	406822	406829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011989	AGGT	2	8	406939	406946	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011989	TCAA	2	8	412129	412136	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011989	CTTT	2	8	412978	412985	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011989	TGGG	2	8	418508	418515	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011989	GAAT	2	8	418568	418575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011989	ACGG	2	8	418584	418591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011989	TTCG	2	8	419657	419664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011989	ATTG	2	8	422480	422487	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011989	TGAC	2	8	422724	422731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011989	CTGA	2	8	427118	427125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_011989	TCCT	2	8	428783	428790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_011989	ATGG	2	8	436506	436513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011989	CAAG	2	8	442096	442103	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_011989	GCCT	2	8	449291	449298	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_011989	TGGC	2	8	450165	450172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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447	NC_011989	CAGA	2	8	1116621	1116628	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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472	NC_011989	TCGG	2	8	1178265	1178272	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
473	NC_011989	CGGT	2	8	1178304	1178311	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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476	NC_011989	GCAT	2	8	1179821	1179828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
477	NC_011989	TTCG	2	8	1186311	1186318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
478	NC_011989	GCAG	2	8	1195969	1195976	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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489	NC_011989	GGCA	2	8	1210176	1210183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
490	NC_011989	GACC	2	8	1213944	1213951	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
491	NC_011989	TTGA	2	8	1214772	1214779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
492	NC_011989	AATA	2	8	1214898	1214905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_011989	TGGC	2	8	1217960	1217967	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
494	NC_011989	AAAC	2	8	1218022	1218029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
495	NC_011989	TGAA	2	8	1218299	1218306	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
496	NC_011989	CCCG	2	8	1223533	1223540	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
497	NC_011989	GATG	2	8	1223755	1223762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_011989	CAAA	2	8	1226659	1226666	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_011989	TACT	2	8	1230022	1230029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
500	NC_011989	AATT	2	8	1232262	1232269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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