MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 268

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011988	CG	3	6	9784	9789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011988	GC	3	6	11818	11823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011988	CA	3	6	23147	23152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011988	GC	3	6	23608	23613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011988	TC	3	6	33633	33638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011988	TC	3	6	35396	35401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011988	CT	3	6	35715	35720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011988	CA	3	6	36444	36449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011988	CG	3	6	36513	36518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011988	TA	3	6	38860	38865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011988	TC	3	6	54211	54216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011988	GA	3	6	55417	55422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011988	CT	3	6	57490	57495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011988	AT	3	6	58208	58213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011988	CA	3	6	58409	58414	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011988	AT	3	6	59850	59855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011988	GC	3	6	63594	63599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011988	CG	3	6	65654	65659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011988	GC	3	6	65713	65718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011988	GT	3	6	68995	69000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011988	GA	3	6	72303	72308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011988	CT	3	6	76479	76484	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011988	AT	3	6	78116	78121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011988	TA	3	6	78136	78141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011988	CT	3	6	87210	87215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011988	CA	3	6	89145	89150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011988	TG	3	6	102108	102113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011988	CT	3	6	108087	108092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011988	AG	3	6	111997	112002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011988	TC	3	6	126099	126104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011988	AT	3	6	136294	136299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011988	CT	4	8	139681	139688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011988	TC	4	8	152999	153006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011988	AT	3	6	156709	156714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011988	GA	3	6	167244	167249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011988	CT	3	6	180930	180935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011988	GC	3	6	190939	190944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011988	TC	3	6	193885	193890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011988	TC	3	6	195815	195820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011988	TC	3	6	200821	200826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011988	GC	3	6	201842	201847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011988	TC	3	6	204023	204028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011988	TA	3	6	207325	207330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011988	GA	3	6	207418	207423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011988	AG	3	6	213698	213703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011988	TG	3	6	215325	215330	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011988	TG	3	6	220064	220069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011988	GC	3	6	220235	220240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011988	TG	3	6	225222	225227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011988	AG	3	6	228010	228015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011988	AT	3	6	253420	253425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011988	CT	3	6	260537	260542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011988	AG	3	6	260598	260603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011988	CT	3	6	260705	260710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011988	CG	3	6	270238	270243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011988	CT	3	6	276641	276646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011988	AG	3	6	301399	301404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011988	AT	3	6	303211	303216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011988	GA	3	6	307265	307270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011988	GA	3	6	325409	325414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011988	TC	3	6	327918	327923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011988	CT	4	8	328057	328064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011988	GC	3	6	334919	334924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011988	GC	3	6	335042	335047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011988	CG	3	6	339669	339674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011988	CA	3	6	347906	347911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011988	AT	3	6	359463	359468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011988	GA	3	6	367517	367522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011988	GT	3	6	368956	368961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011988	GC	3	6	369030	369035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011988	GC	3	6	375327	375332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011988	AC	3	6	379041	379046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011988	GA	3	6	389049	389054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011988	GA	4	8	395316	395323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011988	GC	3	6	407323	407328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011988	CG	3	6	407380	407385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011988	GC	3	6	412880	412885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011988	CT	3	6	415259	415264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011988	GA	3	6	421226	421231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011988	CT	3	6	441208	441213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011988	GT	3	6	441402	441407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011988	TG	3	6	447012	447017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011988	CT	3	6	457763	457768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011988	TC	3	6	459179	459184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011988	GT	3	6	466057	466062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011988	TA	3	6	466174	466179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011988	CG	3	6	503967	503972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011988	TC	3	6	510062	510067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011988	GT	3	6	511099	511104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011988	GA	3	6	540544	540549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011988	TG	3	6	545143	545148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011988	GA	4	8	545175	545182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011988	TC	3	6	547404	547409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011988	GC	3	6	550957	550962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011988	TA	3	6	552223	552228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011988	TA	3	6	552237	552242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011988	TG	3	6	563700	563705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011988	AC	3	6	563777	563782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011988	CA	3	6	577336	577341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011988	TC	3	6	582086	582091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011988	GC	3	6	590762	590767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011988	CG	3	6	590787	590792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011988	TA	3	6	590999	591004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011988	GA	3	6	598550	598555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011988	GC	3	6	599221	599226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011988	CT	3	6	600260	600265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011988	CG	3	6	605976	605981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011988	GC	3	6	607119	607124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011988	GC	3	6	607195	607200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011988	GA	3	6	610118	610123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011988	AT	3	6	611443	611448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011988	AT	3	6	613115	613120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011988	TA	3	6	618834	618839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011988	AT	3	6	620416	620421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011988	CG	3	6	620437	620442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011988	AT	3	6	623751	623756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011988	GC	3	6	629779	629784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011988	AT	3	6	633543	633548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011988	GA	3	6	634691	634696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011988	AT	3	6	635543	635548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011988	CT	3	6	660261	660266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011988	GC	3	6	665069	665074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011988	TG	3	6	666154	666159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011988	CG	3	6	693203	693208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011988	GT	3	6	693305	693310	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011988	CT	3	6	693341	693346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011988	TG	3	6	695545	695550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011988	AT	4	8	699827	699834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011988	AT	4	8	731230	731237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011988	GC	4	8	747171	747178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011988	TG	3	6	747299	747304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011988	CG	3	6	747317	747322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011988	GC	4	8	748818	748825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011988	GC	3	6	748862	748867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011988	GA	3	6	752659	752664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011988	AT	3	6	752922	752927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011988	TC	3	6	758629	758634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_011988	AG	3	6	761987	761992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011988	GA	3	6	783290	783295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011988	CT	4	8	809394	809401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011988	GC	3	6	810416	810421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011988	GA	4	8	810427	810434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011988	AT	3	6	818563	818568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011988	GA	5	10	822331	822340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011988	GC	3	6	822388	822393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_011988	CG	3	6	822543	822548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_011988	GA	3	6	822632	822637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011988	TG	3	6	823601	823606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011988	GT	4	8	825644	825651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011988	AC	3	6	827809	827814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_011988	CG	3	6	838755	838760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_011988	GC	3	6	842000	842005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_011988	CA	3	6	842224	842229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_011988	GC	3	6	844074	844079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.