MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 2691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011988	ATT	2	6	818400	818405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_011988	T	6	6	818411	818416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_011988	ATAC	2	8	818423	818430	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_011988	GTC	2	6	818468	818473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_011988	AAT	2	6	818488	818493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_011988	GAT	2	6	818507	818512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_011988	AAT	2	6	818530	818535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_011988	T	6	6	818557	818562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_011988	AT	3	6	818563	818568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_011988	A	7	7	818623	818629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_011988	ATT	2	6	818665	818670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011988	GCAT	2	8	820554	820561	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_011988	ACC	2	6	820578	820583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1514	NC_011988	ATG	2	6	820601	820606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_011988	TGC	2	6	820617	820622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_011988	T	6	6	820625	820630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_011988	CAG	2	6	820637	820642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_011988	CAG	2	6	820658	820663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_011988	ATCG	2	8	820793	820800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_011988	CGC	2	6	820828	820833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1521	NC_011988	CGC	2	6	820850	820855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_011988	CTG	2	6	821430	821435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_011988	CAG	2	6	821535	821540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_011988	CGAC	2	8	822211	822218	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_011988	GGA	2	6	822327	822332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_011988	GA	5	10	822331	822340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_011988	TTAAA	2	10	822355	822364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011988	GC	3	6	822388	822393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_011988	ACG	2	6	822407	822412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_011988	TGA	2	6	822418	822423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011988	CG	3	6	822543	822548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_011988	TCT	2	6	822577	822582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_011988	GGC	2	6	822620	822625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_011988	GA	3	6	822632	822637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011988	TTGAT	2	10	822875	822884	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011988	GAT	2	6	822996	823001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_011988	TGC	2	6	823082	823087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_011988	AACC	2	8	823093	823100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_011988	TG	3	6	823601	823606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_011988	T	6	6	823607	823612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_011988	ACG	2	6	823660	823665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_011988	TCT	2	6	823796	823801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_011988	GGC	2	6	823820	823825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_011988	CGT	2	6	823863	823868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_011988	CTGAA	2	10	823908	823917	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1546	NC_011988	GT	4	8	825644	825651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_011988	ATT	2	6	826503	826508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_011988	CAT	2	6	827685	827690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_011988	TTC	2	6	827699	827704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_011988	GTT	2	6	827716	827721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011988	TGC	2	6	827736	827741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_011988	AC	3	6	827809	827814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_011988	GCA	2	6	827854	827859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_011988	TGG	2	6	827987	827992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_011988	CTC	2	6	828017	828022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_011988	GCT	2	6	828024	828029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_011988	GCC	3	9	828054	828062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_011988	GATG	2	8	828071	828078	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_011988	GACT	2	8	828114	828121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1560	NC_011988	TCA	3	9	828124	828132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_011988	GGA	2	6	828575	828580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_011988	T	6	6	829942	829947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_011988	T	6	6	829967	829972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_011988	TGAA	2	8	830021	830028	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011988	GCG	2	6	830051	830056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_011988	A	6	6	830099	830104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011988	GCT	2	6	830928	830933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_011988	T	6	6	830958	830963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011988	AGA	2	6	831819	831824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_011988	CTT	2	6	831841	831846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_011988	ATA	2	6	831847	831852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_011988	ACG	2	6	831862	831867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_011988	GAA	2	6	834645	834650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_011988	A	6	6	834724	834729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_011988	TAT	2	6	834767	834772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_011988	TTGAA	2	10	835541	835550	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_011988	TCG	2	6	836168	836173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_011988	TGA	2	6	836206	836211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_011988	GAC	2	6	836239	836244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_011988	CAGA	2	8	836296	836303	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_011988	TGT	2	6	836314	836319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_011988	TGAAA	2	10	836390	836399	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_011988	AAAAG	2	10	837938	837947	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_011988	GCCT	2	8	837961	837968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_011988	GCC	2	6	837999	838004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1586	NC_011988	CAA	2	6	838591	838596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_011988	CG	3	6	838755	838760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_011988	AAT	2	6	838815	838820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_011988	GGC	2	6	838826	838831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_011988	GAT	2	6	838882	838887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_011988	ATC	2	6	838902	838907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_011988	GGC	2	6	841908	841913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_011988	AGA	2	6	841929	841934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011988	GCT	2	6	841988	841993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_011988	GC	3	6	842000	842005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_011988	AAT	2	6	842019	842024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_011988	TAC	2	6	842033	842038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_011988	ATG	2	6	842068	842073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_011988	GTTT	2	8	842076	842083	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_011988	AGA	2	6	842104	842109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_011988	ACA	2	6	842129	842134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_011988	ATG	2	6	842151	842156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_011988	TCG	2	6	842179	842184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_011988	CA	3	6	842224	842229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_011988	CAT	2	6	842255	842260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_011988	CAC	2	6	842329	842334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_011988	GCC	2	6	842351	842356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_011988	TGG	2	6	842361	842366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011988	GC	3	6	844074	844079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_011988	GCG	2	6	845954	845959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_011988	CAT	2	6	845960	845965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_011988	GC	3	6	845971	845976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_011988	AGCATG	2	12	846004	846015	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1614	NC_011988	AAC	2	6	846019	846024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_011988	TCGA	2	8	846124	846131	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1616	NC_011988	AC	3	6	846134	846139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_011988	A	6	6	846142	846147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_011988	ACGA	2	8	846190	846197	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_011988	GC	3	6	846203	846208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_011988	AAT	2	6	846249	846254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_011988	AGAC	2	8	846261	846268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_011988	CTG	2	6	848143	848148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_011988	ACTG	2	8	849678	849685	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_011988	CTT	2	6	850064	850069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_011988	TTA	2	6	851773	851778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_011988	CT	3	6	851803	851808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1627	NC_011988	GGC	2	6	851813	851818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_011988	GCC	2	6	851825	851830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_011988	TTG	2	6	851887	851892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_011988	GCAA	2	8	851913	851920	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_011988	TAT	2	6	852010	852015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_011988	TTCA	2	8	852051	852058	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_011988	T	8	8	852079	852086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_011988	CATT	2	8	852113	852120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_011988	GA	3	6	852202	852207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_011988	CGTT	2	8	852244	852251	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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