MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011987	GC	3	6	3614	3619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011987	AC	3	6	9198	9203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011987	CG	3	6	9951	9956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011987	CG	3	6	12901	12906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011987	GC	3	6	13683	13688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011987	AG	3	6	14017	14022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011987	GC	3	6	18560	18565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011987	GC	3	6	18718	18723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011987	AT	3	6	19585	19590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011987	CG	3	6	19711	19716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011987	CG	3	6	22124	22129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011987	AT	3	6	24151	24156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011987	GT	3	6	24665	24670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011987	AT	3	6	26595	26600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011987	GC	3	6	32081	32086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011987	AG	3	6	43187	43192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011987	TA	4	8	43305	43312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011987	TA	3	6	43318	43323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011987	TC	3	6	62826	62831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011987	GA	3	6	64045	64050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011987	GC	3	6	64236	64241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011987	TG	3	6	65508	65513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011987	TA	3	6	67343	67348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011987	GT	3	6	83004	83009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011987	CA	3	6	92970	92975	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011987	CA	3	6	93015	93020	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011987	AT	3	6	95059	95064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011987	GC	3	6	95402	95407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011987	AC	3	6	95585	95590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011987	GC	3	6	96489	96494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011987	GT	3	6	97595	97600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011987	TA	4	8	112296	112303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011987	TA	4	8	115562	115569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011987	CA	3	6	120698	120703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011987	TA	3	6	121787	121792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011987	AT	3	6	121801	121806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011987	AC	3	6	121834	121839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011987	TG	3	6	123085	123090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011987	TC	3	6	123216	123221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011987	GA	3	6	123890	123895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011987	CA	3	6	125584	125589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011987	TA	3	6	133907	133912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011987	AT	3	6	133927	133932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011987	AT	5	10	134010	134019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011987	CG	3	6	134061	134066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011987	TC	3	6	139024	139029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011987	GC	3	6	146394	146399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011987	TC	3	6	151997	152002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011987	AT	3	6	168867	168872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011987	CT	3	6	171100	171105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011987	GC	3	6	173469	173474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011987	AG	3	6	176835	176840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011987	CT	3	6	177735	177740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011987	GC	3	6	178099	178104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011987	GC	3	6	178179	178184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011987	TC	3	6	183129	183134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011987	GA	3	6	203424	203429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011987	AT	3	6	204564	204569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011987	CG	3	6	215917	215922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011987	TC	3	6	220654	220659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011987	AG	4	8	231371	231378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011987	GC	3	6	238988	238993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011987	GC	3	6	239028	239033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011987	AC	3	6	239102	239107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011987	GC	3	6	239257	239262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011987	CA	3	6	239898	239903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011987	CT	3	6	241699	241704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011987	GA	3	6	242003	242008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011987	TC	3	6	250691	250696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011987	GA	3	6	263109	263114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011987	CG	3	6	273609	273614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011987	CA	3	6	275197	275202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011987	CT	3	6	282551	282556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011987	CA	3	6	283654	283659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011987	TC	3	6	285550	285555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011987	TC	3	6	295579	295584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011987	CT	3	6	300631	300636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011987	GC	3	6	301053	301058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011987	GA	3	6	303046	303051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011987	TC	4	8	314009	314016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011987	AC	3	6	320113	320118	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011987	CG	3	6	323695	323700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011987	AT	3	6	340144	340149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011987	GT	3	6	341128	341133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011987	GC	3	6	341169	341174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011987	TC	3	6	356537	356542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011987	GC	3	6	356835	356840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011987	GC	4	8	358393	358400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011987	GT	3	6	358402	358407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011987	TC	3	6	365027	365032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011987	GA	3	6	382496	382501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011987	GA	3	6	382521	382526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011987	GA	3	6	388053	388058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.