MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 plasmid pAtK84c

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011987	CTCC	2	8	5576	5583	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_011987	CTAA	2	8	5619	5626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011987	GCGA	2	8	8367	8374	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011987	GTGG	2	8	8417	8424	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011987	GGGA	2	8	9143	9150	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011987	AAGC	2	8	9897	9904	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011987	ATTC	2	8	10883	10890	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011987	CGCC	2	8	12384	12391	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_011987	CAGC	2	8	12822	12829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011987	CCGG	2	8	13378	13385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011987	TGCC	2	8	13486	13493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011987	CACG	2	8	13557	13564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011987	GGCA	2	8	18879	18886	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011987	ATGA	2	8	19962	19969	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011987	CGTA	2	8	22491	22498	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011987	CCCG	2	8	22501	22508	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_011987	TGTC	2	8	24738	24745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011987	AAAT	2	8	26604	26611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011987	GATG	2	8	26679	26686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011987	TTGC	2	8	26755	26762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011987	TTCT	2	8	31815	31822	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011987	GACG	2	8	31829	31836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011987	ACCG	2	8	36924	36931	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011987	GCCG	2	8	39733	39740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011987	AGCG	2	8	43199	43206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011987	TTGA	2	8	59106	59113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011987	CTTT	2	8	62071	62078	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011987	GGGT	2	8	62200	62207	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011987	TTGG	2	8	62395	62402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011987	TCGA	2	8	64137	64144	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011987	ATTT	2	8	64332	64339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011987	ATGA	2	8	65362	65369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011987	TTGA	2	8	65529	65536	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011987	CCTC	2	8	65603	65610	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_011987	GGAA	2	8	65640	65647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011987	ACCT	2	8	65893	65900	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011987	TGCT	2	8	82183	82190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011987	CTGG	2	8	82213	82220	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011987	CGGC	2	8	82574	82581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011987	AGCG	2	8	82960	82967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011987	GCGA	2	8	83027	83034	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011987	ATTT	2	8	92917	92924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011987	AAAT	2	8	92989	92996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011987	TTGC	2	8	95135	95142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011987	GCAG	2	8	95357	95364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011987	CAAA	2	8	95663	95670	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011987	CTAT	2	8	97768	97775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011987	CCGG	2	8	103340	103347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011987	CCGG	2	8	103361	103368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011987	AAGC	2	8	103375	103382	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011987	TAAT	2	8	104508	104515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011987	ACCC	2	8	105716	105723	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_011987	GATC	2	8	113248	113255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011987	AGCG	2	8	115500	115507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011987	AGCC	2	8	122177	122184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011987	TATG	2	8	125756	125763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011987	ATCT	2	8	125824	125831	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011987	CAAA	2	8	127246	127253	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011987	ACCC	2	8	127254	127261	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_011987	TAGC	2	8	127320	127327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011987	CGGA	2	8	134084	134091	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011987	GCTG	2	8	136063	136070	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011987	TCGA	2	8	138456	138463	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011987	GATC	2	8	143050	143057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011987	GCCC	2	8	154372	154379	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_011987	TCGC	2	8	156824	156831	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011987	GACC	2	8	159369	159376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011987	TCTG	2	8	172285	172292	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011987	ACGA	2	8	176370	176377	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011987	CGCC	2	8	176547	176554	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_011987	CATC	2	8	176671	176678	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011987	GCTT	2	8	177925	177932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011987	GACC	2	8	183555	183562	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011987	TCGC	2	8	188377	188384	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011987	CCTT	2	8	190474	190481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011987	ATAA	2	8	196802	196809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011987	GGAT	2	8	196834	196841	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011987	CGCC	2	8	200210	200217	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_011987	GTCG	2	8	202893	202900	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011987	TCGT	2	8	204532	204539	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011987	TTGA	2	8	204545	204552	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011987	AGGA	2	8	204719	204726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011987	AGGA	2	8	205033	205040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011987	TGTC	2	8	207757	207764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011987	TTCT	2	8	208052	208059	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011987	CCGT	2	8	208082	208089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011987	GCTG	2	8	208355	208362	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011987	ATCT	2	8	208435	208442	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011987	TGCT	2	8	208864	208871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011987	GCAG	2	8	209115	209122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011987	TCGC	2	8	209345	209352	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011987	CGAT	2	8	209439	209446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011987	GCTG	2	8	210388	210395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011987	GGTC	2	8	210829	210836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011987	TCCG	2	8	210990	210997	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011987	TGGG	2	8	217194	217201	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011987	CTCA	2	8	218732	218739	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011987	TGAT	2	8	219423	219430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011987	TCGT	2	8	219611	219618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011987	GGAT	2	8	220081	220088	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011987	GACG	2	8	220167	220174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_011987	GATC	2	8	220259	220266	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011987	CCGT	2	8	220327	220334	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011987	CCGC	2	8	220501	220508	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_011987	TGGG	2	8	220621	220628	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011987	TCGA	2	8	224527	224534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011987	CTTG	2	8	225871	225878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011987	ATTT	2	8	225968	225975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011987	ACCA	2	8	225981	225988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011987	CGAG	2	8	227131	227138	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011987	GGAG	2	8	229787	229794	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011987	CTTT	2	8	232961	232968	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011987	GGTC	2	8	233006	233013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011987	GGGA	2	8	233738	233745	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011987	ACCA	2	8	236173	236180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011987	GGTC	2	8	237021	237028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011987	CCTG	2	8	239056	239063	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011987	GATC	2	8	239184	239191	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011987	GCTG	2	8	239236	239243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011987	AAGC	2	8	240044	240051	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011987	GAGG	2	8	241480	241487	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011987	GGCA	2	8	242138	242145	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011987	GGAG	2	8	242176	242183	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011987	AAAG	2	8	246496	246503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011987	AGTC	2	8	246603	246610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011987	TTGC	2	8	248651	248658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011987	TTCT	2	8	248672	248679	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011987	CGAT	2	8	250713	250720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011987	CCTC	2	8	254172	254179	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_011987	TAGC	2	8	270729	270736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011987	GGGA	2	8	284512	284519	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011987	GAGC	2	8	293680	293687	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011987	CTGG	2	8	294282	294289	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011987	CCGA	2	8	294478	294485	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011987	ATCG	2	8	300916	300923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011987	TGCC	2	8	318926	318933	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011987	GGTC	2	8	323682	323689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011987	CTCG	2	8	334704	334711	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_011987	GGGC	2	8	336124	336131	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011987	CCGA	2	8	338060	338067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011987	GTTT	2	8	340279	340286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011987	CTTC	2	8	341671	341678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011987	AGCA	2	8	341824	341831	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011987	CTAA	2	8	344094	344101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011987	GCCA	2	8	344114	344121	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_011987	TTCC	2	8	345771	345778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_011987	CGAC	2	8	352132	352139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_011987	GCCC	2	8	352364	352371	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_011987	CGGA	2	8	352396	352403	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_011987	TGCG	2	8	356748	356755	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011987	CCTG	2	8	365037	365044	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_011987	TGAG	2	8	373142	373149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011987	CGGT	2	8	374407	374414	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_011987	TCTT	2	8	377807	377814	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_011987	CAAT	2	8	381720	381727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_011987	ATGG	2	8	381772	381779	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011987	CGGC	2	8	383309	383316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_011987	GCAT	2	8	383323	383330	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_011987	CGGA	2	8	383363	383370	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_011987	AACA	2	8	385797	385804	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_011987	TCAT	2	8	387242	387249	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_011987	GTTC	2	8	387267	387274	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_011987	AATA	2	8	387376	387383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011987	CAAC	2	8	387422	387429	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.