MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4a

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011986	AGGG	2	8	27233	27240	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011986	CACC	2	8	27316	27323	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_011986	ACTG	2	8	27548	27555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011986	AGTA	2	8	29347	29354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011986	CAAA	2	8	33425	33432	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011986	TTGA	2	8	33438	33445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011986	TTCG	2	8	33728	33735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011986	GTTT	2	8	36122	36129	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011986	TGGT	2	8	39598	39605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011986	CGAA	2	8	43280	43287	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011986	GGCA	2	8	46961	46968	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011986	TTCC	2	8	48569	48576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011986	GGAT	2	8	51519	51526	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011986	TCGG	2	8	57757	57764	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011986	CGGG	2	8	59824	59831	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011986	CGGA	2	8	62900	62907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011986	CCCT	2	8	63087	63094	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_011986	CCGG	2	8	67690	67697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011986	GGCG	2	8	68418	68425	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011986	GGCT	2	8	68486	68493	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011986	GATC	2	8	69186	69193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011986	ATAC	2	8	69259	69266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011986	CCGG	2	8	72107	72114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011986	GTTT	2	8	75526	75533	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011986	GCTG	2	8	75692	75699	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011986	CAAC	2	8	77850	77857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.