MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011981	TC	3	6	2367	2372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011981	GT	3	6	5282	5287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011981	AG	3	6	5588	5593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011981	GC	3	6	5647	5652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011981	AT	3	6	9209	9214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011981	CG	3	6	9906	9911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011981	GC	3	6	10170	10175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011981	AG	3	6	11098	11103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011981	CT	3	6	13195	13200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011981	GC	3	6	24268	24273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011981	GA	3	6	24417	24422	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011981	AT	3	6	30233	30238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011981	CG	3	6	31764	31769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011981	AC	4	8	33496	33503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011981	GA	3	6	40573	40578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011981	CG	3	6	43328	43333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011981	GC	3	6	52217	52222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011981	AT	3	6	52990	52995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011981	CG	3	6	61904	61909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011981	AT	3	6	62223	62228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011981	CT	3	6	63371	63376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011981	GC	3	6	64841	64846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011981	GC	3	6	66374	66379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011981	TC	3	6	68844	68849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011981	AT	3	6	69143	69148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011981	CG	3	6	77630	77635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011981	CA	3	6	77638	77643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011981	AC	3	6	77644	77649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011981	CT	3	6	94130	94135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011981	GA	3	6	99670	99675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011981	GT	3	6	101850	101855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011981	TA	3	6	101914	101919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011981	GC	3	6	103388	103393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011981	GT	3	6	103519	103524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011981	TC	3	6	110018	110023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011981	GC	3	6	110190	110195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011981	GC	3	6	110254	110259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011981	CG	3	6	111778	111783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011981	TC	3	6	113908	113913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011981	GA	3	6	114352	114357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011981	GC	3	6	121045	121050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011981	GC	4	8	127868	127875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011981	AT	4	8	131541	131548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011981	GC	3	6	144328	144333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011981	AT	3	6	148899	148904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011981	AT	3	6	161530	161535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011981	AT	3	6	166710	166715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011981	GA	4	8	172833	172840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011981	GT	3	6	174168	174173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011981	GA	3	6	174311	174316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011981	AT	3	6	174422	174427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011981	GA	4	8	179067	179074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011981	AC	3	6	193358	193363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011981	GT	3	6	198739	198744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011981	CT	3	6	199092	199097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011981	AT	3	6	199412	199417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011981	AG	3	6	200093	200098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011981	GC	3	6	206938	206943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011981	CG	3	6	212094	212099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011981	TA	3	6	228848	228853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011981	GC	3	6	233315	233320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011981	TC	3	6	234069	234074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011981	TC	3	6	236447	236452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011981	GA	5	10	243769	243778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011981	CT	3	6	245897	245902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011981	GA	3	6	252288	252293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011981	CA	4	8	276076	276083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011981	TG	3	6	276089	276094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011981	GA	3	6	278656	278661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011981	GC	5	10	278737	278746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011981	CT	3	6	293317	293322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011981	TG	3	6	294470	294475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011981	CA	3	6	295414	295419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011981	TG	3	6	332050	332055	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011981	GC	3	6	332165	332170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011981	AG	3	6	342462	342467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011981	GC	3	6	347231	347236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011981	AG	3	6	347286	347291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011981	GA	3	6	354392	354397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011981	GC	3	6	359018	359023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011981	CT	3	6	359202	359207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011981	AT	4	8	364401	364408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011981	CA	3	6	366099	366104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011981	GA	4	8	377154	377161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011981	TG	3	6	377181	377186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011981	CA	3	6	377232	377237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011981	TA	4	8	377519	377526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011981	AT	3	6	382221	382226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011981	GA	3	6	382259	382264	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011981	GA	3	6	398255	398260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011981	GC	3	6	399394	399399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011981	TC	3	6	400515	400520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011981	GC	3	6	412186	412191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011981	TC	3	6	416287	416292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011981	TG	3	6	416311	416316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011981	GT	3	6	416546	416551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011981	CG	3	6	425788	425793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011981	CT	3	6	426094	426099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011981	TC	3	6	426684	426689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011981	CA	3	6	430643	430648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011981	AG	3	6	431628	431633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011981	GT	3	6	448464	448469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011981	GC	3	6	448505	448510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011981	CG	3	6	452523	452528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011981	GC	4	8	453852	453859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011981	AG	3	6	457150	457155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011981	AG	4	8	461670	461677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011981	GA	3	6	471987	471992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011981	CA	3	6	472193	472198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011981	CG	3	6	486456	486461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011981	GA	3	6	500545	500550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011981	CG	3	6	501275	501280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011981	AT	3	6	501286	501291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011981	CA	3	6	503014	503019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011981	GC	3	6	503083	503088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011981	AC	3	6	503116	503121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011981	TC	3	6	509869	509874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011981	GC	3	6	521868	521873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011981	AG	3	6	539637	539642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011981	CA	3	6	552505	552510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_011981	AC	3	6	559043	559048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011981	CA	3	6	571895	571900	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011981	TA	3	6	574914	574919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011981	AT	4	8	578774	578781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011981	AT	3	6	580607	580612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011981	AT	4	8	588981	588988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011981	AT	3	6	589001	589006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011981	GC	3	6	596157	596162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011981	CG	4	8	602205	602212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011981	AG	3	6	602229	602234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011981	CA	3	6	607323	607328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011981	CA	3	6	607650	607655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011981	AC	3	6	608341	608346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011981	CA	3	6	609902	609907	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011981	CT	3	6	611382	611387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011981	GA	3	6	613437	613442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011981	GC	3	6	613657	613662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_011981	GC	3	6	617268	617273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_011981	TG	3	6	626978	626983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011981	TA	3	6	628735	628740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011981	TG	3	6	628902	628907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011981	CA	3	6	631431	631436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011981	AG	3	6	631567	631572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.