MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011981	GCG	2	6	359634	359639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_011981	CAT	2	6	359668	359673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_011981	ATG	2	6	359782	359787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011981	GCT	2	6	359906	359911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011981	ACC	2	6	364001	364006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_011981	ACC	2	6	364012	364017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_011981	GTT	2	6	364364	364369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011981	ACC	2	6	365558	365563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_011981	GGT	2	6	365581	365586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011981	CGC	2	6	365653	365658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_011981	TAA	2	6	365743	365748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011981	TGC	2	6	365779	365784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_011981	CAT	2	6	365897	365902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_011981	CAA	2	6	367584	367589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_011981	TTC	2	6	368436	368441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_011981	CGA	2	6	368447	368452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_011981	GCG	2	6	369962	369967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_011981	CGA	2	6	371018	371023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_011981	CAC	2	6	371028	371033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_011981	TGG	2	6	373226	373231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011981	GTT	2	6	373386	373391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011981	CAT	2	6	373427	373432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_011981	TCA	2	6	375001	375006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_011981	CCT	2	6	375059	375064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_011981	CGC	2	6	375272	375277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_011981	GCG	2	6	375346	375351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_011981	TCG	2	6	375353	375358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_011981	GAG	2	6	375389	375394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011981	GGC	2	6	376336	376341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_011981	ATC	2	6	377063	377068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_011981	TTC	2	6	377146	377151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_011981	GCC	2	6	377162	377167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_011981	ACG	2	6	377556	377561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011981	AAT	2	6	379658	379663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011981	TGA	2	6	379736	379741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011981	GGA	2	6	379808	379813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011981	CCT	2	6	382214	382219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_011981	GCT	2	6	382238	382243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011981	TCG	2	6	382272	382277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_011981	CCG	2	6	382287	382292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_011981	GAC	2	6	382293	382298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011981	TGC	2	6	382326	382331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011981	TCC	2	6	383242	383247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_011981	AAG	2	6	385390	385395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011981	GGT	2	6	385421	385426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011981	TGC	3	9	385474	385482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_011981	TGA	2	6	385667	385672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011981	TCG	2	6	385696	385701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011981	AGC	2	6	385758	385763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011981	AGG	3	9	385830	385838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011981	CCG	2	6	387804	387809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_011981	GCG	2	6	387819	387824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_011981	CTC	2	6	387908	387913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_011981	GCG	2	6	387972	387977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011981	CAG	2	6	388022	388027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_011981	TGT	2	6	388102	388107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011981	GCC	2	6	388172	388177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_011981	TTG	2	6	389604	389609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011981	ATC	2	6	389634	389639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_011981	GCC	2	6	389737	389742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_011981	CAG	2	6	390944	390949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_011981	GTC	2	6	390951	390956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_011981	ATG	2	6	391010	391015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011981	CCT	2	6	394859	394864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_011981	TAT	2	6	394886	394891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011981	AAG	2	6	395035	395040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011981	TGC	3	9	398093	398101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_011981	CGG	2	6	398133	398138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_011981	ATC	2	6	399496	399501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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571	NC_011981	CTG	2	6	403053	403058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_011981	TCC	2	6	406888	406893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_011981	TCG	2	6	406954	406959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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575	NC_011981	ATC	2	6	407006	407011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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582	NC_011981	ATG	2	6	412690	412695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011981	ATT	2	6	412711	412716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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589	NC_011981	ATA	2	6	416271	416276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011981	TGA	2	6	416328	416333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_011981	GTC	2	6	425299	425304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_011981	GAC	2	6	425365	425370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_011981	AGC	2	6	425693	425698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_011981	ATC	2	6	425892	425897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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609	NC_011981	GAT	2	6	426559	426564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_011981	TCA	2	6	426747	426752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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613	NC_011981	ACG	2	6	426829	426834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_011981	CGG	2	6	426870	426875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_011981	AGC	2	6	426947	426952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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620	NC_011981	TGG	2	6	427578	427583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011981	CCT	2	6	427681	427686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_011981	TGG	2	6	427687	427692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011981	GAT	2	6	430552	430557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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898	NC_011981	GTT	2	6	626958	626963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
899	NC_011981	ATC	2	6	627029	627034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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901	NC_011981	TCC	2	6	628937	628942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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