MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter chlorophenolicus A6 chromosome

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011886	CCGGGG	2	12	121	132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011886	GCCACC	2	12	3324	3335	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_011886	CGGCCT	2	12	51088	51099	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011886	GCCGGT	2	12	61094	61105	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011886	GGCGGT	2	12	63205	63216	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011886	AGGCCT	2	12	72329	72340	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011886	AGCGCC	2	12	115303	115314	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011886	CCGGGC	2	12	116542	116553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011886	ACGAAC	2	12	140644	140655	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011886	ACCGTC	2	12	171591	171602	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011886	CAGGCC	2	12	180849	180860	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011886	GCCGAC	2	12	188105	188116	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011886	CGTCCC	2	12	206302	206313	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_011886	ACCGGC	2	12	327119	327130	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011886	GCGCCT	2	12	356771	356782	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011886	CCGAAG	2	12	365312	365323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011886	GGGAAA	2	12	365358	365369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011886	GCCGAA	2	12	368878	368889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011886	CGGCGA	2	12	369018	369029	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011886	CCGCGC	2	12	393438	393449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011886	CAGCCT	2	12	465761	465772	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011886	CCAAGA	2	12	471589	471600	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011886	CCCGGA	2	12	640714	640725	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011886	GCCTGC	2	12	641930	641941	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011886	GTCAAG	2	12	685740	685751	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011886	CCGGCG	2	12	731720	731731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011886	TCCTTG	2	12	762477	762488	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011886	GCGCCG	2	12	764172	764183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011886	GCCCTG	2	12	813884	813895	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011886	ATACTT	2	12	829224	829235	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011886	CCGCGC	2	12	833934	833945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_011886	CACCAG	2	12	847417	847428	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011886	GACGTG	2	12	856474	856485	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011886	CGCTGG	2	12	928476	928487	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011886	TGTTTT	2	12	942429	942440	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011886	GGGTGT	2	12	944846	944857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011886	ATGCGG	2	12	998640	998651	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011886	GAGCCG	2	12	1001077	1001088	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011886	ATCCGA	2	12	1003416	1003427	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011886	GCGGCC	2	12	1024199	1024210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011886	GCACCA	2	12	1027300	1027311	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011886	CGCGTT	2	12	1051977	1051988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011886	CCGGGC	2	12	1093395	1093406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011886	CCGGGT	2	12	1122477	1122488	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011886	TGTTTT	2	12	1153664	1153675	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011886	GGGTGT	2	12	1156081	1156092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011886	TCCGGC	2	12	1163309	1163320	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011886	GCCGTT	8	48	1198394	1198441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011886	GGTCGT	2	12	1210842	1210853	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011886	GCACAG	2	12	1244457	1244468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011886	CGTGTC	2	12	1254213	1254224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011886	CGGCAT	2	12	1257651	1257662	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011886	GGGGAT	2	12	1272737	1272748	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011886	CGGAAA	2	12	1297536	1297547	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_011886	CCTGAA	2	12	1544349	1544360	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011886	CTGTGC	2	12	1544381	1544392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011886	CCGCAG	2	12	1598138	1598149	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011886	CGGGCC	2	12	1607259	1607270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011886	CGTCGG	2	12	1613106	1613117	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011886	GTCGGC	2	12	1653756	1653767	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011886	CTTCCC	2	12	1669414	1669425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_011886	TGTTTT	2	12	1686654	1686665	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011886	CGGAAG	2	12	1749123	1749134	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011886	AAGGTT	2	12	1763389	1763400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011886	GCCACC	2	12	1841975	1841986	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011886	GACTTC	2	12	1843013	1843024	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011886	AGCCGG	2	12	1843278	1843289	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011886	GGTTCG	2	12	1843646	1843657	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011886	AACCGC	2	12	1843885	1843896	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011886	GGCGTC	2	12	1881778	1881789	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011886	CAGTGG	2	12	1903254	1903265	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011886	TCCTTC	2	12	1910997	1911008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_011886	CGCCAT	2	12	1984609	1984620	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011886	CGGACC	2	12	1990194	1990205	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011886	GACACG	2	12	2021627	2021638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011886	ACCCCC	2	12	2154979	2154990	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
77	NC_011886	CCCATG	2	12	2159224	2159235	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011886	CAGCCG	2	12	2205400	2205411	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011886	AACGGC	2	12	2214993	2215004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011886	GCCGGC	2	12	2252906	2252917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011886	CCGGTT	2	12	2285239	2285250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011886	GCCCCC	2	12	2301836	2301847	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
83	NC_011886	AACCCG	2	12	2323754	2323765	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011886	CCAGGT	2	12	2333535	2333546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011886	ATCCTC	2	12	2333695	2333706	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011886	CGCCTG	2	12	2334303	2334314	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011886	CCAGCA	2	12	2341251	2341262	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011886	GCTTCG	2	12	2341499	2341510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011886	GCGGGG	2	12	2345046	2345057	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_011886	CATCGT	2	12	2346121	2346132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011886	CGGACG	2	12	2347192	2347203	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011886	GCGTCA	2	12	2352513	2352524	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011886	AGGCCG	2	12	2372447	2372458	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011886	TGTCCC	2	12	2383237	2383248	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011886	GGTGAC	2	12	2430443	2430454	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_011886	AGCCGG	2	12	2435125	2435136	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011886	CCTGCA	2	12	2445656	2445667	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011886	CTCACC	2	12	2459463	2459474	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_011886	TGCCGT	2	12	2463730	2463741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011886	CCGGCG	2	12	2464093	2464104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011886	GCAGGC	2	12	2466780	2466791	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011886	AGACGG	2	12	2481316	2481327	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_011886	TGGCGT	2	12	2486025	2486036	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_011886	GTGCAG	2	12	2486193	2486204	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_011886	GCTGGT	2	12	2490569	2490580	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_011886	TCGCCT	2	12	2493729	2493740	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011886	CCCGGG	2	12	2619456	2619467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011886	CCGGCA	2	12	2670474	2670485	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011886	GCCTCC	2	12	2675298	2675309	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_011886	GGCCCC	2	12	2694953	2694964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011886	GCCAGC	2	12	2726357	2726368	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011886	CCGGTG	2	12	2803517	2803528	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011886	GCCTCC	2	12	2861259	2861270	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011886	CTTGAG	2	12	2958468	2958479	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_011886	ACTAAT	2	12	3013987	3013998	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_011886	CCGGCC	2	12	3014055	3014066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_011886	CTAAAA	2	12	3029042	3029053	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_011886	CCCGGA	2	12	3038206	3038217	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011886	CCGCCC	2	12	3047985	3047996	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
120	NC_011886	CCCGGC	2	12	3173169	3173180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_011886	AAACCA	2	12	3173483	3173494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011886	CGTTGG	2	12	3208728	3208739	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_011886	TCCGCC	2	12	3221308	3221319	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011886	TCGACC	2	12	3221358	3221369	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011886	CGGAAA	2	12	3281853	3281864	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_011886	GCCGCG	2	12	3294871	3294882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011886	AGATTG	2	12	3303153	3303164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011886	CAGGGA	2	12	3317329	3317340	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_011886	GGGGTG	2	12	3330842	3330853	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011886	CCGCGA	2	12	3348757	3348768	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011886	GCGTGT	2	12	3374658	3374669	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_011886	CTGCCG	2	12	3387373	3387384	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011886	CCTGCG	2	12	3422949	3422960	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011886	CGCGGG	2	12	3440387	3440398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011886	CGGACC	2	12	3567217	3567228	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011886	CCGGCG	2	12	3610893	3610904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_011886	TCCCGC	2	12	3652097	3652108	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_011886	GCGCCG	2	12	3672651	3672662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_011886	GCCGGC	2	12	3772500	3772511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011886	CACCCG	2	12	3802846	3802857	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_011886	GTGGCC	2	12	3830680	3830691	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011886	GTGCGG	2	12	3852056	3852067	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_011886	CGGCAT	2	12	3929140	3929151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011886	CAGCCT	2	12	3947004	3947015	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
145	NC_011886	CCAGCA	2	12	4015760	4015771	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
146	NC_011886	AGCCGG	2	12	4081410	4081421	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011886	CCGGCC	2	12	4139608	4139619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_011886	CACACC	2	12	4142843	4142854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_011886	AAAACA	2	12	4145256	4145267	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_011886	CACACC	2	12	4153423	4153434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_011886	AAAACA	2	12	4155836	4155847	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_011886	GGCCGG	2	12	4246959	4246970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_011886	TGCCCC	2	12	4267896	4267907	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_011886	TTGGCG	2	12	4322011	4322022	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_011886	AACCGG	2	12	4358618	4358629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.