MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Arthrobacter chlorophenolicus A6 plasmid pACHL01

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011879	AATGA	2	10	1485	1494	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011879	AGTAG	2	10	8310	8319	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011879	GAACG	2	10	24651	24660	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011879	GCATG	2	10	29260	29269	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011879	AGCGC	2	10	29375	29384	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011879	CCGGG	2	10	32498	32507	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_011879	CCGGT	2	10	33201	33210	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_011879	GGCGC	2	10	40460	40469	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_011879	GCCGG	2	10	65290	65299	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011879	CGGAC	2	10	67138	67147	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011879	CCTGA	2	10	72070	72079	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011879	CGAGC	2	10	111096	111105	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_011879	GGTCC	2	10	125069	125078	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011879	TGACA	2	10	126791	126800	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011879	TCACT	2	10	127973	127982	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011879	CGGAG	2	10	131282	131291	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011879	AGTAG	2	10	131703	131712	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011879	GAGAC	2	10	139053	139062	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011879	GGGCA	2	10	141451	141460	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011879	GACAG	2	10	144924	144933	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011879	GGCCG	2	10	146980	146989	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_011879	CCCTG	2	10	161908	161917	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_011879	TGCCG	2	10	163756	163765	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_011879	GTTGA	2	10	163808	163817	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011879	AAGAG	2	10	164691	164700	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011879	CAGGC	2	10	172076	172085	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011879	TGGCT	2	10	184400	184409	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011879	GCCGG	2	10	193295	193304	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011879	GTCTG	2	10	193539	193548	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011879	CGGAG	2	10	201510	201519	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011879	GGCGG	2	10	214643	214652	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
32	NC_011879	CGTCG	2	10	219799	219808	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_011879	CTACC	2	10	222463	222472	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
34	NC_011879	CTTTC	2	10	245419	245428	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011879	CGGCG	2	10	250657	250666	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011879	CTTTC	2	10	253770	253779	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011879	GATCA	2	10	261840	261849	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011879	GGCCG	2	10	266133	266142	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_011879	CGGAA	2	10	276778	276787	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011879	CCGGG	2	10	293861	293870	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011879	TTTGC	2	10	334943	334952	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011879	AGTAG	2	10	335406	335415	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011879	CCGAA	2	10	394511	394520	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011879	CCCTG	2	10	412092	412101	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_011879	CGCCT	2	10	413610	413619	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_011879	GCGCC	2	10	416734	416743	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_011879	TGTCC	2	10	416840	416849	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_011879	GACCG	2	10	426714	426723	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.