MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 801

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011761	CGAG	2	8	31126	31133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011761	GAGC	2	8	31425	31432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011761	TCCA	2	8	40033	40040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011761	GCGG	2	8	41075	41082	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011761	GAAT	2	8	45508	45515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011761	AGGG	2	8	48838	48845	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011761	TCCC	2	8	48849	48856	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_011761	TCAG	2	8	48861	48868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011761	CGTG	2	8	50739	50746	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011761	CTTT	2	8	57222	57229	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011761	ATCA	2	8	57232	57239	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011761	TAAT	2	8	57270	57277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011761	GGCG	2	8	60212	60219	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011761	GCCT	2	8	62902	62909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011761	ACGG	2	8	64059	64066	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011761	CCAC	2	8	74753	74760	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_011761	CTGG	2	8	82526	82533	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011761	CTGC	2	8	83937	83944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011761	GTTC	2	8	84403	84410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011761	TCAG	2	8	88077	88084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011761	GCCC	2	8	88163	88170	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_011761	ATCG	2	8	88379	88386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011761	GCGT	2	8	88390	88397	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011761	TCCA	2	8	88425	88432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011761	CGGA	2	8	99975	99982	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011761	CATC	2	8	100138	100145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011761	TGAG	2	8	103080	103087	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011761	GGCG	2	8	103913	103920	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011761	CGGC	2	8	104364	104371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011761	ATTT	2	8	104458	104465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011761	TTCA	2	8	105262	105269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011761	GAGG	2	8	108289	108296	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011761	CAGC	2	8	109941	109948	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011761	CTTG	2	8	110225	110232	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011761	AAGC	2	8	110248	110255	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011761	GTTT	2	8	110359	110366	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011761	ATTC	2	8	111456	111463	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011761	GGTA	2	8	120978	120985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011761	ATGG	2	8	123560	123567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011761	TTCG	2	8	125005	125012	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011761	AATA	2	8	132634	132641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011761	GGCG	2	8	132666	132673	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011761	CATC	2	8	136805	136812	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011761	GCTG	3	12	142873	142884	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011761	GATT	2	8	151546	151553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011761	ACGC	2	8	162232	162239	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011761	GGTC	2	8	174559	174566	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011761	AGGC	2	8	175686	175693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011761	TGGG	2	8	206364	206371	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011761	TGCA	2	8	207478	207485	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011761	TGTC	2	8	207506	207513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011761	CCCT	2	8	220790	220797	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_011761	GCGT	2	8	224417	224424	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011761	TTTC	2	8	230068	230075	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011761	GGCC	2	8	234665	234672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011761	GGAA	2	8	242450	242457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011761	TAAC	2	8	243990	243997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011761	TGGC	2	8	274110	274117	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011761	TCTT	2	8	275337	275344	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011761	GGAT	2	8	284091	284098	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011761	CCCG	2	8	306777	306784	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_011761	CCTG	2	8	306835	306842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011761	AATC	2	8	311303	311310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011761	CAGC	2	8	316460	316467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011761	TCCC	2	8	324746	324753	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_011761	TTTC	2	8	324840	324847	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011761	GTGG	2	8	325391	325398	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011761	CCCG	2	8	325599	325606	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_011761	GGTC	2	8	327129	327136	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011761	AAGC	2	8	335278	335285	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011761	CCAG	2	8	335316	335323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011761	ACTT	2	8	335774	335781	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011761	CAGA	2	8	336125	336132	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011761	CGTC	2	8	336146	336153	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011761	AAAG	2	8	336269	336276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011761	AGTG	2	8	336729	336736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011761	AGTG	2	8	337492	337499	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011761	GACA	2	8	337527	337534	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011761	GAAG	2	8	337812	337819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011761	ATGT	2	8	340399	340406	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011761	CTCC	2	8	364673	364680	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_011761	CCGA	2	8	366374	366381	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011761	GTGC	2	8	408911	408918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011761	CTGC	2	8	408974	408981	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011761	TGCG	2	8	419256	419263	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011761	GCAG	2	8	432076	432083	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011761	CAGC	2	8	433820	433827	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011761	GCTG	2	8	433839	433846	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011761	GCTT	2	8	434534	434541	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011761	TGAT	2	8	434743	434750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011761	GACC	2	8	434873	434880	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011761	CTGG	2	8	434887	434894	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011761	GCGG	2	8	435056	435063	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011761	GGCA	2	8	439008	439015	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011761	CAGG	2	8	444404	444411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011761	CCAT	2	8	445316	445323	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011761	CCCG	2	8	445891	445898	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_011761	ATCC	2	8	446419	446426	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011761	TCTG	2	8	446830	446837	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011761	CCTT	2	8	447039	447046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011761	TTAA	2	8	447053	447060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011761	TCTA	2	8	447074	447081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011761	GCAG	2	8	447115	447122	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011761	TTTC	2	8	447602	447609	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011761	TCCA	2	8	448457	448464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011761	AGCG	2	8	449295	449302	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011761	GCCT	2	8	453395	453402	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011761	GCGG	2	8	453466	453473	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011761	TTTG	2	8	453508	453515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011761	GATT	2	8	462132	462139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011761	GGAC	2	8	462682	462689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011761	CCGG	2	8	466173	466180	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011761	TGGA	2	8	477396	477403	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011761	AAAG	2	8	477435	477442	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011761	GCCC	2	8	477457	477464	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_011761	TTTC	2	8	477564	477571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011761	CTCC	2	8	483557	483564	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_011761	GGGC	2	8	489891	489898	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011761	GCCC	2	8	497185	497192	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_011761	TTTC	2	8	497193	497200	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011761	GGGC	2	8	518800	518807	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011761	CAAA	2	8	525892	525899	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011761	GGTC	2	8	526047	526054	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011761	ATGG	2	8	528242	528249	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011761	GGAT	2	8	528315	528322	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011761	GGTG	2	8	532497	532504	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011761	AGCG	2	8	535425	535432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011761	GACC	2	8	535575	535582	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011761	GCCT	2	8	541136	541143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011761	TCTT	2	8	545347	545354	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011761	CTCC	2	8	560023	560030	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_011761	AACC	2	8	561805	561812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011761	GCAC	2	8	561884	561891	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011761	TGCA	2	8	562130	562137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011761	GCCC	2	8	567393	567400	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_011761	CGGG	2	8	575261	575268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011761	GCAT	2	8	583297	583304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011761	CCAT	2	8	587940	587947	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_011761	ACTG	2	8	588102	588109	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011761	CGCC	2	8	589838	589845	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_011761	CAGT	2	8	592430	592437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011761	TCCG	2	8	598843	598850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011761	CCGC	2	8	604019	604026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_011761	CCGG	2	8	617708	617715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_011761	TGGG	2	8	617876	617883	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011761	ACCA	2	8	622148	622155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_011761	CCGA	2	8	625295	625302	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_011761	CTTT	2	8	629862	629869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011761	CCAA	2	8	670745	670752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_011761	GAAT	2	8	696617	696624	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011761	GGAC	2	8	712804	712811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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484	NC_011761	ACCG	2	8	1960060	1960067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
485	NC_011761	GAAA	2	8	1973771	1973778	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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