MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 6068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011761	GAG	2	6	556815	556820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_011761	CTCC	2	8	560023	560030	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1003	NC_011761	CAG	2	6	561472	561477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_011761	CCG	2	6	561496	561501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_011761	GGA	2	6	561539	561544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_011761	CAT	2	6	561571	561576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_011761	AGG	2	6	561592	561597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_011761	T	6	6	561654	561659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_011761	TAA	2	6	561753	561758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_011761	AACC	2	8	561805	561812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_011761	TAA	2	6	561845	561850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_011761	GCAC	2	8	561884	561891	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_011761	GTG	2	6	562025	562030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_011761	CTG	2	6	562052	562057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_011761	CGG	2	6	562089	562094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_011761	TGCA	2	8	562130	562137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_011761	ACA	2	6	563184	563189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_011761	GGT	2	6	565365	565370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_011761	GAG	2	6	565409	565414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_011761	CG	3	6	566410	566415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_011761	GCC	2	6	567383	567388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_011761	GCCC	2	8	567393	567400	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1023	NC_011761	CAA	2	6	574302	574307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_011761	A	7	7	574316	574322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_011761	CGG	2	6	574389	574394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_011761	TGG	2	6	574407	574412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_011761	CGGG	2	8	575261	575268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_011761	CGA	2	6	580876	580881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_011761	ATG	2	6	583233	583238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_011761	GTT	2	6	583267	583272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_011761	GCG	2	6	583273	583278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_011761	GCAT	2	8	583297	583304	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_011761	GGA	2	6	583320	583325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_011761	GA	3	6	587816	587821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011761	CT	4	8	587894	587901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_011761	CCAT	2	8	587940	587947	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_011761	TGT	2	6	587962	587967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_011761	ATC	2	6	587984	587989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_011761	AAG	2	6	588001	588006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_011761	ACTG	2	8	588102	588109	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_011761	CT	3	6	588115	588120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_011761	CCG	2	6	588464	588469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_011761	C	7	7	588474	588480	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1044	NC_011761	GAC	2	6	588519	588524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_011761	GCG	2	6	588561	588566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_011761	CTG	2	6	589830	589835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_011761	CGCC	2	8	589838	589845	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1048	NC_011761	CAGT	2	8	592430	592437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_011761	GGA	2	6	592496	592501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_011761	A	6	6	592501	592506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_011761	CGG	2	6	592509	592514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_011761	CGC	2	6	595322	595327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_011761	TCCG	2	8	598843	598850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_011761	AGCCA	2	10	598873	598882	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1055	NC_011761	G	6	6	600607	600612	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_011761	TAG	2	6	601385	601390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_011761	CCGC	2	8	604019	604026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1060	NC_011761	CTT	2	6	604035	604040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_011761	GCG	2	6	604595	604600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_011761	AT	3	6	604621	604626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_011761	GC	3	6	608106	608111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_011761	GC	3	6	609072	609077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_011761	GCC	2	6	609114	609119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_011761	CGG	2	6	609156	609161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_011761	AGC	2	6	609194	609199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_011761	CCCAG	2	10	615977	615986	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1069	NC_011761	CGC	2	6	616051	616056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_011761	AGC	2	6	616088	616093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_011761	TGA	2	6	616098	616103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_011761	CCGG	2	8	617708	617715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_011761	GCC	3	9	617720	617728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_011761	CGG	2	6	617842	617847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_011761	A	6	6	617851	617856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_011761	TGGG	2	8	617876	617883	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_011761	GCG	2	6	617916	617921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_011761	GTC	2	6	617923	617928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1081	NC_011761	GCA	2	6	622140	622145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1083	NC_011761	ACA	2	6	622177	622182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_011761	ATT	2	6	622223	622228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_011761	CTG	2	6	628318	628323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_011761	CTGCG	2	10	628343	628352	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1090	NC_011761	CAG	2	6	628359	628364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1092	NC_011761	TA	3	6	629900	629905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_011761	GTT	2	6	629910	629915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_011761	ATT	2	6	629926	629931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1096	NC_011761	ACG	2	6	629994	629999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_011761	GAG	2	6	630999	631004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_011761	AT	3	6	634181	634186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_011761	ATT	2	6	634190	634195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_011761	ACATT	2	10	634239	634248	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1101	NC_011761	AGG	2	6	635523	635528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_011761	AGG	2	6	640552	640557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_011761	G	6	6	643853	643858	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_011761	ATC	2	6	643880	643885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_011761	AGG	2	6	644723	644728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_011761	A	6	6	651041	651046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_011761	GTG	2	6	651077	651082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_011761	CAC	2	6	651092	651097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_011761	GCT	2	6	651134	651139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_011761	GCC	2	6	651195	651200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_011761	AGG	2	6	653046	653051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011761	GTC	2	6	659981	659986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1114	NC_011761	TTG	2	6	662098	662103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011761	TTG	2	6	663236	663241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_011761	GCGCC	2	10	663266	663275	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1117	NC_011761	TAC	2	6	669120	669125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_011761	GCC	2	6	670719	670724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_011761	CCAA	2	8	670745	670752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_011761	ATG	2	6	672329	672334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1122	NC_011761	CAC	2	6	672380	672385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_011761	A	6	6	672386	672391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_011761	GCG	2	6	675754	675759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_011761	GCG	2	6	679720	679725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_011761	T	6	6	679744	679749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_011761	GGC	2	6	679788	679793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_011761	CTC	2	6	680229	680234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_011761	ATC	2	6	680235	680240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_011761	TCA	2	6	680247	680252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_011761	ACA	2	6	683775	683780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_011761	T	6	6	685756	685761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_011761	CCGGG	2	10	688317	688326	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1134	NC_011761	CCG	2	6	688981	688986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1136	NC_011761	CAG	2	6	689096	689101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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