MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 chromosome

Total Repeats: 6068

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011761	GCT	2	6	2784070	2784075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_011761	CCCT	2	8	2784423	2784430	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5503	NC_011761	CAT	2	6	2784534	2784539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_011761	GCCT	2	8	2784552	2784559	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5505	NC_011761	GC	3	6	2787801	2787806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_011761	GGCA	2	8	2787848	2787855	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_011761	AGA	2	6	2788841	2788846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_011761	GAG	2	6	2788849	2788854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_011761	CAC	2	6	2788870	2788875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_011761	TCAT	2	8	2788996	2789003	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5511	NC_011761	GCA	2	6	2789021	2789026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_011761	CGCC	2	8	2789057	2789064	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5513	NC_011761	GCC	3	9	2789068	2789076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_011761	CGG	2	6	2791584	2791589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_011761	TTGC	2	8	2792012	2792019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5516	NC_011761	CAC	2	6	2792027	2792032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_011761	CGG	2	6	2792037	2792042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_011761	CT	3	6	2792052	2792057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_011761	TATC	2	8	2792292	2792299	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5520	NC_011761	TAA	3	9	2792318	2792326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_011761	TGG	2	6	2792406	2792411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_011761	CAGG	2	8	2792454	2792461	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5523	NC_011761	AG	3	6	2792499	2792504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_011761	AT	3	6	2792532	2792537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_011761	GAT	2	6	2792565	2792570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_011761	AGAT	2	8	2792595	2792602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_011761	A	6	6	2792622	2792627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_011761	TGG	2	6	2792638	2792643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_011761	CGAA	2	8	2794170	2794177	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5530	NC_011761	GAG	2	6	2794900	2794905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_011761	TGT	2	6	2796860	2796865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_011761	CG	3	6	2796935	2796940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_011761	CAA	2	6	2796982	2796987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_011761	GTGG	2	8	2797018	2797025	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_011761	ATG	2	6	2797041	2797046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_011761	TGC	2	6	2797070	2797075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_011761	GGC	2	6	2797134	2797139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_011761	TTTG	2	8	2797263	2797270	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_011761	GGTT	2	8	2797297	2797304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_011761	TTA	2	6	2797330	2797335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_011761	TCGC	2	8	2799261	2799268	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5542	NC_011761	AGCA	2	8	2799312	2799319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_011761	CTG	2	6	2799324	2799329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_011761	TGC	2	6	2799350	2799355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_011761	TGG	2	6	2800468	2800473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_011761	ATGGAA	2	12	2800502	2800513	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_011761	TGG	2	6	2800525	2800530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_011761	GGC	2	6	2801045	2801050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_011761	C	6	6	2801096	2801101	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5550	NC_011761	ATT	2	6	2801141	2801146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_011761	GGT	2	6	2801151	2801156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_011761	GGT	2	6	2801220	2801225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_011761	TGC	2	6	2801232	2801237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_011761	CGA	2	6	2801268	2801273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_011761	AC	3	6	2801275	2801280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5556	NC_011761	ATG	2	6	2801281	2801286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_011761	TAAT	2	8	2801342	2801349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_011761	C	6	6	2801396	2801401	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5559	NC_011761	GGC	2	6	2801418	2801423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_011761	GGA	2	6	2801656	2801661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_011761	GCCA	2	8	2801734	2801741	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5562	NC_011761	GGC	2	6	2801755	2801760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_011761	TCA	2	6	2801884	2801889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_011761	CGT	2	6	2801896	2801901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_011761	A	7	7	2801918	2801924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_011761	GCG	2	6	2802069	2802074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_011761	TG	3	6	2802078	2802083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_011761	TGG	2	6	2802098	2802103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_011761	GCT	2	6	2802156	2802161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_011761	GCCT	2	8	2802164	2802171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_011761	C	6	6	2802184	2802189	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5572	NC_011761	TAT	2	6	2802231	2802236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_011761	CGT	2	6	2802305	2802310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5574	NC_011761	CAT	2	6	2802339	2802344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_011761	ATGG	2	8	2802362	2802369	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_011761	AAT	2	6	2802374	2802379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_011761	CGG	2	6	2802408	2802413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_011761	GAT	2	6	2802435	2802440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_011761	GATTC	2	10	2802961	2802970	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5580	NC_011761	CAGG	2	8	2803021	2803028	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5581	NC_011761	A	6	6	2803032	2803037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_011761	TGT	2	6	2803072	2803077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_011761	TAA	2	6	2803163	2803168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_011761	AT	3	6	2803189	2803194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_011761	GT	3	6	2803233	2803238	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_011761	AT	3	6	2803299	2803304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_011761	TAG	2	6	2803316	2803321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_011761	TTA	2	6	2803328	2803333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_011761	TA	3	6	2803332	2803337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_011761	ATA	2	6	2803411	2803416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_011761	TAC	2	6	2803431	2803436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_011761	GAG	2	6	2803499	2803504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_011761	AT	3	6	2803510	2803515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_011761	CGC	2	6	2803925	2803930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_011761	CGGCG	2	10	2803933	2803942	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5596	NC_011761	CG	3	6	2803941	2803946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_011761	ACG	2	6	2804197	2804202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_011761	CAA	2	6	2804221	2804226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_011761	GAG	3	9	2805420	2805428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_011761	TGG	2	6	2805460	2805465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_011761	CGA	2	6	2805533	2805538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_011761	CGGA	2	8	2805545	2805552	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5603	NC_011761	CTG	2	6	2805582	2805587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_011761	GTC	2	6	2805609	2805614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_011761	TGCCC	2	10	2805617	2805626	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5606	NC_011761	TGG	2	6	2805640	2805645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_011761	CGA	2	6	2805713	2805718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_011761	TCC	2	6	2805850	2805855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5609	NC_011761	GAA	2	6	2805876	2805881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_011761	C	7	7	2805892	2805898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5611	NC_011761	GGC	2	6	2805906	2805911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_011761	AAC	2	6	2805937	2805942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_011761	CTC	2	6	2805975	2805980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5614	NC_011761	TTCC	2	8	2806075	2806082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_011761	ATGG	2	8	2806172	2806179	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_011761	GTG	2	6	2806564	2806569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_011761	ATC	2	6	2806608	2806613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_011761	GCC	2	6	2806651	2806656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5619	NC_011761	GCT	2	6	2806675	2806680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_011761	CTG	2	6	2807042	2807047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_011761	TCG	2	6	2807236	2807241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_011761	ATCA	2	8	2807245	2807252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5623	NC_011761	ATATA	2	10	2807274	2807283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_011761	TGC	2	6	2807378	2807383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_011761	ACT	2	6	2813866	2813871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_011761	GCAC	2	8	2813907	2813914	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5627	NC_011761	CGG	2	6	2813938	2813943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_011761	CTG	2	6	2813944	2813949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_011761	TTA	2	6	2815146	2815151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_011761	CAG	2	6	2817171	2817176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5631	NC_011761	CAG	2	6	2817206	2817211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5632	NC_011761	TTA	2	6	2817909	2817914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5633	NC_011761	ACCA	2	8	2817951	2817958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5634	NC_011761	TGA	2	6	2817998	2818003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5635	NC_011761	CGG	2	6	2818012	2818017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5636	NC_011761	TCC	2	6	2818098	2818103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5643	NC_011761	GTA	2	6	2819522	2819527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5644	NC_011761	CAT	2	6	2819539	2819544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5646	NC_011761	C	6	6	2819611	2819616	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5748	NC_011761	ATC	2	6	2844016	2844021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5750	NC_011761	CCA	2	6	2844054	2844059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5751	NC_011761	CT	3	6	2844582	2844587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5752	NC_011761	C	6	6	2844589	2844594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5753	NC_011761	ACC	2	6	2844618	2844623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5754	NC_011761	GCA	2	6	2844639	2844644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5755	NC_011761	TAA	2	6	2844993	2844998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5756	NC_011761	GTT	2	6	2846887	2846892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5757	NC_011761	GCCATG	2	12	2846910	2846921	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5759	NC_011761	A	7	7	2847483	2847489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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