MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Anoxybacillus flavithermus WK1 chromosome

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011567	GCGCAG	2	12	15653	15664	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011567	ATACTT	2	12	25167	25178	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011567	AGTCAA	2	12	88905	88916	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011567	TAAAAT	2	12	106794	106805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011567	GAAAAG	2	12	125960	125971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011567	AAAAGC	2	12	179701	179712	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011567	GCGCAG	2	12	218980	218991	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011567	ATGAAC	2	12	228524	228535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011567	TAAAAA	2	12	234507	234518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011567	TTATGA	2	12	291140	291151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011567	TTTTGT	2	12	293037	293048	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011567	TTTTAT	2	12	368794	368805	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011567	ATTTAA	2	12	408639	408650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011567	GAAAAA	2	12	463973	463984	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011567	TATTTT	2	12	474837	474848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011567	AGTAAA	2	12	561620	561631	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011567	CAAACA	2	12	594472	594483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011567	AAAAAG	2	12	598569	598580	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011567	ATGGAA	2	12	625523	625534	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011567	ATTTTT	2	12	644491	644502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011567	CTTTTT	2	12	737652	737663	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011567	TCAATA	2	12	807042	807053	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011567	TTCTAC	2	12	808298	808309	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011567	ATCTTC	2	12	818046	818057	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011567	AAGAAA	2	12	818770	818781	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011567	AAAGAT	2	12	849287	849298	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011567	TCGCGT	2	12	934683	934694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011567	ATATGC	2	12	958526	958537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011567	ACATTG	2	12	960768	960779	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011567	AATGAG	2	12	1000229	1000240	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011567	AATAGC	2	12	1021224	1021235	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_011567	GAAAAA	2	12	1050268	1050279	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011567	CTTTTT	2	12	1129922	1129933	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011567	CGCCAT	2	12	1129943	1129954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011567	TAAAAT	2	12	1182807	1182818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011567	TTGTGG	2	12	1184948	1184959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011567	TGTAAA	2	12	1186541	1186552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011567	CGAAGA	2	12	1193466	1193477	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011567	GAGAAA	2	12	1209801	1209812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011567	CTTATA	2	12	1213554	1213565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011567	TGTAAA	2	12	1216648	1216659	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011567	TTGTGG	2	12	1217817	1217828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011567	TCTACA	2	12	1222885	1222896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011567	GAAGGG	2	12	1223381	1223392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011567	GGATCA	2	12	1224391	1224402	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011567	TTTTAC	2	12	1228456	1228467	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011567	AATAAA	2	12	1235411	1235422	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011567	TAAATT	2	12	1272125	1272136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011567	CAAAAA	2	12	1272855	1272866	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011567	AATTTA	2	12	1273265	1273276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011567	ACGTAA	2	12	1293233	1293244	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011567	ATAAAA	2	12	1301329	1301340	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011567	TTCAAA	2	12	1301524	1301535	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011567	ATTTTG	2	12	1317038	1317049	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011567	AAATGA	2	12	1330088	1330099	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011567	TGAAAA	2	12	1343648	1343659	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011567	GATGGC	2	12	1360085	1360096	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011567	TGAAAA	2	12	1366829	1366840	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011567	GTGTTT	2	12	1376495	1376506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011567	GAACCA	2	12	1387337	1387348	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011567	GAAAAA	2	12	1403923	1403934	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011567	CCGTTT	2	12	1434671	1434682	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011567	TCTGCT	2	12	1436872	1436883	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011567	AAAATT	2	12	1439802	1439813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011567	TCCATT	2	12	1443721	1443732	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011567	ATTTTT	2	12	1443743	1443754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011567	TTCTCT	2	12	1445651	1445662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011567	AATGGA	2	12	1469122	1469133	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011567	AATGAT	2	12	1480354	1480365	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011567	GTTTTT	2	12	1486845	1486856	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011567	CCCACA	2	12	1496822	1496833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011567	CTCTTT	2	12	1556861	1556872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011567	AAACAA	2	12	1558634	1558645	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_011567	TGATTT	2	12	1593871	1593882	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011567	ATAAAT	2	12	1597559	1597570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011567	CAAAAA	2	12	1636442	1636453	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011567	CTTTTT	2	12	1639654	1639665	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_011567	ACAAAA	2	12	1641450	1641461	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_011567	TGACAA	2	12	1656196	1656207	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011567	AAAAGA	2	12	1744518	1744529	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011567	ATAGTG	2	12	1844963	1844974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011567	ACGATA	2	12	1855486	1855497	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_011567	ATTTTT	2	12	1915763	1915774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011567	TCTTAT	2	12	1945422	1945433	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011567	CTTTTT	2	12	1950534	1950545	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011567	TTTTAT	2	12	2008620	2008631	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011567	AATCTC	2	12	2033617	2033628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011567	CTTTGA	2	12	2119906	2119917	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_011567	ATAAAA	2	12	2129653	2129664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011567	TTTTTA	2	12	2186359	2186370	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011567	GAAAAA	2	12	2186414	2186425	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011567	AGTGAA	2	12	2193468	2193479	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011567	GAATTA	2	12	2240451	2240462	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011567	TTCAAT	2	12	2243805	2243816	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_011567	CCCCTT	2	12	2254209	2254220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_011567	CCATTT	2	12	2292032	2292043	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011567	ATGTAA	2	12	2302433	2302444	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011567	CAATGG	2	12	2353192	2353203	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011567	GTTGCC	2	12	2353399	2353410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011567	CTTTTT	2	12	2371448	2371459	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011567	ATTTTA	2	12	2400496	2400507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011567	AAAATG	2	12	2421174	2421185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011567	CCTTTG	2	12	2431946	2431957	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011567	ACCGCA	2	12	2467680	2467691	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011567	ATAAAA	2	12	2472336	2472347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011567	TTCAAT	2	12	2478917	2478928	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_011567	ACAAAA	2	12	2490229	2490240	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011567	TGATTT	2	12	2518703	2518714	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011567	GAAAAA	2	12	2547753	2547764	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011567	CTTTTT	2	12	2562294	2562305	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011567	TGCACA	2	12	2580212	2580223	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011567	ACCTCC	2	12	2608869	2608880	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_011567	AAAAAT	2	12	2640015	2640026	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011567	AAGGAG	2	12	2652068	2652079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011567	TAAAAA	2	12	2677745	2677756	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011567	TTTTCA	2	12	2698825	2698836	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_011567	ATGAAA	2	12	2707645	2707656	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011567	AGAGCG	2	12	2712308	2712319	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_011567	TAAAAA	2	12	2736184	2736195	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011567	CATTAT	2	12	2798488	2798499	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_011567	TTTTTG	2	12	2817699	2817710	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.