MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL43

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011316	TTAT	2	8	11	18	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011316	TCTT	2	8	41	48	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011316	TCTT	2	8	58	65	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011316	TGC	2	6	89	94	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011316	ACG	2	6	138	143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011316	CGT	2	6	222	227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011316	A	7	7	259	265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011316	ATTG	2	8	945	952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011316	A	6	6	2010	2015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011316	TTG	2	6	2142	2147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011316	ATT	2	6	2199	2204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011316	ATA	2	6	2237	2242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011316	A	7	7	3457	3463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011316	T	6	6	3483	3488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011316	AATT	2	8	3548	3555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011316	AT	3	6	3666	3671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011316	A	6	6	3688	3693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011316	A	6	6	3704	3709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011316	A	6	6	3724	3729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011316	T	6	6	3767	3772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011316	A	6	6	3786	3791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011316	A	6	6	3798	3803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011316	T	6	6	3885	3890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011316	T	6	6	3977	3982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011316	GC	3	6	4020	4025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011316	AG	3	6	4183	4188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011316	A	6	6	4201	4206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011316	A	7	7	4208	4214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.