MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 plasmid pVSAL320

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011314	CTA	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011314	CTA	2	6	79	84	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011314	TAG	2	6	1168	1173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011314	ACA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011314	ATT	2	6	1262	1267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011314	TCA	2	6	1344	1349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011314	GTA	2	6	1362	1367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011314	AAC	2	6	2736	2741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011314	AAT	2	6	2857	2862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011314	AAT	2	6	4988	4993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011314	CCA	2	6	5048	5053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011314	ATT	2	6	6127	6132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011314	GCA	2	6	6195	6200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011314	TAA	2	6	6202	6207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011314	AAT	2	6	6324	6329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011314	ACG	2	6	6390	6395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011314	ATC	2	6	6742	6747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011314	GTT	2	6	6753	6758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011314	GAT	2	6	6875	6880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011314	GTT	2	6	6884	6889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011314	TCT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011314	ATT	2	6	7220	7225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011314	AAC	2	6	7376	7381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011314	ATT	2	6	7386	7391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011314	CAA	2	6	8530	8535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011314	GTA	2	6	8655	8660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011314	TAT	2	6	8697	8702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011314	ATA	2	6	8707	8712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011314	TAT	3	9	8715	8723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011314	ATT	2	6	9401	9406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011314	ATC	2	6	9475	9480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011314	ATC	2	6	9491	9496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011314	ATC	2	6	9773	9778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011314	ATA	2	6	9840	9845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011314	TGC	2	6	10012	10017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011314	CTA	2	6	10428	10433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011314	TCT	2	6	10473	10478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011314	TAA	2	6	10493	10498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011314	CAA	2	6	11191	11196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011314	TTG	2	6	11212	11217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011314	TGT	2	6	11247	11252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011314	TAA	2	6	11355	11360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011314	TTG	2	6	11410	11415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011314	ATT	2	6	11467	11472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011314	ATA	2	6	11505	11510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011314	TAA	2	6	12813	12818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011314	ACA	2	6	12840	12845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011314	CAT	2	6	12988	12993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011314	ATT	2	6	13025	13030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011314	ATT	2	6	14641	14646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011314	CAA	2	6	14859	14864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011314	TAA	2	6	14886	14891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011314	GTA	2	6	15010	15015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011314	ATA	2	6	15018	15023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011314	TAT	2	6	15425	15430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011314	ACT	2	6	16294	16299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011314	GAT	2	6	16647	16652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011314	ATG	2	6	16667	16672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011314	GTA	2	6	20009	20014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011314	GAT	2	6	20037	20042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011314	GAG	2	6	20188	20193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011314	CAG	2	6	20200	20205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011314	CAA	2	6	20244	20249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011314	CTT	2	6	20383	20388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011314	TAT	2	6	20410	20415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011314	ATC	2	6	20446	20451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011314	AGC	2	6	20624	20629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011314	GAA	2	6	20707	20712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011314	CAG	2	6	20823	20828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011314	ATT	2	6	20881	20886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011314	TTA	2	6	22239	22244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011314	GAA	2	6	22246	22251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011314	AAT	2	6	22278	22283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011314	CAA	2	6	22335	22340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011314	CTT	2	6	22468	22473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011314	TGT	2	6	22475	22480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011314	TGA	2	6	22492	22497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011314	GTA	2	6	22500	22505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011314	TTA	2	6	22560	22565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011314	ATT	3	9	22796	22804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011314	ATA	2	6	22832	22837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011314	CCT	2	6	27006	27011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011314	AAT	2	6	28529	28534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011314	AAC	2	6	28594	28599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011314	TCA	2	6	28604	28609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011314	CAT	2	6	28694	28699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011314	TTG	2	6	28978	28983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011314	ATT	2	6	29035	29040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011314	ATA	2	6	29073	29078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011314	TTG	2	6	29167	29172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011314	CAA	2	6	29273	29278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011314	TGC	2	6	29383	29388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011314	CTG	2	6	29396	29401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011314	TTG	2	6	29572	29577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011314	TTA	2	6	29611	29616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011314	GAA	2	6	29636	29641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011314	TAA	2	6	29656	29661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011314	TCG	2	6	29698	29703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011314	AAT	2	6	29732	29737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011314	CGA	2	6	29745	29750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011314	AGA	2	6	29883	29888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011314	GAT	2	6	29889	29894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011314	TAG	2	6	29903	29908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011314	TTC	2	6	29945	29950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011314	TTG	2	6	29971	29976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011314	GAA	2	6	30035	30040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011314	TAA	2	6	30055	30060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011314	TCG	2	6	30097	30102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011314	AAT	2	6	30131	30136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011314	CGA	2	6	30144	30149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011314	ATT	2	6	30237	30242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011314	AAC	2	6	30259	30264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011314	AGA	2	6	30286	30291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011314	GAT	2	6	30292	30297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011314	TAG	2	6	30306	30311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011314	GAT	2	6	30337	30342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011314	TAC	2	6	30347	30352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011314	CGT	3	9	30368	30376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011314	GTC	2	6	30507	30512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011314	GCA	2	6	30590	30595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011314	TAA	2	6	30596	30601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.