MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011312	GAA	2	6	620264	620269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_011312	TGA	2	6	620287	620292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_011312	CGT	2	6	620345	620350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_011312	GC	3	6	620361	620366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_011312	TCA	2	6	620372	620377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_011312	ATG	2	6	620438	620443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_011312	GTAT	2	8	620448	620455	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_011312	TGGT	2	8	620566	620573	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_011312	TATC	2	8	620662	620669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_011312	CTG	2	6	620706	620711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_011312	GGT	2	6	620747	620752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_011312	AGT	2	6	620809	620814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_011312	TGGG	2	8	620950	620957	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_011312	GAT	2	6	620984	620989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_011312	A	8	8	622624	622631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_011312	T	7	7	622669	622675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_011312	AAAT	2	8	622710	622717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_011312	TCT	2	6	622755	622760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_011312	T	8	8	622809	622816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_011312	TGTTA	2	10	622850	622859	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_011312	TAT	2	6	622869	622874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_011312	T	8	8	622891	622898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_011312	TA	3	6	622987	622992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_011312	ACTC	2	8	624370	624377	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_011312	AAGAT	2	10	625108	625117	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_011312	TTC	2	6	625125	625130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_011312	T	9	9	625132	625140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_011312	TTC	2	6	625186	625191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_011312	TA	3	6	625212	625217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_011312	TTTA	2	8	625224	625231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_011312	ATTA	2	8	625265	625272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_011312	TAT	2	6	625328	625333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_011312	T	7	7	625342	625348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_011312	TAT	2	6	625391	625396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_011312	TATT	2	8	625455	625462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_011312	GAT	2	6	625550	625555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_011312	A	6	6	625639	625644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_011312	ATG	2	6	625663	625668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_011312	ATA	2	6	630168	630173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_011312	T	7	7	630209	630215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_011312	AG	3	6	630227	630232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_011312	T	6	6	631139	631144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_011312	ATA	2	6	632325	632330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_011312	TTTA	2	8	632340	632347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_011312	TAG	2	6	632359	632364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_011312	GTG	2	6	632391	632396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_011312	TAA	2	6	632407	632412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_011312	CA	3	6	632419	632424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3049	NC_011312	T	6	6	632438	632443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_011312	ATTTT	2	10	632452	632461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_011312	TTG	2	6	632465	632470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_011312	ATT	2	6	632513	632518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_011312	T	6	6	632517	632522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_011312	TAA	2	6	632562	632567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_011312	TGT	2	6	632602	632607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_011312	AATG	2	8	632619	632626	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_011312	A	7	7	633996	634002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_011312	T	6	6	634017	634022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_011312	CAAA	2	8	634416	634423	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_011312	TGA	2	6	634428	634433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_011312	T	6	6	634476	634481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_011312	TCA	3	9	634504	634512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_011312	T	7	7	634527	634533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_011312	TGAGT	2	10	636107	636116	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_011312	TA	3	6	636137	636142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_011312	T	7	7	636152	636158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_011312	AAAT	2	8	636163	636170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_011312	CATTT	2	10	637117	637126	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3069	NC_011312	T	8	8	640571	640578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_011312	ATT	2	6	640594	640599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_011312	CAA	2	6	641055	641060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_011312	ATA	2	6	642040	642045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_011312	T	8	8	642933	642940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_011312	GCT	2	6	642985	642990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_011312	TTA	2	6	643023	643028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_011312	ATT	3	9	643039	643047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3077	NC_011312	GTT	2	6	643073	643078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_011312	T	6	6	643077	643082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_011312	GT	3	6	643094	643099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_011312	T	6	6	643210	643215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_011312	TGA	2	6	643278	643283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_011312	A	6	6	643291	643296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_011312	TTG	2	6	643317	643322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_011312	A	7	7	643396	643402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_011312	TATG	2	8	643418	643425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_011312	TAT	2	6	643439	643444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_011312	AGT	2	6	644619	644624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_011312	GAA	2	6	647906	647911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_011312	TTC	2	6	647918	647923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_011312	TGC	2	6	647935	647940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_011312	ATA	2	6	649391	649396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_011312	G	6	6	649450	649455	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_011312	TAA	2	6	649458	649463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_011312	A	6	6	649462	649467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_011312	TTTA	2	8	649487	649494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_011312	ATT	2	6	649499	649504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_011312	GGA	2	6	650537	650542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_011312	TTG	2	6	650571	650576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_011312	TTA	2	6	650582	650587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_011312	A	6	6	650593	650598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_011312	CGT	2	6	650616	650621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_011312	TTG	2	6	650704	650709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_011312	T	7	7	650747	650753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_011312	T	6	6	650776	650781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_011312	GGT	2	6	650782	650787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_011312	T	9	9	650795	650803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_011312	TATT	2	8	650856	650863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_011312	T	6	6	650879	650884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_011312	TTAA	2	8	650916	650923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_011312	ATAG	2	8	650945	650952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_011312	ATTT	2	8	650961	650968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_011312	AC	3	6	651006	651011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_011312	CCTT	2	8	651019	651026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_011312	TAAAA	2	10	651589	651598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_011312	GCC	2	6	651600	651605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_011312	T	6	6	651973	651978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_011312	T	6	6	652033	652038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_011312	TCT	2	6	652046	652051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_011312	GTA	2	6	652718	652723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_011312	GTA	2	6	652741	652746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_011312	TCAT	2	8	652752	652759	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3122	NC_011312	TGAGT	2	10	654781	654790	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_011312	AAAC	2	8	654793	654800	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3124	NC_011312	ATT	2	6	655704	655709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_011312	T	6	6	657097	657102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_011312	TAG	2	6	657121	657126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_011312	TCC	2	6	657143	657148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_011312	GC	3	6	657165	657170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3129	NC_011312	ATTA	2	8	657197	657204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_011312	CT	3	6	657635	657640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_011312	TAA	2	6	657675	657680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_011312	CTTT	2	8	657699	657706	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3133	NC_011312	TCG	2	6	657743	657748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_011312	GTC	2	6	657765	657770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3135	NC_011312	TAT	2	6	657818	657823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_011312	CAG	2	6	657855	657860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3137	NC_011312	T	6	6	657885	657890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_011312	T	6	6	657909	657914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3139	NC_011312	T	7	7	657938	657944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3269	NC_011312	A	7	7	698970	698976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_011312	GTAAT	2	10	698992	699001	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_011312	T	6	6	699018	699023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3272	NC_011312	TAA	2	6	701606	701611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3273	NC_011312	ATAGA	2	10	701664	701673	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3274	NC_011312	TAAA	2	8	702246	702253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3415	NC_011312	ATTA	2	8	732619	732626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3420	NC_011312	A	8	8	735301	735308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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