MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011312	AT	3	6	254950	254955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_011312	TAA	2	6	254956	254961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_011312	TA	3	6	256489	256494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011312	ATA	2	6	256498	256503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_011312	AATC	2	8	256509	256516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_011312	CCT	2	6	256522	256527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1507	NC_011312	AAT	2	6	261399	261404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_011312	GGTGA	2	10	261429	261438	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_011312	ACA	2	6	261451	261456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_011312	ACA	2	6	261476	261481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_011312	GAC	2	6	261615	261620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_011312	TA	3	6	264211	264216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_011312	TA	3	6	266489	266494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_011312	T	7	7	266505	266511	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_011312	GACG	2	8	266637	266644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_011312	TAA	2	6	266697	266702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_011312	ATT	2	6	266716	266721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011312	GTAA	2	8	266740	266747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_011312	TA	3	6	266763	266768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_011312	AAG	2	6	266807	266812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_011312	GAT	2	6	266823	266828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011312	T	6	6	266849	266854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011312	TA	3	6	266886	266891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011312	ATT	2	6	266892	266897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_011312	TTA	2	6	266904	266909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_011312	T	6	6	266942	266947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_011312	TGAT	2	8	266970	266977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011312	TGT	2	6	266997	267002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_011312	TTA	2	6	267026	267031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_011312	GTT	2	6	267050	267055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011312	ATTT	2	8	267056	267063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_011312	TAAAA	2	10	267064	267073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_011312	A	6	6	267070	267075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_011312	CT	3	6	267090	267095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_011312	T	7	7	267095	267101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011312	TGA	2	6	267121	267126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_011312	T	6	6	267172	267177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_011312	CAA	2	6	267204	267209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_011312	TCG	2	6	267214	267219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_011312	AGC	2	6	267227	267232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_011312	T	6	6	267301	267306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_011312	ATT	2	6	267310	267315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_011312	TAT	2	6	267330	267335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_011312	AAAT	2	8	267404	267411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011312	TTC	2	6	268341	268346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_011312	GGAT	2	8	268417	268424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_011312	T	6	6	268440	268445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_011312	ATT	2	6	268496	268501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_011312	T	6	6	268508	268513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011312	TG	3	6	270732	270737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011312	AATA	2	8	271461	271468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_011312	TAT	2	6	271482	271487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_011312	T	6	6	271495	271500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_011312	TAAT	2	8	271519	271526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_011312	TTA	3	9	271587	271595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_011312	ATT	2	6	271637	271642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_011312	AAG	2	6	271645	271650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_011312	GTG	2	6	271699	271704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_011312	T	6	6	271736	271741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_011312	GCG	2	6	271747	271752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_011312	CTT	2	6	271753	271758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_011312	T	8	8	271772	271779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_011312	T	7	7	271783	271789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_011312	ATATTA	2	12	271858	271869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_011312	TG	3	6	271937	271942	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011312	AAT	2	6	271995	272000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011312	TTTATT	2	12	272043	272054	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011312	GAAA	2	8	272058	272065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011312	AAGAA	2	10	272066	272075	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_011312	ATC	2	6	272129	272134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_011312	ATA	2	6	272146	272151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_011312	T	8	8	275062	275069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_011312	A	8	8	275126	275133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_011312	A	7	7	275138	275144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_011312	TGT	2	6	275165	275170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_011312	GCC	2	6	275255	275260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_011312	T	6	6	275286	275291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1579	NC_011312	TTA	2	6	275371	275376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_011312	ATT	2	6	275405	275410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_011312	TCA	2	6	275429	275434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1583	NC_011312	T	6	6	275445	275450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_011312	T	6	6	275456	275461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_011312	A	6	6	275512	275517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_011312	GAG	2	6	275534	275539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_011312	ATG	2	6	275550	275555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_011312	AAT	2	6	275570	275575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_011312	TC	3	6	275587	275592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_011312	TTTTTA	2	12	275619	275630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_011312	T	6	6	275680	275685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_011312	ATT	2	6	276386	276391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_011312	T	6	6	276408	276413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011312	GAA	2	6	276560	276565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_011312	ATA	3	9	276602	276610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_011312	T	7	7	277288	277294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_011312	CTT	2	6	279074	279079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_011312	TTG	2	6	279084	279089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_011312	TAT	2	6	279124	279129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_011312	AAG	2	6	279139	279144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_011312	AAGT	2	8	279170	279177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011312	T	8	8	280647	280654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_011312	AGG	2	6	281451	281456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_011312	GATT	2	8	281462	281469	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_011312	TAT	2	6	281475	281480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011312	TA	3	6	281484	281489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_011312	CCA	2	6	283085	283090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_011312	CTT	2	6	283139	283144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_011312	TAAA	2	8	283172	283179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_011312	AAT	2	6	283212	283217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011312	TTAA	2	8	283243	283250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_011312	AAGA	2	8	286257	286264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_011312	CTC	2	6	286346	286351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_011312	CGCTT	2	10	286430	286439	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1618	NC_011312	GAAGC	2	10	286497	286506	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1619	NC_011312	TTA	2	6	291162	291167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_011312	CT	3	6	291201	291206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_011312	TAT	2	6	291310	291315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_011312	GCA	2	6	291320	291325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_011312	CCG	2	6	291333	291338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_011312	ATT	2	6	291578	291583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_011312	TAA	2	6	291616	291621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_011312	TGC	2	6	291636	291641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_011312	TTG	2	6	291672	291677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_011312	TGG	2	6	291688	291693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_011312	TTAA	2	8	291725	291732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_011312	CAT	2	6	291733	291738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_011312	CAG	2	6	291759	291764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_011312	TAT	2	6	291782	291787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011312	ATT	2	6	291798	291803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_011312	CGAC	2	8	291935	291942	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_011312	CAAG	2	8	291989	291996	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1636	NC_011312	AAT	2	6	293478	293483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_011312	ATT	2	6	293497	293502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1907	NC_011312	TA	3	6	361106	361111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1908	NC_011312	ATAAA	2	10	361128	361137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1909	NC_011312	AAAT	2	8	361189	361196	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1910	NC_011312	TCT	2	6	361204	361209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1911	NC_011312	GACTC	2	10	361262	361271	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1912	NC_011312	AGA	3	9	361294	361302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1913	NC_011312	ATC	2	6	361304	361309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1914	NC_011312	ATG	2	6	361317	361322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_011312	AC	3	6	361323	361328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1916	NC_011312	TTA	2	6	361360	361365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1917	NC_011312	ATGC	2	8	361410	361417	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1918	NC_011312	A	7	7	361513	361519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1919	NC_011312	ATT	2	6	361605	361610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1920	NC_011312	ATT	2	6	361677	361682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1921	NC_011312	TAA	2	6	361708	361713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1922	NC_011312	TAA	2	6	361739	361744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1923	NC_011312	AAC	2	6	361768	361773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1926	NC_011312	CACG	2	8	362028	362035	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1927	NC_011312	CGA	2	6	362037	362042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1929	NC_011312	CAGA	2	8	362178	362185	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1930	NC_011312	TGA	2	6	362315	362320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1931	NC_011312	AGCG	2	8	362353	362360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1932	NC_011312	CAG	2	6	362694	362699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1934	NC_011312	AAT	2	6	362719	362724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1935	NC_011312	TGT	2	6	362818	362823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1937	NC_011312	CAA	2	6	362926	362931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1941	NC_011312	CAA	2	6	363115	363120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1942	NC_011312	TCT	2	6	363191	363196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1943	NC_011312	CT	3	6	363202	363207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1944	NC_011312	ACA	2	6	363235	363240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1945	NC_011312	AGC	2	6	363305	363310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1947	NC_011312	GAAT	2	8	363352	363359	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1948	NC_011312	ATT	2	6	363384	363389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1949	NC_011312	TGA	2	6	363401	363406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1950	NC_011312	AATC	2	8	363480	363487	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1951	NC_011312	TC	3	6	363493	363498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1952	NC_011312	TTGT	2	8	363524	363531	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_011312	TATT	2	8	363533	363540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1954	NC_011312	ATT	2	6	363875	363880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1955	NC_011312	AGT	2	6	365434	365439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1958	NC_011312	T	6	6	368550	368555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1959	NC_011312	A	8	8	368568	368575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1961	NC_011312	CAT	2	6	370271	370276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1964	NC_011312	AT	3	6	374233	374238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1965	NC_011312	TG	3	6	374274	374279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1966	NC_011312	AGT	2	6	374287	374292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1967	NC_011312	TTG	2	6	374321	374326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1968	NC_011312	CTT	2	6	374332	374337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1969	NC_011312	AG	3	6	374730	374735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1970	NC_011312	GTTTC	2	10	375130	375139	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1974	NC_011312	T	7	7	377254	377260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1975	NC_011312	TTA	2	6	378309	378314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1976	NC_011312	ATTC	2	8	378409	378416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1977	NC_011312	TTAAT	2	10	378472	378481	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1986	NC_011312	TAAAAA	2	12	387949	387960	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1988	NC_011312	T	6	6	387979	387984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_011312	ATT	2	6	392357	392362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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