MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aliivibrio salmonicida LFI1238 chromosome chromosome 1

Total Repeats: 16441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011312	A	7	7	1290032	1290038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_011312	TAA	2	6	1290063	1290068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_011312	TTAT	2	8	1290095	1290102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_011312	TAA	2	6	1290132	1290137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_011312	CGT	2	6	1290148	1290153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_011312	AT	3	6	1290223	1290228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_011312	GATT	2	8	1290249	1290256	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_011312	TAAG	2	8	1290353	1290360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_011312	CTA	2	6	1290393	1290398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_011312	TAA	2	6	1290414	1290419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_011312	A	6	6	1290468	1290473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_011312	CAA	2	6	1290488	1290493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_011312	TTG	2	6	1290521	1290526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_011312	ACACT	2	10	1290530	1290539	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6015	NC_011312	AAC	2	6	1290551	1290556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_011312	A	7	7	1290601	1290607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_011312	ATAAA	2	10	1290632	1290641	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_011312	T	7	7	1290740	1290746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_011312	G	7	7	1292076	1292082	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_011312	ATT	2	6	1292084	1292089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_011312	TGT	2	6	1292108	1292113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_011312	TTG	2	6	1292125	1292130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_011312	A	6	6	1292157	1292162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_011312	ATG	2	6	1292259	1292264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_011312	TTA	2	6	1292395	1292400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_011312	CAA	2	6	1292424	1292429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_011312	AT	3	6	1292442	1292447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_011312	GTG	2	6	1292500	1292505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_011312	T	6	6	1292532	1292537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_011312	TGA	2	6	1292567	1292572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_011312	AAT	2	6	1292598	1292603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_011312	CTTT	2	8	1292698	1292705	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6033	NC_011312	CAA	2	6	1292851	1292856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_011312	ATCGT	2	10	1292902	1292911	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6035	NC_011312	GA	3	6	1293047	1293052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_011312	CTT	2	6	1293085	1293090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_011312	ATA	2	6	1293728	1293733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_011312	AG	3	6	1293831	1293836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_011312	A	6	6	1293845	1293850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_011312	TAG	2	6	1294555	1294560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_011312	AAG	2	6	1294562	1294567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_011312	AAT	2	6	1294595	1294600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_011312	AT	3	6	1294610	1294615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_011312	A	6	6	1294617	1294622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_011312	TAA	2	6	1294638	1294643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_011312	TA	3	6	1294697	1294702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_011312	AATA	2	8	1294707	1294714	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_011312	TGATT	2	10	1295613	1295622	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_011312	TAA	2	6	1295623	1295628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_011312	AGT	2	6	1295631	1295636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_011312	GAG	2	6	1297308	1297313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_011312	GAC	2	6	1297395	1297400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_011312	CT	3	6	1297472	1297477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6054	NC_011312	A	6	6	1298343	1298348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_011312	T	6	6	1298376	1298381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_011312	GAT	2	6	1298382	1298387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6058	NC_011312	TAT	2	6	1299276	1299281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_011312	ATT	2	6	1299287	1299292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_011312	TAG	2	6	1299305	1299310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_011312	A	6	6	1299320	1299325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_011312	GAC	2	6	1299353	1299358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_011312	ATA	2	6	1299427	1299432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_011312	A	7	7	1299440	1299446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_011312	A	6	6	1299450	1299455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_011312	TA	4	8	1302102	1302109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_011312	A	6	6	1302118	1302123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_011312	TTTG	2	8	1302175	1302182	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6070	NC_011312	ATTA	2	8	1303525	1303532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_011312	AT	3	6	1303558	1303563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_011312	A	7	7	1303585	1303591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_011312	T	6	6	1304496	1304501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_011312	A	6	6	1304594	1304599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_011312	CAT	2	6	1304620	1304625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_011312	AGTA	2	8	1304663	1304670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_011312	TGT	2	6	1304679	1304684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6079	NC_011312	CAAT	2	8	1304712	1304719	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6080	NC_011312	TTGT	2	8	1304738	1304745	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_011312	T	6	6	1306166	1306171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_011312	T	7	7	1306191	1306197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_011312	AAT	2	6	1306253	1306258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_011312	CTTT	2	8	1308183	1308190	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6085	NC_011312	TTAT	2	8	1309112	1309119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_011312	TAAT	2	8	1310119	1310126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_011312	TTTA	2	8	1311137	1311144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_011312	T	7	7	1311206	1311212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_011312	TAT	2	6	1311233	1311238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6091	NC_011312	TTA	2	6	1311258	1311263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_011312	AATA	2	8	1311310	1311317	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_011312	AAG	2	6	1311901	1311906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_011312	AG	3	6	1311905	1311910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_011312	TA	3	6	1312230	1312235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_011312	ATT	2	6	1312280	1312285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_011312	ATA	2	6	1312329	1312334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_011312	A	6	6	1314312	1314317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_011312	TCA	2	6	1314332	1314337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6101	NC_011312	TA	3	6	1315892	1315897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_011312	ATA	2	6	1315901	1315906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_011312	AATC	2	8	1315912	1315919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_011312	CCT	2	6	1315925	1315930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6105	NC_011312	ATGA	2	8	1316784	1316791	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6107	NC_011312	AAG	2	6	1316835	1316840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_011312	CAG	2	6	1316911	1316916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_011312	A	6	6	1316949	1316954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_011312	GCTT	2	8	1316984	1316991	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_011312	TCCG	2	8	1316993	1317000	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_011312	ATGA	2	8	1317033	1317040	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_011312	TCA	2	6	1317117	1317122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6116	NC_011312	TTG	2	6	1317392	1317397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_011312	TTTG	3	12	1317472	1317483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_011312	ATC	2	6	1317494	1317499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_011312	CTT	2	6	1317568	1317573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_011312	GCAG	2	8	1317611	1317618	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6121	NC_011312	AAG	2	6	1317620	1317625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_011312	TTC	2	6	1317643	1317648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_011312	ATG	2	6	1317666	1317671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_011312	TAA	2	6	1317673	1317678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_011312	AAT	2	6	1318615	1318620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_011312	TAG	2	6	1318703	1318708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_011312	ATG	2	6	1318718	1318723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_011312	ACGA	2	8	1318766	1318773	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6129	NC_011312	ATA	2	6	1318884	1318889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_011312	T	6	6	1322904	1322909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_011312	AATG	2	8	1322955	1322962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6132	NC_011312	AGT	2	6	1322980	1322985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6134	NC_011312	TAT	2	6	1323842	1323847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6262	NC_011312	CAA	2	6	1347744	1347749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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