MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 7 str. AP76

Total Repeats: 261

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010939	GACAA	2	10	2804	2813	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010939	TTAGG	2	10	38398	38407	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010939	TGTAA	2	10	48415	48424	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010939	GTTAC	2	10	48445	48454	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_010939	ATGCA	2	10	52381	52390	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010939	ATTTA	2	10	60806	60815	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010939	TTGAA	2	10	69059	69068	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010939	AGTCG	2	10	72244	72253	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010939	AGGTT	2	10	72571	72580	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010939	GGTGT	2	10	73973	73982	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010939	AATTT	2	10	82667	82676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010939	AATAA	2	10	98973	98982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010939	TAGTT	2	10	100063	100072	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010939	AGCGA	2	10	100217	100226	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010939	ATTTA	2	10	105803	105812	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010939	TTTAT	3	15	105935	105949	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010939	GAAAA	2	10	127361	127370	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010939	TAATT	2	10	132699	132708	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010939	TGTAT	2	10	139699	139708	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010939	TTTAT	2	10	173791	173800	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010939	TATTT	2	10	181450	181459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010939	AAAAG	2	10	186522	186531	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010939	TATAG	2	10	199455	199464	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010939	CTGAT	2	10	199589	199598	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_010939	ATTTG	2	10	210367	210376	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010939	GCTTT	2	10	210519	210528	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010939	TTAAA	2	10	232891	232900	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010939	GAAGG	2	10	244089	244098	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010939	GAAGG	2	10	244149	244158	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010939	TCAAA	2	10	244655	244664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010939	TATAT	2	10	253057	253066	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010939	GAGAA	2	10	260222	260231	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010939	GTTAA	2	10	261593	261602	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010939	TAATT	2	10	262523	262532	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010939	CTTTT	2	10	265752	265761	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_010939	TTTAA	2	10	270832	270841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010939	GTTTG	2	10	281705	281714	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010939	TTGAA	2	10	286135	286144	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010939	AGTCG	2	10	289220	289229	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010939	AGGTT	2	10	289547	289556	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010939	GGTGT	2	10	290948	290957	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010939	AGCGG	2	10	315004	315013	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010939	TTTCT	2	10	320431	320440	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_010939	GAATT	2	10	328868	328877	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010939	AGAAA	2	10	351108	351117	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010939	TCCGT	2	10	362035	362044	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_010939	TTTCT	2	10	370029	370038	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010939	GAGAT	2	10	413099	413108	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010939	TTAAG	2	10	413306	413315	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010939	AAGCA	2	10	432492	432501	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010939	TCTTT	2	10	441157	441166	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010939	TAGCA	2	10	450104	450113	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010939	TTTCA	2	10	460026	460035	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010939	CAGGG	2	10	464352	464361	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010939	GATAA	2	10	471349	471358	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010939	TTTAA	2	10	472304	472313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010939	AGATA	2	10	477610	477619	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010939	AGAAA	2	10	489534	489543	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010939	AGCAT	2	10	512609	512618	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010939	TATAT	2	10	512662	512671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010939	ACACA	2	10	526599	526608	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_010939	ATTTA	2	10	563096	563105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010939	AGCTA	2	10	572166	572175	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010939	CTTAA	2	10	584046	584055	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_010939	TAAAA	2	10	589446	589455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010939	ATATT	2	10	589467	589476	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010939	AAAGG	2	10	590228	590237	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010939	GGGAT	2	10	593188	593197	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010939	TAAAA	2	10	600774	600783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010939	GGTTT	2	10	601880	601889	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010939	TAAAA	2	10	620649	620658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010939	TTATT	2	10	620683	620692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010939	TTTAT	2	10	626496	626505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010939	TTTTG	2	10	630565	630574	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010939	CACGG	2	10	631361	631370	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_010939	ATTTT	2	10	631511	631520	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010939	ATTCA	2	10	635079	635088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_010939	TTTCC	2	10	642864	642873	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_010939	ATTTT	2	10	699252	699261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010939	AAATT	2	10	716141	716150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010939	TGTTT	2	10	720656	720665	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010939	TTTAA	2	10	735185	735194	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010939	GTTTT	2	10	754257	754266	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010939	TTTAA	2	10	786085	786094	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010939	TTTAA	2	10	786148	786157	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010939	GATAA	2	10	804048	804057	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010939	AAGTT	2	10	816988	816997	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010939	AAAAT	2	10	832760	832769	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010939	TGTGC	15	75	843630	843704	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010939	CCTTA	2	10	845254	845263	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010939	TTTAC	2	10	851758	851767	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010939	TTTTA	2	10	855589	855598	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010939	ATTTT	2	10	862600	862609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010939	CGATA	2	10	872101	872110	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010939	TTTTG	2	10	890986	890995	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010939	TTTAT	2	10	892757	892766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010939	CTTTT	2	10	908519	908528	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_010939	TTATT	2	10	924692	924701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010939	ATTTC	2	10	931325	931334	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_010939	ATAAG	2	10	950851	950860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010939	TTAAG	2	10	959249	959258	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010939	AATGA	2	10	976700	976709	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010939	ACATC	2	10	976724	976733	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_010939	AAATG	2	10	987549	987558	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010939	CAAAA	2	10	1009275	1009284	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_010939	CTAAT	2	10	1016635	1016644	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010939	GTTTT	2	10	1031141	1031150	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010939	CTCTC	2	10	1033330	1033339	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
109	NC_010939	AAAAC	2	10	1045183	1045192	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_010939	AAAAT	2	10	1045216	1045225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010939	TTCTT	2	10	1059477	1059486	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_010939	CTTTA	2	10	1066661	1066670	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_010939	ACTAA	2	10	1087405	1087414	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010939	TTAAC	2	10	1094866	1094875	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010939	CTTTT	2	10	1096176	1096185	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_010939	AATAG	2	10	1098076	1098085	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010939	ATTAA	2	10	1128073	1128082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010939	AAATT	2	10	1131389	1131398	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010939	ATAAA	2	10	1142569	1142578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010939	TTTTA	2	10	1149505	1149514	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010939	TTATG	2	10	1156405	1156414	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010939	ATTTT	2	10	1164944	1164953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010939	AAAAT	2	10	1169175	1169184	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010939	AAATC	2	10	1183199	1183208	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010939	TTATA	2	10	1187533	1187542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010939	AATTT	2	10	1187604	1187613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010939	TCAAA	2	10	1188034	1188043	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010939	AAATC	2	10	1188152	1188161	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_010939	CAAAT	2	10	1195672	1195681	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010939	ACAAA	2	10	1199175	1199184	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010939	ATATA	2	10	1211358	1211367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010939	GTCAC	2	10	1222548	1222557	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_010939	CAAAA	2	10	1240090	1240099	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010939	AAACC	2	10	1240152	1240161	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_010939	CAAAC	2	10	1245267	1245276	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_010939	TTCTT	2	10	1263814	1263823	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010939	TCAAA	2	10	1264762	1264771	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010939	CAATA	2	10	1271432	1271441	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010939	GAAAA	2	10	1281253	1281262	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010939	ACTTC	2	10	1284155	1284164	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_010939	CGTTA	2	10	1290807	1290816	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_010939	AATAA	2	10	1302965	1302974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010939	GGCGA	2	10	1313140	1313149	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010939	GATAA	2	10	1328629	1328638	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010939	TGGAT	2	10	1338297	1338306	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010939	ATTTT	2	10	1349687	1349696	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010939	TAAAA	2	10	1373153	1373162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010939	CAAAA	2	10	1391646	1391655	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_010939	CAAAA	2	10	1394896	1394905	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_010939	TCAAG	2	10	1394937	1394946	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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153	NC_010939	ATCCT	2	10	1459603	1459612	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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161	NC_010939	ACTTT	2	10	1545049	1545058	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_010939	ATTAA	2	10	1642814	1642823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_010939	ATTTA	2	10	1648053	1648062	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_010939	CTTTA	2	10	1649611	1649620	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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190	NC_010939	ATTTT	2	10	1716100	1716109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_010939	TAAAT	2	10	1720832	1720841	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_010939	TTATT	2	10	1728586	1728595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_010939	TAAAA	2	10	1732489	1732498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_010939	AAAAG	2	10	1740367	1740376	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_010939	CTTTT	2	10	1749994	1750003	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.