MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835 chromosome

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010655	TATTCA	2	12	18769	18780	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_010655	TTCTGG	2	12	84384	84395	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010655	AACCGG	2	12	99722	99733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010655	TCCCGC	2	12	112231	112242	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_010655	GATATA	2	12	146478	146489	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010655	GCGCCT	2	12	152306	152317	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010655	GCATCA	2	12	152701	152712	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010655	CACCGT	2	12	152747	152758	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010655	TTCATC	2	12	173944	173955	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010655	GAAAAA	2	12	183407	183418	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010655	GGAAAG	2	12	211820	211831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010655	TCCTTT	2	12	257223	257234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010655	AGTCAA	2	12	270359	270370	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010655	TTCCAG	2	12	288399	288410	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010655	CTCGGC	2	12	318515	318526	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010655	CAAAAA	2	12	322434	322445	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010655	ATTTTT	2	12	322471	322482	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010655	AGAAAA	2	12	324782	324793	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010655	AGAGAA	2	12	325430	325441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010655	CAAAAT	2	12	339301	339312	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010655	CGGTTG	2	12	379505	379516	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010655	GTCTGC	2	12	381284	381295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010655	GGTCTT	2	12	389486	389497	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010655	TTCCTT	2	12	397210	397221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010655	CCGCCC	2	12	438609	438620	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
26	NC_010655	AAAGAA	2	12	442510	442521	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010655	ACCGTC	2	12	471129	471140	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010655	CCGGAA	2	12	496685	496696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010655	ACGGAA	2	12	502077	502088	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010655	CTTCGG	2	12	638588	638599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010655	TGGGCA	2	12	658967	658978	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010655	GGCCGC	2	12	659887	659898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010655	GGAAAA	2	12	684009	684020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010655	TTTCTC	2	12	738953	738964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010655	CTTTTT	2	12	742717	742728	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010655	AGCGGC	2	12	817226	817237	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010655	GCGGAG	2	12	817483	817494	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010655	GAACAT	2	12	850597	850608	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010655	ATTTTT	2	12	857681	857692	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010655	GGAAAC	2	12	872276	872287	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010655	CCGCAC	2	12	892953	892964	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_010655	TTGACA	2	12	897761	897772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010655	TTAGAA	2	12	969277	969288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010655	GCCGAG	2	12	993367	993378	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010655	TGTTGA	2	12	1076220	1076231	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010655	TCCCAT	2	12	1093728	1093739	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010655	GCCGGG	2	12	1119773	1119784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010655	TCCGTT	2	12	1125787	1125798	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010655	GAGGAA	2	12	1127686	1127697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010655	CTTTTC	2	12	1191906	1191917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010655	CCGTTT	2	12	1191982	1191993	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010655	GGGATG	2	12	1192530	1192541	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010655	GGTCAG	2	12	1192654	1192665	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010655	AGAAAT	2	12	1206645	1206656	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010655	TTTTGG	2	12	1249852	1249863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010655	TGCGGA	2	12	1272734	1272745	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010655	AGGGCA	2	12	1296249	1296260	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010655	TATGAT	2	12	1376785	1376796	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010655	ATTTTC	2	12	1384482	1384493	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010655	GTTCCG	2	12	1393582	1393593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010655	TTTCCG	2	12	1416634	1416645	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010655	GCCGAG	2	12	1463212	1463223	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010655	AGATGA	2	12	1535036	1535047	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010655	TTTTCC	2	12	1578657	1578668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010655	TTCCGT	2	12	1585726	1585737	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010655	GGAAAA	2	12	1666122	1666133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010655	GATTTT	2	12	1704400	1704411	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010655	GTAGGC	2	12	1704902	1704913	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010655	TGGCCG	2	12	1705110	1705121	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010655	TTATTT	2	12	1734064	1734075	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010655	TCCCCT	2	12	1735002	1735013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_010655	GGGGAT	2	12	1748402	1748413	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010655	TCCTTT	2	12	1790877	1790888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010655	GGGAGG	2	12	1793813	1793824	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010655	GGGGAC	2	12	1794007	1794018	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_010655	GCCATC	2	12	1794401	1794412	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010655	ATTTAA	2	12	1813895	1813906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010655	ATAGAA	2	12	1869928	1869939	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010655	CCTTCC	2	12	1928072	1928083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010655	GGATGT	2	12	2012231	2012242	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010655	GAAGGG	2	12	2012546	2012557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010655	TGTTTT	2	12	2181604	2181615	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010655	GTTATT	2	12	2210920	2210931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010655	CCCGTA	2	12	2233980	2233991	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010655	CGGACG	2	12	2242346	2242357	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010655	TAACCG	2	12	2244193	2244204	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010655	CGGGAA	2	12	2333701	2333712	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010655	CGCTCC	2	12	2347045	2347056	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010655	CGGTTC	2	12	2368873	2368884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010655	GAAAAA	2	12	2372896	2372907	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010655	ACGGAA	2	12	2377426	2377437	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010655	CAACGC	2	12	2434904	2434915	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010655	CCAGAG	2	12	2438326	2438337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010655	TCTTTT	2	12	2466744	2466755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_010655	TTAAAG	2	12	2473838	2473849	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010655	CTTTTT	2	12	2507580	2507591	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010655	GTCCCC	2	12	2514873	2514884	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_010655	ATTTTC	2	12	2550356	2550367	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010655	TAAAAA	2	12	2552728	2552739	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010655	TATTGT	2	12	2552740	2552751	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010655	TACGGC	2	12	2561424	2561435	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010655	GGAAAA	2	12	2563548	2563559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010655	CCTTTT	2	12	2569178	2569189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010655	CTTCAT	2	12	2584412	2584423	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010655	ACGGAT	2	12	2591741	2591752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_010655	AGGAAA	2	12	2604732	2604743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.