MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835 chromosome

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010655	CTTCA	2	10	201	210	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_010655	GAAAA	2	10	239	248	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010655	TCCAA	2	10	271	280	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010655	GTTCC	2	10	1429	1438	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010655	AACAA	2	10	1501	1510	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010655	CCGGC	2	10	10760	10769	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_010655	CCGGG	2	10	23058	23067	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010655	ACACA	2	10	26682	26691	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_010655	ATATC	2	10	30392	30401	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010655	CAAAG	2	10	37071	37080	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010655	CTTCT	2	10	45326	45335	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_010655	AAAAT	2	10	45562	45571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010655	CACAA	2	10	61574	61583	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_010655	AAATA	2	10	63309	63318	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010655	GAAGG	2	10	73236	73245	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010655	GCAAG	2	10	84670	84679	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010655	TAAAT	2	10	86220	86229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010655	AATTT	2	10	86237	86246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010655	TTCCC	2	10	86902	86911	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
20	NC_010655	TTCCC	2	10	98715	98724	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_010655	CTTTT	2	10	99838	99847	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010655	CTTGA	2	10	105058	105067	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010655	TCCTT	2	10	108591	108600	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_010655	CCTCC	2	10	108789	108798	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
25	NC_010655	CTTCC	2	10	109446	109455	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_010655	CTTTT	2	10	112348	112357	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010655	TCCGG	2	10	117962	117971	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_010655	GACTA	2	10	123023	123032	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010655	CCCTG	2	10	142285	142294	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_010655	GGAAC	2	10	146434	146443	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010655	GCCCC	2	10	151506	151515	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
32	NC_010655	TGCCC	2	10	152729	152738	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_010655	CCTCC	2	10	153056	153065	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
34	NC_010655	TAAAG	2	10	158189	158198	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010655	GAAAA	2	10	180862	180871	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010655	GAGCA	2	10	215922	215931	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010655	CCGCA	2	10	237609	237618	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_010655	TCCCT	2	10	243599	243608	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_010655	TTTCC	2	10	247535	247544	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_010655	CGGAA	2	10	266528	266537	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010655	TATAA	2	10	266708	266717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010655	AGAAA	2	10	287301	287310	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010655	TTTCA	2	10	290680	290689	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_010655	ACAGG	2	10	297787	297796	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_010655	CTTAC	2	10	303624	303633	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_010655	TTATT	2	10	309830	309839	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010655	AAGAA	2	10	316675	316684	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010655	TGCTC	2	10	319333	319342	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_010655	CTGAC	2	10	320814	320823	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010655	CACGA	2	10	320938	320947	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_010655	AAAAG	2	10	324855	324864	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010655	TCTTT	2	10	325469	325478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_010655	TTTTC	2	10	326148	326157	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010655	CTATC	2	10	326316	326325	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_010655	AGCGG	2	10	334015	334024	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010655	CCGCA	2	10	342976	342985	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
57	NC_010655	CCCCG	2	10	374788	374797	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
58	NC_010655	CGGGA	2	10	374816	374825	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010655	TTTTC	2	10	379079	379088	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010655	GAAAA	2	10	379129	379138	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010655	CCACG	2	10	390503	390512	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_010655	CAAGT	2	10	402892	402901	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_010655	CAAGG	2	10	409787	409796	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010655	AGAAA	2	10	410008	410017	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010655	ATTCG	2	10	410419	410428	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010655	TAAAA	2	10	412947	412956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010655	CCGGG	2	10	413008	413017	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_010655	TTTCC	2	10	419308	419317	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_010655	GCCTT	2	10	438837	438846	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_010655	AAATA	2	10	442140	442149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010655	AAGGA	2	10	442668	442677	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010655	GTTCC	2	10	442992	443001	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_010655	CCTTC	2	10	460625	460634	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
74	NC_010655	GCGCC	2	10	491523	491532	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_010655	TGTTT	2	10	513244	513253	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010655	CTGCT	2	10	518139	518148	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_010655	TGGAT	2	10	522768	522777	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010655	CCCCG	2	10	531495	531504	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
79	NC_010655	GAAAG	2	10	558627	558636	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010655	TAAAA	2	10	568808	568817	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010655	ATGCT	2	10	593631	593640	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_010655	CGGAG	2	10	600198	600207	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_010655	CGGAA	2	10	600516	600525	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010655	AAGGC	2	10	624615	624624	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_010655	TTTCC	2	10	628343	628352	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_010655	CATCA	2	10	638420	638429	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_010655	AAATC	2	10	640166	640175	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_010655	CCGGG	2	10	640183	640192	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_010655	TTTCC	2	10	641679	641688	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_010655	ATCAC	2	10	650867	650876	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_010655	TTTCC	2	10	658833	658842	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_010655	TACCT	2	10	666299	666308	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010655	ACACC	2	10	667640	667649	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
94	NC_010655	TTTTG	2	10	683965	683974	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010655	TCTTG	2	10	692093	692102	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010655	GCGGA	2	10	721892	721901	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
97	NC_010655	CCTTT	2	10	726836	726845	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_010655	AAACA	2	10	738457	738466	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_010655	GAAGA	2	10	739087	739096	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010655	TCCTT	2	10	783266	783275	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_010655	CAAGA	2	10	792386	792395	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_010655	GTTTT	2	10	795767	795776	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010655	TCTCC	2	10	804539	804548	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_010655	GCGCC	2	10	817240	817249	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_010655	AAATG	2	10	833335	833344	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010655	GAAAA	2	10	836185	836194	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010655	TAATT	2	10	840979	840988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010655	ATGCC	2	10	851747	851756	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_010655	TTCCC	2	10	858133	858142	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
110	NC_010655	TATAT	2	10	864691	864700	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010655	GAAAA	2	10	880482	880491	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010655	AAGAA	2	10	890438	890447	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010655	TTCCG	2	10	908759	908768	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_010655	CAAAA	2	10	914138	914147	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_010655	GCCGT	2	10	914317	914326	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_010655	AATTA	2	10	914628	914637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010655	ATGGC	2	10	917989	917998	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_010655	CGCGG	2	10	921101	921110	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_010655	CCTCC	2	10	922352	922361	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
120	NC_010655	GGGGA	2	10	940759	940768	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010655	CCGCC	2	10	940777	940786	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
122	NC_010655	AAAAG	2	10	944259	944268	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010655	CTTCC	2	10	957179	957188	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_010655	CAATC	2	10	983758	983767	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_010655	AATGG	2	10	986062	986071	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010655	TCGTG	2	10	990946	990955	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_010655	GTCAG	2	10	991070	991079	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_010655	CAGAG	2	10	992549	992558	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_010655	TTCTT	2	10	995209	995218	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010655	GGAGC	2	10	997350	997359	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_010655	TTTAT	2	10	1016170	1016179	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010655	TATAA	2	10	1029942	1029951	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010655	AAGGG	2	10	1034077	1034086	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010655	AAAAG	2	10	1041588	1041597	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010655	ATGGT	2	10	1043577	1043586	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010655	AATGC	2	10	1057212	1057221	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_010655	ATGAT	2	10	1066264	1066273	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010655	GGCGC	2	10	1066859	1066868	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_010655	AATGA	2	10	1068361	1068370	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010655	GCCGG	2	10	1069977	1069986	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_010655	GCCGT	2	10	1077348	1077357	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_010655	GATTT	2	10	1091383	1091392	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010655	TGCAG	2	10	1098227	1098236	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_010655	CCTAT	2	10	1106825	1106834	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_010655	CCTGC	2	10	1106844	1106853	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
146	NC_010655	CGTGC	2	10	1153924	1153933	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
147	NC_010655	CAAGG	2	10	1165827	1165836	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_010655	TTTTC	2	10	1169754	1169763	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_010655	GGGGC	2	10	1182919	1182928	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
150	NC_010655	CGGGG	2	10	1187608	1187617	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
151	NC_010655	ATGTT	2	10	1193752	1193761	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_010655	GCCGG	2	10	1199782	1199791	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
154	NC_010655	CTGTT	2	10	1199852	1199861	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_010655	AAAAG	2	10	1295673	1295682	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010655	GGATT	2	10	1296078	1296087	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010655	ATCCA	2	10	1296090	1296099	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
164	NC_010655	AAATA	2	10	1296210	1296219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010655	TCTGC	2	10	1296412	1296421	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
166	NC_010655	CAATT	2	10	1318000	1318009	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_010655	GGAGG	2	10	1441613	1441622	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
186	NC_010655	GGGCA	2	10	1451036	1451045	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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198	NC_010655	TCTTG	2	10	1544116	1544125	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
199	NC_010655	TCGGC	2	10	1562143	1562152	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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274	NC_010655	CTGGA	2	10	2079446	2079455	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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282	NC_010655	CCGTT	2	10	2160439	2160448	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
283	NC_010655	GGGTA	2	10	2161772	2161781	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
284	NC_010655	AGGAA	2	10	2177945	2177954	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_010655	AAGGA	2	10	2215965	2215974	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_010655	TCCAA	2	10	2525709	2525718	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
332	NC_010655	TCCTA	2	10	2525784	2525793	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
333	NC_010655	TTTCT	2	10	2552698	2552707	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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341	NC_010655	GGCAT	2	10	2608194	2608203	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
342	NC_010655	TCCGC	2	10	2629008	2629017	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
343	NC_010655	CGGCG	2	10	2649016	2649025	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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345	NC_010655	GCCCC	2	10	2650786	2650795	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.