MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii AYE plasmid p3ABAYE

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010404	ATTA	2	8	3	10	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010404	TAGA	2	8	52	59	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010404	ATTT	2	8	219	226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010404	GTTT	2	8	283	290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010404	ATTG	2	8	487	494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010404	TATT	2	8	558	565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010404	TGAT	2	8	3094	3101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010404	TAAA	2	8	5965	5972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010404	AGGC	2	8	6389	6396	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010404	TGAC	2	8	6438	6445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010404	TAAA	2	8	6526	6533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010404	AAGC	2	8	6849	6856	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010404	AATT	2	8	8189	8196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010404	ATTT	2	8	8220	8227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010404	GATT	2	8	9660	9667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010404	CTTT	2	8	10484	10491	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010404	TCAC	2	8	10563	10570	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010404	TAAA	2	8	12273	12280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010404	AATT	2	8	12314	12321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010404	TTTC	3	12	13057	13068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010404	TTTA	2	8	14999	15006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010404	TAAT	2	8	15119	15126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010404	TAAT	2	8	15760	15767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010404	CCTT	2	8	17334	17341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010404	AGGA	2	8	17361	17368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010404	TAGA	2	8	19797	19804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010404	TTTA	2	8	19841	19848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010404	TAAA	2	8	19894	19901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010404	TTAT	2	8	20522	20529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010404	AGAT	2	8	21605	21612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010404	CATG	2	8	21648	21655	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010404	TCAT	2	8	21656	21663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010404	CATG	2	8	21670	21677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010404	CAAA	2	8	23314	23321	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010404	TAAA	2	8	23772	23779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010404	GATT	2	8	29075	29082	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010404	TTGC	2	8	29386	29393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010404	GTTA	2	8	31942	31949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010404	ATTT	2	8	37085	37092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010404	ATTG	2	8	39377	39384	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010404	AAAT	2	8	39387	39394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010404	TTAA	2	8	39499	39506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010404	ATTA	2	8	39655	39662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010404	TTCC	2	8	39903	39910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010404	TTGT	2	8	40019	40026	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010404	GATC	2	8	40052	40059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_010404	CCTA	2	8	40132	40139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010404	ATTA	2	8	42075	42082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010404	TGTT	2	8	42201	42208	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010404	ATTT	2	8	44143	44150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010404	AGCA	2	8	44469	44476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010404	TAAA	2	8	44836	44843	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010404	ATTT	2	8	44922	44929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010404	TACA	2	8	44946	44953	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010404	GAAT	2	8	48015	48022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010404	GTCA	2	8	48206	48213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_010404	CCAG	2	8	48433	48440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010404	AATC	2	8	48450	48457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010404	CTAA	2	8	48905	48912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010404	TAAT	2	8	63441	63448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010404	ACTT	2	8	69941	69948	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010404	ATCG	2	8	70058	70065	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010404	CTTA	2	8	70072	70079	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010404	ATAA	2	8	70347	70354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010404	AATC	2	8	74343	74350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010404	TAAA	2	8	74987	74994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010404	TAAT	2	8	75892	75899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010404	TTTA	2	8	77029	77036	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010404	CTTA	2	8	77089	77096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010404	TAAA	2	8	79902	79909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010404	GTGG	2	8	80711	80718	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010404	TACT	2	8	87172	87179	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010404	AGCC	2	8	87268	87275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010404	ATTG	2	8	87856	87863	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010404	TAGA	2	8	88150	88157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010404	AGTA	2	8	88549	88556	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010404	CATT	2	8	88779	88786	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010404	TTGC	2	8	89095	89102	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010404	TACC	2	8	89372	89379	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_010404	ACAT	2	8	90846	90853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010404	TAGT	2	8	91078	91085	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010404	AAAC	2	8	91534	91541	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010404	GATA	2	8	91787	91794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010404	TTGA	2	8	92294	92301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010404	TAGC	2	8	94384	94391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010404	ATTA	2	8	94406	94413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.