MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 1040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010278	ATTT	2	8	3789	3796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010278	AAAT	2	8	4514	4521	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010278	ATTA	2	8	5677	5684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010278	TTAT	2	8	5735	5742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010278	CGTT	2	8	6102	6109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010278	TCAA	2	8	6984	6991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_010278	AAGC	2	8	9353	9360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010278	CAAA	2	8	9422	9429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010278	ATAA	2	8	10038	10045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010278	CTTT	2	8	14928	14935	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010278	AAAG	2	8	14944	14951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010278	AAAG	2	8	14957	14964	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010278	GCAA	2	8	15033	15040	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010278	AATA	2	8	15108	15115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010278	AGAT	2	8	15122	15129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010278	CTTT	2	8	20338	20345	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010278	GTCC	2	8	24030	24037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010278	ATTA	2	8	24090	24097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010278	ATTT	2	8	36991	36998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010278	ATTT	2	8	38837	38844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010278	TATG	2	8	40812	40819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010278	TAAA	2	8	46616	46623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010278	AATC	2	8	51004	51011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010278	TGTT	2	8	51013	51020	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010278	AATA	2	8	57215	57222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010278	GAAT	2	8	59361	59368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010278	TTAA	2	8	60595	60602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010278	GAAT	2	8	62390	62397	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010278	TAAA	2	8	65854	65861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010278	GCTT	2	8	66412	66419	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010278	GCTT	2	8	68010	68017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010278	TGAA	2	8	68332	68339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010278	AGGG	2	8	68590	68597	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010278	AGAA	2	8	69511	69518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010278	GCCT	2	8	69703	69710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010278	TTTA	2	8	69788	69795	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010278	GAAA	2	8	69874	69881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010278	GTAC	2	8	70541	70548	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010278	GTCC	2	8	70904	70911	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010278	CGTC	2	8	70982	70989	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010278	AAAG	2	8	71105	71112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010278	GGTG	2	8	71496	71503	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010278	GCTG	2	8	71784	71791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010278	TGCC	2	8	71851	71858	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010278	AAGC	2	8	72356	72363	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010278	TTGA	2	8	75257	75264	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010278	GAAA	2	8	82656	82663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010278	TAAG	2	8	87309	87316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010278	GTTA	2	8	90892	90899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010278	TTCA	2	8	91973	91980	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010278	TAAA	2	8	92894	92901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010278	GCGA	2	8	95749	95756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_010278	CTTT	2	8	99005	99012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010278	AAAG	2	8	99021	99028	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010278	CTTT	2	8	99171	99178	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010278	ATTT	2	8	102615	102622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010278	AAGA	2	8	104731	104738	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010278	ATTT	2	8	104776	104783	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010278	GGTA	2	8	110270	110277	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010278	GCAA	2	8	111764	111771	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010278	ACGG	2	8	112107	112114	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010278	AAAG	2	8	112587	112594	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010278	ACAA	2	8	113171	113178	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_010278	AGTC	2	8	114190	114197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010278	GAGT	2	8	114335	114342	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010278	GTGA	2	8	115060	115067	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010278	AACC	2	8	117090	117097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010278	ACGG	2	8	118003	118010	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010278	GGAC	2	8	118107	118114	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010278	GCAA	2	8	118591	118598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010278	AAGA	2	8	118906	118913	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010278	TATC	2	8	119069	119076	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010278	CAAC	2	8	119750	119757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010278	ACAA	2	8	120002	120009	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010278	ACGT	2	8	120848	120855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010278	TGAA	2	8	121161	121168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010278	TTCT	2	8	128016	128023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010278	AAAT	2	8	133139	133146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010278	ATTC	2	8	133462	133469	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010278	TTTA	2	8	135089	135096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010278	GTTT	2	8	136433	136440	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010278	TTAT	2	8	136592	136599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010278	TAAA	2	8	136674	136681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010278	CGGT	2	8	137315	137322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010278	CTTT	2	8	141114	141121	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010278	TTTA	2	8	141160	141167	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010278	ATCA	2	8	141205	141212	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010278	ATTC	2	8	147500	147507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_010278	TATC	2	8	147782	147789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010278	TATC	2	8	157024	157031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010278	ATAA	2	8	165124	165131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010278	TTTA	2	8	165209	165216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010278	TAAT	2	8	165275	165282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010278	ACTA	2	8	165372	165379	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010278	ATTT	2	8	169030	169037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010278	TCTA	2	8	169202	169209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010278	GTTT	2	8	175214	175221	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010278	GGGC	2	8	175257	175264	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010278	TTTA	2	8	181887	181894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010278	ATTT	2	8	184316	184323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010278	ATCT	2	8	193335	193342	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010278	TTAA	2	8	195236	195243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010278	TAGT	2	8	195305	195312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010278	AATA	2	8	200981	200988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010278	ACAA	2	8	201025	201032	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010278	GATA	2	8	201266	201273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010278	TTTC	2	8	203928	203935	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010278	ATTT	2	8	204017	204024	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010278	TTAT	2	8	204346	204353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010278	ACAA	2	8	209376	209383	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010278	AATA	2	8	210089	210096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010278	GATT	2	8	210160	210167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010278	AAGC	2	8	212996	213003	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010278	TTTA	2	8	225822	225829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010278	TAAA	2	8	231431	231438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010278	TTAT	2	8	236934	236941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010278	CAGT	2	8	236983	236990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010278	TTCC	2	8	237958	237965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010278	AAAT	2	8	239131	239138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010278	TTTA	2	8	243054	243061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010278	ATTG	2	8	243083	243090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010278	TTTA	2	8	245535	245542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010278	TAAT	2	8	247397	247404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010278	TCCG	2	8	248057	248064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010278	GTTT	2	8	254308	254315	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010278	TAAT	2	8	256845	256852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010278	TAAA	2	8	256861	256868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010278	TGCT	2	8	256870	256877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010278	TAAT	2	8	257097	257104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010278	TAAT	2	8	258006	258013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010278	TACT	2	8	263018	263025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010278	ATTA	2	8	263030	263037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010278	ACGA	2	8	266206	266213	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010278	TAAA	2	8	266272	266279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010278	TTCG	2	8	268506	268513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_010278	CTTT	2	8	269543	269550	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010278	TTTA	2	8	269651	269658	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010278	ACTT	2	8	270152	270159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010278	ACCA	2	8	270649	270656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010278	AATA	2	8	272235	272242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010278	AAAG	2	8	272373	272380	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010278	AGCA	2	8	273375	273382	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010278	AAAT	2	8	275029	275036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010278	CGTT	2	8	275134	275141	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010278	AAGC	2	8	275838	275845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_010278	TTAA	2	8	276112	276119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010278	GTTT	2	8	277031	277038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010278	AATA	2	8	278036	278043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010278	GCTT	2	8	281705	281712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010278	TGAA	2	8	282029	282036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_010278	AGAA	2	8	283208	283215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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