MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB7

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009932	GTTC	2	8	399	406	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009932	GTTT	2	8	521	528	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009932	TCTT	2	8	738	745	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_009932	TGGT	2	8	1087	1094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009932	AGGT	2	8	1212	1219	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009932	AGAA	3	12	1550	1561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009932	AAAT	2	8	2789	2796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009932	TAAT	2	8	2819	2826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009932	AATT	2	8	2990	2997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009932	TAAT	2	8	3019	3026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009932	AGGT	2	8	7656	7663	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009932	TTGA	2	8	10849	10856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009932	CGAC	2	8	13221	13228	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009932	AGGC	2	8	14549	14556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009932	CAGG	2	8	18313	18320	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009932	CTGC	2	8	18529	18536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009932	ATAG	2	8	18538	18545	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009932	TTGA	2	8	18710	18717	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009932	GAAC	2	8	18769	18776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009932	GTTG	2	8	20328	20335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009932	CATA	2	8	20792	20799	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009932	ATTG	2	8	21113	21120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009932	GCTT	2	8	31323	31330	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_009932	CAAT	2	8	37075	37082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009932	TAAC	2	8	37093	37100	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009932	TAAT	2	8	38274	38281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009932	TTTC	2	8	39334	39341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009932	CAGC	2	8	43957	43964	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009932	AGAA	2	8	47657	47664	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009932	CTCA	2	8	47746	47753	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_009932	TCAA	2	8	49400	49407	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009932	TTGA	2	8	49423	49430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009932	ACTC	2	8	53575	53582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009932	TGAG	2	8	53843	53850	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009932	AGTG	2	8	57698	57705	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009932	TAGA	2	8	59866	59873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009932	ATCA	2	8	59913	59920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009932	AGCT	2	8	59966	59973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_009932	TCCC	2	8	72886	72893	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_009932	GGGA	2	8	72906	72913	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009932	ACTA	2	8	73042	73049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009932	TAAG	2	8	73824	73831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009932	CCCT	2	8	76113	76120	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_009932	GGGA	2	8	76132	76139	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009932	TAGA	2	8	76986	76993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009932	CTTT	2	8	81319	81326	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009932	TTAT	2	8	81474	81481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009932	CAAT	2	8	87872	87879	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009932	CCTA	2	8	87923	87930	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009932	GATA	2	8	90799	90806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009932	CAAT	2	8	92620	92627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009932	AGGC	2	8	94009	94016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009932	GAAG	2	8	100547	100554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009932	TTGG	2	8	103954	103961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009932	GCAG	2	8	106408	106415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009932	TTGG	2	8	108712	108719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009932	CATA	2	8	108823	108830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009932	ATGA	2	8	108894	108901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009932	ACTC	2	8	109354	109361	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009932	TTGA	2	8	109477	109484	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009932	AGGA	2	8	109922	109929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009932	AGTC	2	8	110461	110468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009932	TCCA	2	8	110519	110526	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009932	GGGT	2	8	112207	112214	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009932	ATTG	2	8	112215	112222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009932	ATTT	2	8	112348	112355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009932	ATTT	2	8	112754	112761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009932	TAGA	2	8	112777	112784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009932	CTGG	2	8	123099	123106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009932	GAAT	2	8	123585	123592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009932	CCAT	2	8	125744	125751	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009932	CTGT	2	8	129613	129620	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009932	GAAC	2	8	130126	130133	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009932	AACT	2	8	132244	132251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009932	AAAC	2	8	132883	132890	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009932	AGAA	2	8	133289	133296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009932	TCAA	2	8	141194	141201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009932	TATT	2	8	141728	141735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009932	ATTT	2	8	146124	146131	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009932	TTAT	2	8	147196	147203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009932	CTGA	2	8	149164	149171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009932	CGGT	2	8	149665	149672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009932	TGGC	2	8	149788	149795	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009932	ATTC	2	8	154588	154595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.