MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB6

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009931	CTTTT	2	10	13948	13957	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009931	AGTGT	2	10	16812	16821	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009931	GAGAG	2	10	21852	21861	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009931	ACGGT	2	10	31656	31665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_009931	AAATG	2	10	46624	46633	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009931	GTCTT	2	10	46643	46652	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009931	GCGAT	2	10	55677	55686	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009931	CATCA	2	10	65139	65148	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_009931	TTTGG	2	10	66555	66564	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009931	ATGAT	2	10	66590	66599	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009931	GTGAG	2	10	73970	73979	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009931	CGTAA	2	10	76379	76388	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009931	CGAAT	2	10	81215	81224	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009931	CCTCA	2	10	89066	89075	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_009931	AGCTG	2	10	99795	99804	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009931	TTAAT	2	10	111569	111578	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009931	CAATG	2	10	135393	135402	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009931	TGCTG	2	10	158598	158607	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009931	AGAAT	2	10	161330	161339	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009931	TTCAG	2	10	163245	163254	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009931	TTGAG	2	10	163503	163512	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009931	GAAAG	2	10	164760	164769	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009931	ATCGC	2	10	168988	168997	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.