MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009928	TGCG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009928	TTGG	2	8	2433	2440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009928	GGAG	2	8	3273	3280	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009928	TTAG	2	8	5740	5747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009928	ATTT	2	8	5837	5844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009928	AGAA	2	8	6288	6295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009928	GAAA	2	8	6317	6324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009928	AGGC	2	8	6838	6845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009928	GAAT	2	8	10395	10402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009928	TCAG	2	8	10482	10489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009928	TTTG	2	8	12676	12683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009928	TCCA	2	8	12929	12936	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009928	TAGA	2	8	14394	14401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009928	TTTG	2	8	16707	16714	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009928	GTAT	2	8	16785	16792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009928	TTGG	2	8	22512	22519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009928	CAGA	2	8	22973	22980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009928	AAAT	2	8	23072	23079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009928	TAAA	2	8	23203	23210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009928	ATAA	2	8	23396	23403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009928	TAGG	2	8	29124	29131	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009928	AGGG	2	8	30020	30027	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009928	AATG	2	8	30090	30097	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009928	TGAT	2	8	30166	30173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009928	GTGG	2	8	41039	41046	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009928	CAGG	2	8	42914	42921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009928	GATC	2	8	47231	47238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009928	TGAT	2	8	49295	49302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009928	AAAT	2	8	49544	49551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009928	AATA	2	8	49561	49568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009928	TCAA	2	8	57654	57661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009928	GACT	2	8	58622	58629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009928	AAAC	2	8	59788	59795	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009928	AGGA	2	8	59929	59936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009928	ATAA	2	8	64602	64609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009928	GATT	2	8	64858	64865	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009928	TTCT	2	8	64999	65006	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009928	ATTT	2	8	67093	67100	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009928	ACCT	2	8	67307	67314	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009928	TAAA	2	8	72040	72047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009928	TGGG	2	8	72057	72064	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009928	CTTA	2	8	78270	78277	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009928	ATCA	2	8	79847	79854	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009928	TAGA	2	8	80755	80762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009928	GTCC	2	8	81540	81547	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009928	GCTA	2	8	82663	82670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009928	GATG	2	8	84021	84028	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009928	ATTT	2	8	86528	86535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009928	ATCA	2	8	88155	88162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009928	GAAT	2	8	89717	89724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009928	GATG	2	8	90845	90852	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009928	AAAC	2	8	92592	92599	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009928	CTTC	2	8	93688	93695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009928	CTTA	2	8	94222	94229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_009928	TCCT	2	8	94265	94272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009928	ATTA	2	8	94323	94330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009928	ATTT	2	8	95063	95070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009928	CTTG	2	8	95110	95117	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009928	TACT	2	8	95370	95377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009928	TAAT	2	8	95587	95594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009928	AACC	2	8	102376	102383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009928	ATTG	2	8	104284	104291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009928	CATA	2	8	104406	104413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009928	TAAT	2	8	104693	104700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009928	TAAC	2	8	106693	106700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009928	TGAG	2	8	108910	108917	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009928	AGGA	2	8	110008	110015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009928	GTTT	2	8	110138	110145	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009928	GCTT	2	8	114706	114713	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_009928	CAAG	2	8	116014	116021	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009928	AATT	2	8	119788	119795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009928	TCTT	2	8	120178	120185	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_009928	ATTT	2	8	120187	120194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009928	GACT	2	8	121627	121634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009928	ACAG	2	8	123102	123109	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009928	ACCC	2	8	123166	123173	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_009928	GGTG	2	8	123721	123728	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009928	GCTC	2	8	123934	123941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009928	TTTA	2	8	125282	125289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009928	TTAA	2	8	126421	126428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009928	ACCG	2	8	126590	126597	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009928	CAAG	2	8	126626	126633	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009928	CTCA	2	8	128441	128448	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009928	AGTG	2	8	129299	129306	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009928	GAAA	2	8	129667	129674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009928	TTGC	2	8	135577	135584	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009928	GTTG	2	8	135589	135596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009928	AAAT	2	8	135611	135618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009928	AGCG	2	8	135710	135717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009928	CAAT	2	8	136455	136462	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_009928	GCTT	2	8	136884	136891	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009928	TGGA	2	8	137792	137799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009928	TTGA	2	8	137924	137931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009928	AATA	2	8	141735	141742	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009928	TAAG	2	8	141928	141935	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009928	TTTG	2	8	142899	142906	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009928	ATTC	2	8	145853	145860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009928	AACA	2	8	147051	147058	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009928	ACCC	2	8	147588	147595	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_009928	TACT	2	8	147630	147637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009928	AGTC	2	8	147698	147705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009928	GATG	2	8	148571	148578	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009928	TCAC	2	8	150565	150572	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009928	AGGC	2	8	151537	151544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009928	AATC	2	8	153586	153593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009928	TTAA	2	8	154214	154221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009928	AGCT	2	8	155298	155305	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009928	ATCA	2	8	155631	155638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009928	TCAT	2	8	155730	155737	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009928	CTTC	2	8	155822	155829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009928	AATT	2	8	155835	155842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009928	CTAA	2	8	155867	155874	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_009928	AGTA	2	8	158234	158241	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009928	GGGT	2	8	158392	158399	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009928	TGTT	2	8	158929	158936	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009928	TTGC	2	8	160575	160582	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009928	TTAA	2	8	160885	160892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009928	ATTC	2	8	161004	161011	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_009928	CTGA	2	8	163830	163837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009928	TATT	2	8	164179	164186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009928	TTAT	2	8	164220	164227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009928	TTAT	2	8	164231	164238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009928	TAAA	2	8	165063	165070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009928	GATA	2	8	165196	165203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009928	GTTT	2	8	165307	165314	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009928	AGGA	2	8	165481	165488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009928	TAGT	2	8	166053	166060	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009928	GTGA	2	8	166377	166384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009928	GCCT	2	8	167332	167339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009928	CTTG	2	8	167458	167465	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009928	CAAT	2	8	167641	167648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009928	TCCC	2	8	171239	171246	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_009928	ATTA	2	8	171314	171321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009928	TCAC	2	8	171767	171774	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009928	TTGA	2	8	171793	171800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009928	TCTT	2	8	172131	172138	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009928	TTAC	2	8	172451	172458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009928	GTTC	2	8	173307	173314	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009928	AGCT	2	8	173526	173533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009928	AGGA	2	8	173595	173602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009928	CATC	2	8	179817	179824	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009928	CATG	2	8	180080	180087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009928	AGAA	2	8	180192	180199	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009928	TGGA	2	8	181022	181029	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009928	ATTA	2	8	181749	181756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009928	TTCT	2	8	181802	181809	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009928	ACAA	2	8	181888	181895	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009928	GATG	2	8	182177	182184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009928	AGTT	2	8	184923	184930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009928	TATT	2	8	185137	185144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009928	CAGA	2	8	187725	187732	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_009928	ATCC	2	8	188163	188170	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_009928	AATC	2	8	189533	189540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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155	NC_009928	AACT	2	8	191194	191201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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164	NC_009928	CGAT	2	8	197470	197477	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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171	NC_009928	TATG	2	8	204084	204091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
172	NC_009928	TTTA	2	8	206843	206850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_009928	AAGA	2	8	220911	220918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_009928	AGCA	2	8	226678	226685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
192	NC_009928	TTAA	2	8	231532	231539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_009928	AATA	2	8	231650	231657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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217	NC_009928	GAAT	2	8	272823	272830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.