MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB2

Total Repeats: 192

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009927	AATC	2	8	16307	16314	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009927	ACTG	2	8	16318	16325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009927	TTAA	2	8	17804	17811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009927	TCAT	2	8	18751	18758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009927	AGAA	2	8	18770	18777	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009927	GGCA	2	8	22296	22303	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009927	ATTC	2	8	42318	42325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009927	TCAA	2	8	44866	44873	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009927	ACGA	2	8	47940	47947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_009927	GACT	2	8	47993	48000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009927	AATT	2	8	51172	51179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009927	AAAT	2	8	51263	51270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009927	AAAT	2	8	55344	55351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009927	TACT	2	8	56025	56032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009927	CTGA	2	8	56906	56913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009927	AATG	2	8	57448	57455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009927	TCAA	2	8	57502	57509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009927	TTAA	2	8	60434	60441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009927	ACTG	2	8	61165	61172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009927	CCAG	2	8	61891	61898	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009927	CCAA	2	8	64309	64316	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009927	TGAT	2	8	64393	64400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009927	AAAT	2	8	64848	64855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009927	TTAA	2	8	64871	64878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009927	TTAA	2	8	65116	65123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009927	ATGG	2	8	66926	66933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009927	TCTA	2	8	66965	66972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009927	GCCC	2	8	67111	67118	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_009927	TATT	2	8	68534	68541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009927	CTAT	2	8	69306	69313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009927	GTCT	2	8	73154	73161	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009927	ATTT	3	12	79372	79383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009927	CATT	2	8	80597	80604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009927	AATA	2	8	80681	80688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009927	ATGG	2	8	87268	87275	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009927	GAAT	2	8	91803	91810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009927	TCTT	2	8	91871	91878	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_009927	TCAC	2	8	91908	91915	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009927	TCAG	2	8	94888	94895	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009927	ACAG	2	8	96496	96503	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009927	TATT	2	8	97975	97982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009927	ACAA	2	8	101469	101476	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009927	TTAC	2	8	101595	101602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009927	ATTT	2	8	101760	101767	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009927	CAGC	2	8	102731	102738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009927	TGGT	2	8	104785	104792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009927	AATT	2	8	104833	104840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009927	GTTA	2	8	105254	105261	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009927	CCAT	2	8	105386	105393	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009927	TCAT	2	8	105625	105632	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009927	GACT	2	8	106269	106276	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009927	ATCA	2	8	108274	108281	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009927	TTTA	2	8	109660	109667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009927	ATTT	2	8	111024	111031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009927	TTAA	2	8	111319	111326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009927	TCAT	2	8	111334	111341	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009927	TGCC	2	8	112878	112885	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009927	TTGC	2	8	112962	112969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009927	AAAG	2	8	116977	116984	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009927	ATCG	2	8	125584	125591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009927	ATTG	2	8	125913	125920	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009927	GGCA	2	8	126511	126518	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009927	TTTC	2	8	126681	126688	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009927	CATC	2	8	127365	127372	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009927	CCTT	2	8	127946	127953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009927	AATA	2	8	128091	128098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009927	GCTT	2	8	128683	128690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009927	CACC	2	8	133149	133156	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_009927	ATTT	2	8	133158	133165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009927	ATGA	2	8	136247	136254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009927	GGAA	2	8	144227	144234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009927	TTGA	2	8	147324	147331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009927	AACG	2	8	148266	148273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009927	ATCA	2	8	149434	149441	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009927	TATT	2	8	151634	151641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009927	TCTT	2	8	151879	151886	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_009927	GTTC	2	8	158051	158058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009927	ACAG	2	8	158557	158564	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_009927	TAAA	2	8	160662	160669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009927	AATC	2	8	163830	163837	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009927	AATC	2	8	164185	164192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009927	AATC	2	8	164285	164292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_009927	CTTA	2	8	164363	164370	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009927	ATAG	2	8	164474	164481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009927	GATT	2	8	164493	164500	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009927	TGAT	2	8	164658	164665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009927	GCTT	2	8	164787	164794	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009927	TTTA	2	8	165077	165084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009927	CAGT	2	8	170436	170443	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009927	CACC	2	8	170657	170664	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_009927	CATT	2	8	172275	172282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009927	CTAA	2	8	172563	172570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009927	CCTG	2	8	176177	176184	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009927	CGTC	2	8	176225	176232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009927	CCCT	2	8	176239	176246	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_009927	TTCA	2	8	178529	178536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009927	TATT	2	8	178611	178618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009927	CACT	2	8	179471	179478	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009927	CAAA	2	8	180518	180525	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009927	TTGT	2	8	181318	181325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009927	AATA	2	8	181739	181746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009927	TGTT	2	8	186636	186643	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009927	GATT	2	8	186919	186926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009927	AGCC	2	8	188056	188063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009927	CTTT	2	8	188386	188393	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009927	CAGC	2	8	193046	193053	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009927	CTAT	2	8	197814	197821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009927	CCTT	2	8	204307	204314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009927	TCCT	2	8	208014	208021	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009927	TCAA	2	8	208093	208100	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009927	CCAT	2	8	208583	208590	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009927	TCCA	2	8	209226	209233	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_009927	CCCT	2	8	219084	219091	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_009927	TGAC	2	8	225829	225836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009927	ATCT	2	8	225914	225921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_009927	TAAA	2	8	229866	229873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009927	ACTA	2	8	230012	230019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009927	GATT	2	8	231683	231690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009927	TTTA	2	8	232098	232105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009927	TAGT	3	12	232231	232242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009927	TAAA	2	8	233092	233099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009927	TGTA	2	8	233100	233107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009927	TAAT	2	8	234723	234730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009927	ATTT	2	8	236381	236388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009927	TTCT	2	8	243901	243908	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009927	TCAA	2	8	251674	251681	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009927	TTTA	2	8	254500	254507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009927	TTCC	2	8	257668	257675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009927	ATGC	2	8	258131	258138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_009927	TTAT	2	8	258449	258456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009927	AAAT	2	8	258493	258500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009927	AAAT	2	8	264854	264861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009927	TGCA	2	8	266838	266845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_009927	CTTC	2	8	266981	266988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009927	TGCA	2	8	267014	267021	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009927	TGCA	2	8	267094	267101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009927	TCAA	2	8	267377	267384	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_009927	TTGT	2	8	269361	269368	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009927	CTGA	2	8	269643	269650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009927	TCAT	2	8	271514	271521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009927	ACAT	2	8	272626	272633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009927	TCAA	2	8	275281	275288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009927	TATC	2	8	277767	277774	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_009927	ATGG	2	8	278059	278066	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009927	CTAA	2	8	279306	279313	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009927	AGGA	3	12	287995	288006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009927	ACCT	2	8	291326	291333	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_009927	TTTC	2	8	293931	293938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009927	AGAA	2	8	294503	294510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009927	ACTA	2	8	298746	298753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_009927	ATTT	2	8	299568	299575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.