MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB1

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009926	TGCG	2	8	1503	1510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009926	TCAT	2	8	2736	2743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_009926	TTGA	2	8	4868	4875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009926	TTAG	2	8	5960	5967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009926	TGGT	2	8	11235	11242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009926	CATC	2	8	18273	18280	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009926	TTGC	2	8	22964	22971	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009926	CAGG	2	8	36706	36713	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009926	GAAA	2	8	36891	36898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009926	CATA	2	8	39321	39328	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009926	TAAA	2	8	47020	47027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009926	CTAA	2	8	48017	48024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009926	ATGT	2	8	48057	48064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009926	ATTT	2	8	50075	50082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009926	ATCT	2	8	50289	50296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_009926	AAGA	2	8	52740	52747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009926	CATC	2	8	55166	55173	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009926	ATCC	2	8	55672	55679	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009926	TCAA	2	8	56313	56320	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_009926	GATT	2	8	59314	59321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009926	TTCT	2	8	59455	59462	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009926	TAAA	2	8	61373	61380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009926	ATTT	2	8	64487	64494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009926	AAGA	2	8	64805	64812	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009926	AGGG	2	8	67424	67431	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009926	ACTG	2	8	67979	67986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_009926	CATA	2	8	68092	68099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009926	AGTT	2	8	70848	70855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009926	TGAG	2	8	72964	72971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009926	TCAA	2	8	74819	74826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009926	TTGA	2	8	74842	74849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009926	TGAG	2	8	76496	76503	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009926	TTTC	2	8	76584	76591	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_009926	AATA	2	8	77759	77766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009926	AGTA	2	8	77973	77980	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009926	AATT	2	8	80577	80584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009926	ATGG	2	8	80589	80596	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009926	AGTT	2	8	83893	83900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009926	AAAC	2	8	91297	91304	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009926	GATA	2	8	91558	91565	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009926	AATA	2	8	92054	92061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009926	TTTG	2	8	93239	93246	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009926	TGGA	2	8	98745	98752	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009926	TTAA	2	8	98982	98989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009926	TCAT	2	8	99406	99413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_009926	TAAC	2	8	99801	99808	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_009926	TTTA	2	8	100738	100745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009926	AATA	2	8	102101	102108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009926	TTTC	2	8	102194	102201	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009926	AACA	2	8	103014	103021	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009926	TTTA	2	8	112280	112287	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009926	TAGG	2	8	113824	113831	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009926	TTTA	2	8	120159	120166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009926	AATA	3	12	120176	120187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009926	TACT	2	8	120576	120583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_009926	GTAG	2	8	124674	124681	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009926	ATGG	2	8	125636	125643	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009926	AGTT	2	8	126569	126576	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009926	CTTA	2	8	129682	129689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009926	GTCA	2	8	131574	131581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009926	CAAA	2	8	132632	132639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009926	GGAA	2	8	140951	140958	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009926	GACG	2	8	144809	144816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_009926	CAAT	2	8	146325	146332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009926	CTAC	2	8	149524	149531	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009926	GGAA	2	8	158423	158430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009926	ACAA	2	8	158756	158763	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009926	GAGC	2	8	159754	159761	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009926	AGGT	2	8	162575	162582	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009926	AATC	2	8	169272	169279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_009926	AGCT	2	8	169317	169324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009926	TTGA	2	8	171706	171713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009926	GGTT	2	8	174506	174513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009926	TGAG	2	8	174675	174682	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009926	TGAG	2	8	174879	174886	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009926	TGGT	2	8	174902	174909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009926	CGTT	2	8	175538	175545	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009926	GAGT	2	8	179410	179417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009926	GTAA	2	8	180525	180532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009926	TGAC	2	8	181549	181556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_009926	GACT	2	8	181697	181704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_009926	AACC	2	8	181718	181725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009926	CGAT	2	8	182028	182035	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_009926	TATT	2	8	182411	182418	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009926	GAAT	2	8	185061	185068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009926	CTAA	2	8	185369	185376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009926	TGAC	2	8	185464	185471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009926	TCAA	2	8	185527	185534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009926	TACA	2	8	185607	185614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009926	GATT	2	8	188512	188519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009926	TCCT	2	8	191709	191716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009926	TTAT	2	8	193333	193340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009926	AATT	2	8	195176	195183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009926	GGTT	2	8	195240	195247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009926	TGGC	2	8	207061	207068	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_009926	CTGC	2	8	207246	207253	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009926	GTGG	2	8	207431	207438	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009926	TAGG	2	8	243746	243753	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009926	TTGG	2	8	254468	254475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009926	CCTG	2	8	254859	254866	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009926	CTGG	2	8	254950	254957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_009926	TTGC	2	8	255031	255038	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_009926	GAAA	2	8	257275	257282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009926	ATTC	2	8	257465	257472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009926	TCAT	2	8	257914	257921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009926	ATTC	2	8	260547	260554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_009926	GTCT	2	8	260568	260575	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009926	ATTG	2	8	260711	260718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009926	AATC	2	8	261521	261528	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_009926	CTGG	2	8	261944	261951	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_009926	GTGG	2	8	262858	262865	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009926	TGGA	2	8	263236	263243	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009926	TAAA	2	8	263344	263351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009926	GCTT	2	8	267211	267218	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009926	CAAC	2	8	268724	268731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009926	TAAT	2	8	271131	271138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009926	TTAA	2	8	271162	271169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009926	TATT	2	8	271245	271252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009926	GGGC	2	8	272780	272787	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
120	NC_009926	AGAA	2	8	278347	278354	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009926	TGAA	2	8	282143	282150	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009926	GTTA	2	8	282214	282221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009926	ACTA	2	8	288484	288491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009926	AATT	2	8	293652	293659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009926	ATTG	2	8	294335	294342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009926	ATCA	2	8	294411	294418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_009926	TAGA	2	8	301119	301126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009926	ATCA	2	8	301456	301463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009926	TATT	2	8	301478	301485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009926	GTGA	2	8	302045	302052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009926	TTCA	2	8	302134	302141	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009926	TTAG	2	8	303971	303978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009926	CACT	2	8	304522	304529	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009926	TCTT	2	8	309492	309499	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_009926	TGAG	2	8	309620	309627	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009926	TAAA	2	8	315512	315519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009926	TTGA	2	8	315520	315527	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009926	TAAT	2	8	317093	317100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009926	GGAG	3	12	324037	324048	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009926	ATCT	2	8	324845	324852	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_009926	GTTA	2	8	325456	325463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009926	GGCA	2	8	328084	328091	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009926	AATT	3	12	329783	329794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009926	TCCA	2	8	329905	329912	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009926	ACGG	2	8	330353	330360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_009926	TTCT	2	8	331249	331256	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_009926	TTTC	2	8	331785	331792	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009926	TGGA	2	8	334537	334544	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009926	GACC	2	8	335741	335748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009926	CACC	2	8	337541	337548	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
151	NC_009926	TTGG	2	8	338363	338370	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009926	AAAT	2	8	342078	342085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.