MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome

Total Repeats: 18491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009925	T	6	6	301582	301587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009925	CCT	2	6	301747	301752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_009925	AGG	2	6	301763	301768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_009925	AG	3	6	303216	303221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_009925	TTG	2	6	303225	303230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_009925	CT	3	6	303240	303245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_009925	TTA	2	6	303254	303259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009925	TC	3	6	303892	303897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_009925	TCT	2	6	303906	303911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_009925	TCCAT	2	10	303944	303953	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1011	NC_009925	TCT	2	6	305494	305499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_009925	CT	3	6	305548	305553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_009925	TCA	2	6	305554	305559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_009925	T	6	6	306776	306781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_009925	TTC	2	6	307864	307869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_009925	CTG	2	6	310411	310416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_009925	TAAA	2	8	310459	310466	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_009925	T	7	7	310467	310473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_009925	TTA	2	6	310504	310509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_009925	TC	4	8	310514	310521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_009925	AAT	2	6	310527	310532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_009925	TGG	2	6	312213	312218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_009925	AAT	2	6	312258	312263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_009925	TCTT	2	8	312306	312313	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_009925	A	7	7	312320	312326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_009925	GAA	2	6	312382	312387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_009925	TCT	2	6	312442	312447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_009925	AC	3	6	312467	312472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_009925	ATA	2	6	312506	312511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_009925	GTA	2	6	312514	312519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_009925	ATTG	3	12	312561	312572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_009925	GATTTT	2	12	312658	312669	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_009925	AGG	2	6	312827	312832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_009925	T	8	8	312860	312867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_009925	A	6	6	313006	313011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_009925	GAA	2	6	313046	313051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_009925	AGC	2	6	313137	313142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_009925	GT	3	6	313206	313211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_009925	TCA	2	6	313315	313320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_009925	T	6	6	313328	313333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_009925	GCT	2	6	313344	313349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_009925	AT	3	6	313381	313386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_009925	ATT	2	6	315360	315365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_009925	T	6	6	315364	315369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_009925	TAA	2	6	315379	315384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_009925	TGC	2	6	315966	315971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_009925	ACC	2	6	315999	316004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_009925	GAG	2	6	316957	316962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009925	CAA	2	6	316995	317000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_009925	TGC	2	6	317886	317891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_009925	AAC	2	6	317906	317911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_009925	AAC	3	9	317966	317974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_009925	CGTGT	2	10	317984	317993	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_009925	GT	4	8	317990	317997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_009925	AGA	2	6	318055	318060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009925	AGT	2	6	318698	318703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_009925	CGG	2	6	318709	318714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_009925	AAAAG	2	10	318750	318759	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009925	GCCATC	2	12	318783	318794	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_009925	GATT	2	8	319731	319738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_009925	TTC	2	6	319768	319773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_009925	CAACG	2	10	320436	320445	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1063	NC_009925	TGCCAA	2	12	321485	321496	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_009925	GTA	2	6	321559	321564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009925	TG	3	6	322155	322160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_009925	ATT	2	6	325668	325673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009925	CTT	2	6	325745	325750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_009925	ATT	2	6	326050	326055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009925	C	6	6	326073	326078	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1070	NC_009925	ATTT	2	8	326110	326117	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009925	GGGGT	2	10	326129	326138	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_009925	A	6	6	326172	326177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_009925	TCAT	2	8	326251	326258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_009925	CATC	2	8	326299	326306	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_009925	AAT	2	6	326497	326502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_009925	ATA	2	6	326538	326543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_009925	GTT	2	6	328788	328793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_009925	CA	3	6	328817	328822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_009925	TCAA	2	8	328882	328889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_009925	AAC	2	6	328897	328902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_009925	TGA	2	6	328916	328921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_009925	AT	3	6	328977	328982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_009925	A	6	6	328991	328996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_009925	ATA	2	6	329041	329046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_009925	GTG	2	6	329992	329997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_009925	TAA	2	6	330005	330010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_009925	CTATC	2	10	330030	330039	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1088	NC_009925	AAT	2	6	330095	330100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_009925	ACC	2	6	330103	330108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_009925	TCAGA	2	10	330154	330163	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_009925	GAAA	2	8	330207	330214	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_009925	GAG	2	6	330351	330356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_009925	TAT	2	6	330425	330430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_009925	T	6	6	330450	330455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_009925	AGTTT	2	10	331920	331929	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_009925	TAGGT	2	10	331989	331998	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_009925	CTA	2	6	332073	332078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1099	NC_009925	CAG	2	6	332093	332098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_009925	TTC	2	6	332117	332122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_009925	TCA	2	6	332183	332188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_009925	GCT	2	6	334434	334439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_009925	CTA	2	6	335428	335433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_009925	CCTG	2	8	335574	335581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_009925	ATAA	2	8	335736	335743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_009925	TCCAAA	2	12	336562	336573	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_009925	A	9	9	337460	337468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009925	AT	3	6	337931	337936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_009925	ATAG	2	8	337965	337972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_009925	A	6	6	338020	338025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_009925	TGT	2	6	338060	338065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_009925	A	6	6	338079	338084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_009925	TTC	2	6	338119	338124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_009925	ATC	2	6	338127	338132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_009925	TAAA	2	8	338134	338141	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_009925	T	7	7	338230	338236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_009925	TAA	2	6	338275	338280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_009925	TAAAG	2	10	338298	338307	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_009925	T	6	6	338348	338353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_009925	ATTC	2	8	338364	338371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_009925	A	6	6	338373	338378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_009925	CAT	3	9	338383	338391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_009925	A	6	6	338481	338486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_009925	GTG	2	6	338572	338577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_009925	CGA	2	6	338621	338626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_009925	GCT	2	6	338695	338700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_009925	CAG	2	6	338725	338730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_009925	ACT	2	6	338733	338738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_009925	ACAA	2	8	338805	338812	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_009925	AAC	2	6	338892	338897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_009925	AAGC	2	8	338923	338930	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_009925	ACTTA	2	10	338934	338943	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1133	NC_009925	TTAT	2	8	338970	338977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_009925	TTA	2	6	339046	339051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_009925	TTC	2	6	339078	339083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1276	NC_009925	GATTA	2	10	367250	367259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1405	NC_009925	AT	3	6	431613	431618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1406	NC_009925	GAC	2	6	431685	431690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1408	NC_009925	TCA	2	6	431773	431778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1412	NC_009925	TGC	2	6	431930	431935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1414	NC_009925	TTAA	2	8	432020	432027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_009925	GACC	2	8	432043	432050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1418	NC_009925	GA	3	6	433680	433685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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