MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 12833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009922	TGT	2	6	814279	814284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_009922	T	6	6	814342	814347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_009922	CTG	2	6	814352	814357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_009922	T	6	6	814365	814370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_009922	T	6	6	814373	814378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_009922	ACA	2	6	814386	814391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_009922	AT	3	6	814397	814402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_009922	AGTTCT	2	12	814416	814427	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3509	NC_009922	TCTA	2	8	814446	814453	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_009922	T	6	6	814494	814499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_009922	TTA	2	6	814502	814507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_009922	ATT	2	6	814521	814526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_009922	T	7	7	814525	814531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_009922	TTATT	2	10	814623	814632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_009922	ATT	2	6	814649	814654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_009922	ACC	2	6	814690	814695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_009922	GAT	2	6	814741	814746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_009922	ATG	2	6	814771	814776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_009922	GTT	2	6	814801	814806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_009922	ATTT	2	8	814814	814821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_009922	TAT	2	6	814850	814855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_009922	ATC	3	9	814881	814889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_009922	ATA	2	6	815047	815052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_009922	TTA	2	6	815061	815066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_009922	TAAA	2	8	815071	815078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_009922	A	6	6	815128	815133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_009922	GCTAAA	2	12	815145	815156	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3528	NC_009922	AAGATA	2	12	815192	815203	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_009922	TA	4	8	815226	815233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_009922	A	6	6	815239	815244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_009922	A	6	6	815261	815266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_009922	CGA	2	6	815293	815298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_009922	TAA	2	6	815307	815312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_009922	ATTA	2	8	815358	815365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_009922	GAT	2	6	815371	815376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_009922	A	7	7	815377	815383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_009922	AG	3	6	815409	815414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_009922	GAA	2	6	815448	815453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_009922	A	6	6	815543	815548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_009922	TAA	2	6	815563	815568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_009922	A	6	6	815579	815584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_009922	TGA	2	6	815585	815590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_009922	ATT	2	6	815598	815603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_009922	AACCA	2	10	815636	815645	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3545	NC_009922	TAT	2	6	815756	815761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_009922	T	6	6	815765	815770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3548	NC_009922	TTA	2	6	815821	815826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_009922	CA	3	6	815833	815838	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_009922	AT	3	6	815841	815846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_009922	GAA	2	6	815877	815882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_009922	ATT	2	6	815955	815960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_009922	GGAT	2	8	815986	815993	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_009922	TAATG	2	10	815994	816003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_009922	AT	4	8	816004	816011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_009922	TTA	2	6	816029	816034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_009922	TAA	2	6	816090	816095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_009922	GTG	2	6	816108	816113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_009922	ATT	2	6	816114	816119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_009922	GAT	2	6	816137	816142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_009922	AGA	2	6	816154	816159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_009922	AT	3	6	816164	816169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_009922	AGA	2	6	816190	816195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_009922	TCA	2	6	816253	816258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_009922	TTTGGA	2	12	816286	816297	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_009922	TAG	2	6	816372	816377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_009922	GAAT	2	8	816420	816427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_009922	T	6	6	816576	816581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_009922	TTTA	2	8	816652	816659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_009922	TCA	2	6	816724	816729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_009922	TAAA	2	8	816738	816745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_009922	GAAT	2	8	816808	816815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_009922	TAGT	2	8	816874	816881	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_009922	A	6	6	816962	816967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3576	NC_009922	TGA	2	6	817296	817301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_009922	AT	3	6	817314	817319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_009922	GGCA	2	8	817341	817348	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_009922	AAGC	2	8	817350	817357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3580	NC_009922	GGCTT	2	10	817373	817382	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3583	NC_009922	AAT	3	9	818093	818101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_009922	GAAA	2	8	818110	818117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_009922	A	6	6	818134	818139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_009922	TAA	2	6	818147	818152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_009922	CTA	2	6	818193	818198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3589	NC_009922	GGT	2	6	818209	818214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_009922	CAG	2	6	818235	818240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_009922	CAT	2	6	818272	818277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3593	NC_009922	GAAA	2	8	818335	818342	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3595	NC_009922	TTGTA	2	10	818369	818378	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_009922	ATC	3	9	818403	818411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3601	NC_009922	AAT	2	6	818609	818614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_009922	GGA	2	6	818626	818631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_009922	GAG	2	6	818680	818685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_009922	T	6	6	818707	818712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_009922	ATA	2	6	818715	818720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_009922	ATTT	2	8	818725	818732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_009922	TAA	2	6	818748	818753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_009922	ATA	2	6	818760	818765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3610	NC_009922	A	6	6	819921	819926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_009922	ATC	2	6	819928	819933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_009922	TA	4	8	819950	819957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_009922	ATT	2	6	819985	819990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_009922	ATA	2	6	820110	820115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_009922	TCT	2	6	820121	820126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3617	NC_009922	A	6	6	820148	820153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_009922	TAA	2	6	820184	820189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_009922	AAG	2	6	820212	820217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_009922	GAAA	2	8	820284	820291	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_009922	ACA	2	6	820301	820306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_009922	TGG	2	6	820345	820350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_009922	ATT	2	6	820418	820423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_009922	ACTT	2	8	821361	821368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_009922	TTC	2	6	822356	822361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_009922	TATT	2	8	822414	822421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_009922	GCAAA	2	10	822460	822469	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3628	NC_009922	A	7	7	822514	822520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_009922	AT	3	6	823359	823364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_009922	CGG	2	6	823424	823429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3631	NC_009922	TAA	3	9	823446	823454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_009922	AACAT	2	10	823467	823476	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3633	NC_009922	TAA	2	6	823480	823485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_009922	TAAAT	2	10	823507	823516	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3635	NC_009922	C	6	6	823565	823570	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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