MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 12833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009922	GAA	2	6	290392	290397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_009922	CTA	2	6	290416	290421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_009922	A	6	6	290421	290426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_009922	A	6	6	290429	290434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_009922	GTA	3	9	290467	290475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_009922	AGGAG	2	10	290478	290487	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_009922	ATT	2	6	290493	290498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_009922	TA	3	6	290544	290549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_009922	AAAG	2	8	290561	290568	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_009922	ATTT	2	8	292168	292175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_009922	ATT	2	6	292178	292183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_009922	TA	3	6	292190	292195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_009922	TAA	2	6	292208	292213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_009922	TA	3	6	292214	292219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_009922	ATGAA	2	10	292229	292238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_009922	AT	3	6	293105	293110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_009922	TAC	2	6	293117	293122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_009922	A	6	6	294030	294035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_009922	T	6	6	294072	294077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_009922	ATT	3	9	296174	296182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_009922	AAG	2	6	297667	297672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_009922	T	7	7	297694	297700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_009922	TGAT	2	8	297720	297727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_009922	ATTTA	2	10	297798	297807	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_009922	TGAGG	2	10	297811	297820	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_009922	T	6	6	300508	300513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_009922	TCC	2	6	301165	301170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_009922	TGA	2	6	301184	301189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_009922	AT	3	6	301199	301204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_009922	AGG	2	6	301216	301221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_009922	GGAT	2	8	301252	301259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_009922	AT	3	6	301272	301277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_009922	GT	3	6	301285	301290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_009922	TTC	2	6	301297	301302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_009922	TGC	2	6	301307	301312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_009922	AAAAAT	2	12	301319	301330	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_009922	ATT	2	6	302346	302351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_009922	ATT	2	6	302388	302393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_009922	TA	3	6	302422	302427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_009922	ATT	2	6	302445	302450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_009922	AAT	2	6	302465	302470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_009922	TCC	2	6	302490	302495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_009922	TGA	2	6	302533	302538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_009922	TAA	2	6	302555	302560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_009922	AAGTAG	2	12	302587	302598	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_009922	A	6	6	302606	302611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_009922	GCA	2	6	302659	302664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_009922	AAAG	2	8	303910	303917	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_009922	A	7	7	303923	303929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_009922	T	7	7	303936	303942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_009922	A	8	8	303943	303950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_009922	A	6	6	303976	303981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_009922	ATTTT	2	10	304061	304070	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_009922	AGG	2	6	304199	304204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_009922	A	6	6	304969	304974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_009922	GAAT	2	8	306201	306208	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_009922	TTTG	2	8	306222	306229	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_009922	CAT	2	6	306267	306272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_009922	ATC	2	6	307181	307186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_009922	A	6	6	307202	307207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_009922	TAC	2	6	307216	307221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_009922	ATATT	2	10	307299	307308	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_009922	TAGAT	2	10	307376	307385	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_009922	TA	3	6	307396	307401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_009922	GAT	2	6	307408	307413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_009922	ATAG	2	8	308593	308600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_009922	TTTA	2	8	308609	308616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_009922	CAAAAA	2	12	309696	309707	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1569	NC_009922	TTA	2	6	309722	309727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_009922	AAG	2	6	313473	313478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_009922	AGA	2	6	313528	313533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_009922	TAT	2	6	313546	313551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_009922	GAT	2	6	315747	315752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_009922	AG	3	6	315757	315762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_009922	ATC	2	6	315771	315776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_009922	TAT	2	6	315805	315810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_009922	A	6	6	315828	315833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_009922	A	7	7	315835	315841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_009922	GA	3	6	315855	315860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_009922	AAT	2	6	316731	316736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_009922	CAA	2	6	316743	316748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_009922	CA	3	6	320105	320110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_009922	TTA	2	6	320146	320151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_009922	TAGA	2	8	320204	320211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_009922	TTTA	2	8	320841	320848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_009922	TCC	2	6	321085	321090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_009922	ATC	2	6	321109	321114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_009922	AATTA	2	10	321153	321162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_009922	TA	3	6	321161	321166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_009922	AAC	2	6	321189	321194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_009922	AAGTT	2	10	321195	321204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_009922	AT	3	6	321212	321217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_009922	ACGA	2	8	321244	321251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1594	NC_009922	T	6	6	322766	322771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_009922	TTG	2	6	322793	322798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_009922	ATA	2	6	322820	322825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_009922	CGC	2	6	322884	322889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_009922	AAT	2	6	322984	322989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_009922	TTAT	2	8	323004	323011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_009922	ATTTGT	2	12	323038	323049	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_009922	AAC	2	6	323052	323057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_009922	TAT	2	6	323062	323067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_009922	T	6	6	323067	323072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_009922	ATAAA	2	10	323077	323086	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_009922	T	6	6	323106	323111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_009922	TA	3	6	323116	323121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_009922	TCC	2	6	324565	324570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_009922	ATTT	3	12	324577	324588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_009922	T	6	6	324586	324591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_009922	CTT	2	6	324631	324636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_009922	ATT	2	6	324657	324662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_009922	TAC	2	6	324693	324698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_009922	ATAG	2	8	324701	324708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_009922	A	6	6	324731	324736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_009922	TAA	2	6	324737	324742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_009922	TCGA	2	8	324787	324794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_009922	ATG	2	6	324826	324831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_009922	AAT	2	6	324848	324853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_009922	T	10	10	324872	324881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_009922	AATA	2	8	330891	330898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_009922	CTT	2	6	330926	330931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_009922	T	6	6	330942	330947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_009922	AAG	2	6	330953	330958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_009922	AAT	2	6	330967	330972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_009922	TCCA	2	8	330978	330985	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_009922	ATA	2	6	331009	331014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_009922	ATA	2	6	331018	331023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_009922	TATAGA	2	12	331058	331069	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_009922	TTA	2	6	331114	331119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_009922	AGG	2	6	332632	332637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_009922	AAAT	2	8	332649	332656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_009922	T	8	8	332993	333000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_009922	TA	3	6	333013	333018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_009922	TCC	2	6	333224	333229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_009922	AAT	2	6	333279	333284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_009922	ACT	2	6	333324	333329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_009922	TTATA	2	10	333493	333502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_009922	ATA	2	6	333546	333551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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