MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 12833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_009922	TAAA	2	8	1399358	1399365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_009922	AGTTT	2	10	1399366	1399375	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_009922	AGC	2	6	1400255	1400260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_009922	ACC	2	6	1400272	1400277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_009922	ATT	2	6	1400341	1400346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_009922	A	6	6	1400397	1400402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_009922	T	6	6	1400429	1400434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_009922	TTG	2	6	1400454	1400459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_009922	AGG	2	6	1400467	1400472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_009922	AGA	2	6	1400577	1400582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_009922	AGA	2	6	1400625	1400630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_009922	TAA	2	6	1400711	1400716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_009922	TAGA	2	8	1400725	1400732	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_009922	TAA	2	6	1400773	1400778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_009922	CAT	2	6	1400785	1400790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_009922	TAG	3	9	1400817	1400825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_009922	AGT	2	6	1400827	1400832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_009922	ACT	2	6	1400870	1400875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_009922	AT	3	6	1400890	1400895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_009922	AGT	2	6	1401105	1401110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_009922	AGA	2	6	1401123	1401128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_009922	TAAA	2	8	1401136	1401143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_009922	A	6	6	1401141	1401146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_009922	CCA	2	6	1401212	1401217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6025	NC_009922	TAGG	2	8	1401231	1401238	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_009922	AGGC	2	8	1401262	1401269	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6027	NC_009922	GGAA	2	8	1401329	1401336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_009922	CGAT	2	8	1401388	1401395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6029	NC_009922	ATT	2	6	1401426	1401431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_009922	TCC	2	6	1401432	1401437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_009922	AAC	3	9	1401561	1401569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_009922	AT	3	6	1401608	1401613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_009922	AAAT	2	8	1401619	1401626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_009922	ATTT	2	8	1401671	1401678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_009922	GTA	2	6	1401689	1401694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_009922	ATTT	2	8	1402531	1402538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_009922	ATATA	2	10	1402570	1402579	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_009922	TATT	2	8	1402712	1402719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_009922	T	7	7	1402727	1402733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_009922	T	6	6	1402736	1402741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_009922	A	6	6	1402747	1402752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_009922	TCC	2	6	1403881	1403886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6043	NC_009922	ATA	2	6	1403907	1403912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_009922	TCC	2	6	1404143	1404148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_009922	TA	3	6	1404174	1404179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_009922	TAT	2	6	1404194	1404199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_009922	CCT	2	6	1404627	1404632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_009922	TATT	2	8	1404643	1404650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_009922	GAT	2	6	1404657	1404662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_009922	TA	3	6	1404739	1404744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_009922	AATA	3	12	1404758	1404769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_009922	AAT	2	6	1405985	1405990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_009922	TAAA	2	8	1406020	1406027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_009922	A	8	8	1406025	1406032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_009922	T	6	6	1406048	1406053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_009922	TCCTT	2	10	1406495	1406504	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6057	NC_009922	AT	3	6	1406514	1406519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_009922	TAT	2	6	1406547	1406552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_009922	AT	4	8	1406636	1406643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_009922	AAAAT	2	10	1406680	1406689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_009922	AATTA	2	10	1406712	1406721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_009922	ATT	2	6	1406750	1406755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_009922	AGGT	2	8	1407855	1407862	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_009922	AGG	2	6	1408228	1408233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_009922	TAA	3	9	1409739	1409747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_009922	TAG	2	6	1409796	1409801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_009922	TAA	2	6	1410213	1410218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_009922	ATA	2	6	1410231	1410236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_009922	TAA	2	6	1410244	1410249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_009922	GAA	2	6	1410272	1410277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_009922	T	7	7	1410295	1410301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_009922	TAGT	2	8	1410332	1410339	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_009922	GAG	2	6	1410374	1410379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_009922	TAA	2	6	1410384	1410389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_009922	AGA	2	6	1410424	1410429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_009922	AGGA	2	8	1410430	1410437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_009922	TAGA	2	8	1410495	1410502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_009922	ATAA	2	8	1413199	1413206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_009922	TAAG	2	8	1413209	1413216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_009922	TAC	2	6	1413385	1413390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_009922	A	6	6	1413457	1413462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_009922	AT	3	6	1413465	1413470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_009922	TTA	2	6	1413495	1413500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_009922	TCAAA	2	10	1413530	1413539	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6085	NC_009922	GGT	2	6	1413677	1413682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_009922	TGC	2	6	1413737	1413742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_009922	ACGCT	2	10	1413868	1413877	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6088	NC_009922	A	6	6	1413897	1413902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_009922	CCGCT	2	10	1413924	1413933	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6090	NC_009922	ATG	2	6	1414095	1414100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_009922	TAC	3	9	1414153	1414161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_009922	CTA	2	6	1414164	1414169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_009922	ATG	2	6	1414200	1414205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_009922	TTA	2	6	1414299	1414304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_009922	CCT	2	6	1414323	1414328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_009922	CAA	2	6	1414336	1414341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_009922	T	6	6	1414393	1414398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_009922	AGA	2	6	1414412	1414417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_009922	TA	3	6	1414470	1414475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_009922	A	6	6	1414572	1414577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_009922	TAAT	2	8	1414584	1414591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_009922	AT	3	6	1414598	1414603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_009922	TAT	2	6	1414618	1414623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_009922	ATTG	2	8	1414649	1414656	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_009922	TAAT	2	8	1414733	1414740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_009922	AAC	2	6	1414741	1414746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_009922	AAAT	2	8	1419748	1419755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_009922	AGT	2	6	1419780	1419785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_009922	AGG	2	6	1419846	1419851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_009922	ATT	2	6	1423130	1423135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_009922	TAA	2	6	1423167	1423172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_009922	TCC	2	6	1423189	1423194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6113	NC_009922	ATA	2	6	1423203	1423208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_009922	CAC	2	6	1423233	1423238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_009922	A	7	7	1423282	1423288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_009922	TAT	2	6	1423289	1423294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_009922	AAT	2	6	1423410	1423415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6119	NC_009922	T	6	6	1423495	1423500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_009922	GAA	2	6	1423505	1423510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_009922	GTT	2	6	1423548	1423553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_009922	TTG	2	6	1423570	1423575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_009922	AGA	3	9	1423612	1423620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_009922	TCT	2	6	1423681	1423686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_009922	AT	3	6	1423689	1423694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_009922	AGA	2	6	1423697	1423702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_009922	CTT	2	6	1428924	1428929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_009922	AAG	2	6	1428957	1428962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_009922	T	6	6	1428974	1428979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_009922	AAT	2	6	1428985	1428990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_009922	CCA	2	6	1429015	1429020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6132	NC_009922	TAC	2	6	1429072	1429077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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