MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 12833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009922	TTAT	2	8	1	8	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009922	AT	4	8	7	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009922	ATT	2	6	24	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009922	AGG	2	6	36	41	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009922	GT	3	6	1421	1426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009922	A	6	6	1458	1463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009922	T	7	7	1464	1470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009922	TGTT	2	8	1472	1479	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009922	CTA	3	9	1576	1584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009922	TAC	2	6	1586	1591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009922	GTT	2	6	1596	1601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009922	ATT	2	6	1602	1607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009922	T	6	6	1616	1621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009922	ATA	2	6	2789	2794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009922	GTA	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009922	AGG	2	6	3223	3228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009922	TAA	2	6	4383	4388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009922	GCT	2	6	4779	4784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009922	AGA	2	6	4793	4798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009922	TTTAT	2	10	4814	4823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009922	TTA	2	6	4824	4829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009922	T	6	6	4862	4867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009922	AGG	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009922	A	6	6	9282	9287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009922	T	7	7	9296	9302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009922	TGG	2	6	9322	9327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009922	TAA	2	6	9347	9352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009922	ATA	2	6	9369	9374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009922	A	6	6	9374	9379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009922	AAATC	2	10	9424	9433	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009922	TAG	2	6	9441	9446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009922	GAA	2	6	9486	9491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009922	T	6	6	11088	11093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009922	TAG	2	6	11127	11132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009922	AAT	2	6	11171	11176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009922	ATA	2	6	11196	11201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009922	AT	3	6	11213	11218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009922	GGC	2	6	11239	11244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009922	GGC	2	6	11398	11403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009922	GAA	2	6	11434	11439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009922	GCG	2	6	11458	11463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009922	CGA	2	6	11635	11640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009922	GCA	2	6	11709	11714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009922	GCA	2	6	11749	11754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009922	CGC	2	6	11756	11761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009922	AGG	2	6	11825	11830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009922	CAG	2	6	11852	11857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009922	GTA	2	6	11958	11963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009922	AGGAG	2	10	11992	12001	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009922	AGG	2	6	12041	12046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009922	CT	3	6	12067	12072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009922	GTAC	2	8	12219	12226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009922	AGC	2	6	12267	12272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009922	GAA	2	6	12302	12307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009922	CCTTC	2	10	12352	12361	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_009922	GGT	2	6	12378	12383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009922	GTC	2	6	12392	12397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009922	TCGTG	2	10	12401	12410	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009922	CAT	2	6	12460	12465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009922	AG	3	6	12481	12486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009922	GGA	2	6	12504	12509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009922	ATC	2	6	12528	12533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009922	AC	3	6	12555	12560	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009922	AC	3	6	12724	12729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009922	AGG	2	6	12783	12788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009922	CCT	2	6	12865	12870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_009922	GA	3	6	12909	12914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009922	CA	3	6	12963	12968	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_009922	AAT	2	6	13012	13017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009922	TGA	2	6	13032	13037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009922	TA	3	6	13063	13068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009922	AT	4	8	13087	13094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009922	TAA	2	6	13109	13114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009922	GCAA	2	8	13188	13195	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009922	ACT	2	6	13254	13259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009922	AGAA	2	8	13321	13328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009922	GCG	2	6	13347	13352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009922	AGA	2	6	13434	13439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009922	CAC	2	6	13454	13459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_009922	G	6	6	13547	13552	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009922	ACC	2	6	13553	13558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_009922	C	6	6	13557	13562	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
83	NC_009922	TAC	2	6	13572	13577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009922	TG	3	6	13688	13693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009922	AGC	2	6	14212	14217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009922	CATT	2	8	14218	14225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_009922	GAG	2	6	14357	14362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009922	ACA	2	6	14513	14518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009922	ACC	2	6	14534	14539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_009922	GTTG	2	8	14591	14598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009922	TG	3	6	14597	14602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009922	AGGT	2	8	14756	14763	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009922	GAG	2	6	14764	14769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009922	GA	3	6	14858	14863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009922	GAC	2	6	14948	14953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009922	CGG	2	6	15039	15044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009922	CAA	2	6	15133	15138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009922	TGG	2	6	15289	15294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009922	GTA	2	6	15319	15324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009922	TGG	2	6	15371	15376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009922	GGT	2	6	15534	15539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009922	TCA	2	6	15649	15654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009922	GTA	2	6	15667	15672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009922	CGT	2	6	15729	15734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009922	GAG	2	6	15778	15783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009922	AC	3	6	15813	15818	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009922	GTT	2	6	15832	15837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009922	C	6	6	15905	15910	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_009922	AAGAT	2	10	15913	15922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009922	ATT	2	6	16052	16057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009922	TC	3	6	16075	16080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009922	AGT	2	6	16133	16138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009922	AT	3	6	16199	16204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009922	AGA	2	6	16210	16215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009922	T	10	10	16238	16247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009922	A	6	6	16250	16255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009922	ATTA	2	8	16290	16297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009922	GTA	2	6	16314	16319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009922	AATT	2	8	16871	16878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009922	AAT	2	6	17977	17982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009922	A	7	7	17998	18004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009922	T	7	7	18031	18037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009922	A	6	6	18104	18109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009922	CCT	2	6	18324	18329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_009922	A	6	6	18330	18335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009922	ATT	2	6	18359	18364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009922	TAG	2	6	18420	18425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009922	TTG	2	6	18452	18457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009922	ATA	2	6	18477	18482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009922	AAT	2	6	18491	18496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009922	GAA	2	6	18510	18515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009922	AG	3	6	18543	18548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009922	TGGT	2	8	18553	18560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009922	GTA	2	6	18571	18576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009922	TTG	2	6	18579	18584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009922	CTG	2	6	18603	18608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009922	T	8	8	18736	18743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009922	TAA	2	6	18777	18782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009922	CTG	2	6	18854	18859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009922	AT	3	6	18869	18874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009922	TAA	2	6	18880	18885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009922	AGG	2	6	18887	18892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009922	ATTT	2	8	20208	20215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009922	T	7	7	20266	20272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009922	GGA	2	6	20273	20278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009922	AT	3	6	20481	20486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009922	CTC	2	6	20576	20581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_009922	CAC	2	6	20589	20594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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150	NC_009922	TAT	2	6	20639	20644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009922	TAG	2	6	20663	20668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_009922	AAAAG	2	10	20684	20693	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009922	AAT	2	6	20741	20746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_009922	CAT	2	6	51011	51016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_009922	ATC	2	6	51079	51084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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