MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009633	GTTTT	2	10	1516	1525	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009633	TCGTG	2	10	12377	12386	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009633	TATGG	2	10	13834	13843	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009633	AAGAT	2	10	16018	16027	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009633	GTTAC	2	10	17390	17399	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009633	TCGTG	2	10	23432	23441	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009633	TATGG	2	10	24893	24902	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009633	AAGAT	2	10	27077	27086	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009633	AATGA	2	10	27693	27702	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009633	GATTA	2	10	27721	27730	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009633	ATGAT	2	10	27770	27779	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009633	TTATT	2	10	32864	32873	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009633	TGTAA	2	10	36190	36199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009633	TAAAA	2	10	37861	37870	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009633	GATAT	2	10	41914	41923	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009633	ATAAA	2	10	48627	48636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009633	TCGTG	2	10	49922	49931	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009633	TATGG	2	10	51401	51410	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009633	AAGAT	2	10	53585	53594	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009633	TCGTG	2	10	55449	55458	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009633	TATGG	2	10	56950	56959	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009633	AAGAT	2	10	59134	59143	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009633	GAAAA	2	10	64145	64154	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009633	GTATG	2	10	67111	67120	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009633	TAAAT	2	10	74461	74470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009633	CACTC	2	10	76007	76016	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_009633	ATATT	2	10	76111	76120	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009633	AGGGA	2	10	86656	86665	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009633	TAAAA	3	15	99767	99781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009633	GAAGA	3	15	104302	104316	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009633	TTTCT	2	10	107848	107857	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009633	CTATA	2	10	107883	107892	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009633	ATATT	2	10	110036	110045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009633	AAAGA	2	10	113436	113445	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009633	TATGC	2	10	116700	116709	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_009633	TTGAA	2	10	122885	122894	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009633	TATTT	2	10	122948	122957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009633	TTGCA	2	10	122968	122977	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009633	ATATT	2	10	128341	128350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009633	TATAA	2	10	128355	128364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009633	GATAA	2	10	131682	131691	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009633	CAAAA	2	10	137586	137595	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_009633	ATAAA	2	10	138124	138133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009633	TTGAT	2	10	150651	150660	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009633	ATAGA	2	10	152057	152066	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009633	TATAA	2	10	153398	153407	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009633	TATAG	2	10	156540	156549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009633	TTTTA	2	10	181270	181279	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009633	ATTTA	2	10	185705	185714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009633	ATTTT	2	10	192235	192244	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009633	CAACT	2	10	210770	210779	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009633	AATTA	2	10	213660	213669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009633	ATAAA	2	10	214525	214534	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009633	TCATT	2	10	214554	214563	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009633	AAAGT	2	10	214903	214912	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009633	TAGAG	2	10	216092	216101	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009633	GAAAA	2	10	226041	226050	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009633	GATTG	2	10	248045	248054	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009633	AATAC	2	10	248823	248832	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009633	TTGAG	2	10	251066	251075	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009633	AGTTA	2	10	251214	251223	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009633	TAAAA	2	10	251330	251339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009633	CCAGC	2	10	254650	254659	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_009633	TAAAA	2	10	254707	254716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009633	TAAAG	2	10	255320	255329	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009633	ACTTA	2	10	260199	260208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_009633	AAAGA	2	10	260265	260274	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009633	ATGAA	2	10	260425	260434	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009633	ATTGC	2	10	265684	265693	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009633	AGGGT	2	10	273794	273803	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009633	ACTTA	2	10	275247	275256	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009633	ACTTA	2	10	275264	275273	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009633	ACTTA	2	10	277209	277218	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009633	TAAAA	2	10	277226	277235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009633	ACTTA	2	10	284493	284502	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009633	TGAGT	2	10	297823	297832	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009633	TGGAA	2	10	313261	313270	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009633	GGATC	2	10	315901	315910	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009633	CTGTC	2	10	316463	316472	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_009633	AACTT	2	10	322124	322133	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009633	AGAAA	2	10	326675	326684	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009633	TCTTT	2	10	329241	329250	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_009633	CTTAA	2	10	344080	344089	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_009633	GAAAT	2	10	352345	352354	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009633	ATAAA	2	10	355165	355174	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009633	TATAT	2	10	359038	359047	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009633	ATAGG	2	10	359205	359214	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009633	TAGCT	2	10	380509	380518	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009633	ATAAA	2	10	383640	383649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009633	TATAA	2	10	383821	383830	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009633	TATAT	2	10	392342	392351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009633	ATTAA	2	10	402700	402709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009633	CTAAA	2	10	402719	402728	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009633	AAAGT	2	10	403079	403088	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009633	AAGAA	2	10	412864	412873	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009633	GAAAG	2	10	414912	414921	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009633	TAAAA	2	10	415147	415156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009633	AACTT	2	10	416133	416142	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009633	AAATT	2	10	419086	419095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009633	AAAAT	2	10	419241	419250	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009633	TAATT	2	10	420403	420412	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009633	AAAGG	2	10	421119	421128	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009633	CCAAA	2	10	459713	459722	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_009633	CAAAA	2	10	462773	462782	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009633	TTATT	2	10	462985	462994	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009633	AAACT	2	10	464342	464351	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009633	GTAAA	2	10	464616	464625	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009633	TAGGG	2	10	464637	464646	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009633	ATCGA	2	10	474929	474938	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009633	AATAT	2	10	477247	477256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009633	ATTTT	2	10	477284	477293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009633	AAGGT	2	10	477578	477587	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009633	ATATA	2	10	477701	477710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009633	TTATG	2	10	477740	477749	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009633	TTCAA	2	10	482806	482815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_009633	TATAA	2	10	488447	488456	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009633	TATAA	2	10	495224	495233	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009633	GTTTG	2	10	504520	504529	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009633	AGCGT	2	10	507088	507097	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009633	ACAAA	2	10	510061	510070	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009633	TTTAT	2	10	511582	511591	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009633	ATAGT	2	10	515046	515055	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009633	GATAG	2	10	517992	518001	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009633	TAATT	2	10	519531	519540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009633	ACGAG	2	10	524640	524649	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009633	AAATG	2	10	546262	546271	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009633	TAAAT	2	10	551482	551491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009633	ATTCT	2	10	562805	562814	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009633	AAAAG	2	10	567602	567611	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009633	TAGTC	2	10	571949	571958	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009633	GTTAA	2	10	573137	573146	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009633	TCTAA	2	10	577175	577184	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_009633	TCAAG	2	10	588143	588152	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_009633	TGAAA	2	10	590518	590527	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009633	GAGAG	2	10	606684	606693	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009633	TAAAA	2	10	619138	619147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009633	AGGGG	2	10	628242	628251	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009633	TTGTA	2	10	628339	628348	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009633	GTGAG	2	10	634277	634286	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009633	TAGAA	2	10	635717	635726	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009633	ATGAA	2	10	638533	638542	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009633	AACTA	2	10	657258	657267	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009633	ATATG	2	10	665809	665818	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009633	GGATT	2	10	677736	677745	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009633	AGATA	2	10	693519	693528	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009633	GTATT	2	10	699494	699503	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009633	ATATT	2	10	709414	709423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009633	AATAT	2	10	715367	715376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_009633	TTGGC	2	10	1236735	1236744	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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286	NC_009633	AAGTA	2	10	1283068	1283077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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