MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Alkaliphilus metalliredigens QYMF chromosome

Total Repeats: 20847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009633	CCA	2	6	56160	56165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_009633	ATG	2	6	56190	56195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_009633	ATCA	2	8	56223	56230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_009633	TTA	2	6	56330	56335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_009633	AGA	2	6	56497	56502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009633	AGAA	2	8	56543	56550	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009633	GCG	2	6	56569	56574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_009633	AAG	3	9	56638	56646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009633	GTA	2	6	56652	56657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_009633	AAG	2	6	56710	56715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009633	G	6	6	56770	56775	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009633	ACC	2	6	56776	56781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_009633	C	6	6	56780	56785	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
514	NC_009633	TAC	2	6	56795	56800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_009633	TG	3	6	56911	56916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_009633	TATGG	2	10	56950	56959	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009633	GAT	2	6	57126	57131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_009633	CGT	2	6	57287	57292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_009633	AGC	2	6	57434	57439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_009633	AGA	2	6	57598	57603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009633	GA	3	6	57602	57607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009633	ACA	2	6	57735	57740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009633	G	6	6	57780	57785	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
524	NC_009633	GTTG	2	8	57812	57819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_009633	TG	3	6	57818	57823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_009633	GGTG	2	8	57980	57987	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
527	NC_009633	GA	3	6	57990	57995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
528	NC_009633	CGG	2	6	58260	58265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_009633	CAA	2	6	58354	58359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_009633	TGG	2	6	58510	58515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_009633	GTA	2	6	58540	58545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_009633	GGT	2	6	58755	58760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_009633	TCA	2	6	58870	58875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_009633	GTA	2	6	58888	58893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009633	CGT	2	6	58950	58955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_009633	GAG	2	6	58999	59004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009633	GTT	2	6	59053	59058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_009633	C	6	6	59126	59131	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
539	NC_009633	AAGAT	2	10	59134	59143	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009633	AG	3	6	59157	59162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009633	GA	3	6	59288	59293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009633	TC	3	6	59300	59305	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
543	NC_009633	ATTG	2	8	59341	59348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009633	GCT	2	6	59393	59398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_009633	GTC	2	6	59542	59547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_009633	ATT	2	6	59582	59587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009633	T	6	6	59590	59595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_009633	T	6	6	60832	60837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009633	CCT	2	6	62338	62343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_009633	CCT	2	6	62406	62411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_009633	AT	3	6	62417	62422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_009633	CTA	2	6	62425	62430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_009633	A	7	7	62487	62493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_009633	T	6	6	62504	62509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009633	TAA	2	6	62620	62625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009633	AAAT	2	8	62630	62637	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009633	GAG	2	6	62675	62680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009633	GAAAA	2	10	64145	64154	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009633	ATC	2	6	65374	65379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_009633	T	9	9	65401	65409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_009633	CAG	2	6	65415	65420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_009633	T	7	7	65428	65434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009633	T	8	8	65469	65476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009633	A	6	6	65482	65487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009633	TAG	2	6	65511	65516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009633	ATT	2	6	65543	65548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_009633	GTATG	2	10	67111	67120	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
568	NC_009633	ATAA	2	8	67502	67509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009633	AGG	2	6	67567	67572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_009633	A	6	6	67573	67578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009633	A	7	7	67804	67810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009633	TAAC	2	8	67894	67901	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
573	NC_009633	ATAA	2	8	67908	67915	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009633	AAT	2	6	68950	68955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_009633	AT	4	8	68976	68983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_009633	ATA	3	9	69039	69047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009633	ATA	2	6	69062	69067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_009633	AG	3	6	69079	69084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_009633	CCTT	2	8	69093	69100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_009633	TAT	2	6	69148	69153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009633	AAAT	2	8	69186	69193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_009633	TA	3	6	70337	70342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_009633	AATT	2	8	70350	70357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_009633	AG	3	6	70359	70364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_009633	CT	3	6	70372	70377	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
586	NC_009633	ATT	2	6	70381	70386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_009633	GAA	2	6	70387	70392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_009633	AAAG	2	8	70413	70420	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009633	GTA	2	6	74273	74278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009633	AAC	2	6	74364	74369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_009633	CCT	2	6	74410	74415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_009633	AATT	2	8	74453	74460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_009633	TAAAT	2	10	74461	74470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_009633	A	6	6	74476	74481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_009633	AATA	2	8	74506	74513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_009633	AAT	2	6	74525	74530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009633	CACTC	2	10	76007	76016	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
598	NC_009633	GAAA	2	8	76046	76053	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
599	NC_009633	TCA	2	6	76060	76065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_009633	ACTG	2	8	76067	76074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_009633	ATATT	2	10	76111	76120	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009633	AGG	2	6	76845	76850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009633	GA	3	6	77863	77868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_009633	G	6	6	77872	77877	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
605	NC_009633	ATG	2	6	79163	79168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_009633	A	7	7	79177	79183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_009633	GTG	2	6	79286	79291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009633	AACC	2	8	79468	79475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_009633	T	6	6	79493	79498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_009633	GAT	2	6	79580	79585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009633	TAA	3	9	79645	79653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_009633	AG	3	6	82594	82599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_009633	AGGG	2	8	82612	82619	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009633	AGA	2	6	86459	86464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_009633	AT	3	6	86476	86481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009633	GGAA	2	8	86588	86595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
617	NC_009633	AGGGA	2	10	86656	86665	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
618	NC_009633	A	6	6	86715	86720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_009633	GGA	2	6	86824	86829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009633	ATA	2	6	87215	87220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_009633	TG	3	6	88732	88737	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_009633	TAAA	2	8	88770	88777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_009633	A	8	8	98117	98124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009633	AAC	2	6	98158	98163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_009633	TTG	3	9	98269	98277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_009633	CAT	2	6	98289	98294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_009633	AGA	2	6	98322	98327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_009633	CAAGAA	2	12	98342	98353	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
629	NC_009633	T	9	9	98477	98485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_009633	AGC	2	6	98506	98511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_009633	ATA	2	6	98526	98531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_009633	GGT	2	6	98554	98559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_009633	T	7	7	99160	99166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_009633	AAT	2	6	99204	99209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_009633	T	7	7	99462	99468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_009633	TAT	2	6	99474	99479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_009633	TGT	2	6	99716	99721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_009633	TAAAA	3	15	99767	99781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_009633	A	6	6	99778	99783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_009633	AG	3	6	101280	101285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
641	NC_009633	CAT	2	6	101298	101303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_009633	A	7	7	101304	101310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_009633	T	7	7	101334	101340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_009633	AGGT	2	8	104260	104267	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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646	NC_009633	AGA	2	6	104301	104306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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