MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 6897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009484	AGC	2	6	992057	992062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_009484	TCAA	2	8	992137	992144	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2003	NC_009484	TTAG	2	8	992164	992171	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_009484	CGATG	2	10	992190	992199	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2005	NC_009484	GCG	2	6	992241	992246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_009484	TGA	2	6	992276	992281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_009484	AC	3	6	992300	992305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2008	NC_009484	GCC	2	6	993908	993913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2009	NC_009484	CACGC	2	10	993921	993930	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2010	NC_009484	CG	3	6	993954	993959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2011	NC_009484	GCC	2	6	993972	993977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_009484	TCA	2	6	997494	997499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_009484	CCA	2	6	997506	997511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2014	NC_009484	GCCG	2	8	997539	997546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2015	NC_009484	GCC	2	6	1000268	1000273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2016	NC_009484	TA	3	6	1000335	1000340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_009484	TCAG	2	8	1004824	1004831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2018	NC_009484	GGA	2	6	1004875	1004880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_009484	T	6	6	1009504	1009509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_009484	ATT	2	6	1009554	1009559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_009484	CG	3	6	1009589	1009594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2022	NC_009484	TTTG	2	8	1015156	1015163	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_009484	GTT	2	6	1015169	1015174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_009484	GC	3	6	1017237	1017242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2025	NC_009484	GC	3	6	1017280	1017285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2026	NC_009484	CTG	2	6	1017330	1017335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2027	NC_009484	CGGG	2	8	1017344	1017351	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2028	NC_009484	GTG	2	6	1017353	1017358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_009484	TGG	2	6	1017388	1017393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_009484	CCGC	2	8	1017420	1017427	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2031	NC_009484	CGTAA	2	10	1017472	1017481	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2032	NC_009484	CGC	2	6	1018842	1018847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2033	NC_009484	GCG	2	6	1018881	1018886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_009484	CGG	3	9	1018899	1018907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2035	NC_009484	GTGCG	2	10	1018938	1018947	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2036	NC_009484	GCG	2	6	1019649	1019654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2037	NC_009484	CGG	2	6	1019676	1019681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NC_009484	TGAT	2	8	1019707	1019714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2039	NC_009484	GCC	3	9	1019717	1019725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2040	NC_009484	CGG	2	6	1019728	1019733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2041	NC_009484	GCG	2	6	1021036	1021041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2042	NC_009484	GCC	2	6	1021050	1021055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2043	NC_009484	GC	3	6	1021115	1021120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2044	NC_009484	CGT	2	6	1023600	1023605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2045	NC_009484	GGA	2	6	1023655	1023660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_009484	GCG	2	6	1023679	1023684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2047	NC_009484	CGG	2	6	1024164	1024169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2049	NC_009484	GCC	2	6	1024246	1024251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2050	NC_009484	CCG	3	9	1024315	1024323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2051	NC_009484	CG	3	6	1024322	1024327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2052	NC_009484	CGG	2	6	1024403	1024408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2053	NC_009484	GCC	2	6	1024422	1024427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2054	NC_009484	GGGC	2	8	1024438	1024445	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2055	NC_009484	GC	3	6	1024457	1024462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2056	NC_009484	GCC	2	6	1024487	1024492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2057	NC_009484	GAA	2	6	1024632	1024637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_009484	GTC	2	6	1024658	1024663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2059	NC_009484	GCC	2	6	1024733	1024738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2060	NC_009484	ACA	2	6	1024745	1024750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2061	NC_009484	ACC	2	6	1025147	1025152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2062	NC_009484	CG	4	8	1029578	1029585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2063	NC_009484	GCA	2	6	1039800	1039805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2064	NC_009484	ATT	2	6	1042301	1042306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_009484	AT	3	6	1042356	1042361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2066	NC_009484	TTC	2	6	1042455	1042460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2067	NC_009484	TCC	2	6	1042483	1042488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2068	NC_009484	CGG	2	6	1042516	1042521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2069	NC_009484	T	7	7	1042523	1042529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2070	NC_009484	GCC	2	6	1042543	1042548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2071	NC_009484	CGAC	2	8	1043650	1043657	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2072	NC_009484	GC	3	6	1050095	1050100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2073	NC_009484	AGCG	2	8	1050129	1050136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2074	NC_009484	CAA	2	6	1051820	1051825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2075	NC_009484	ATCCG	2	10	1051839	1051848	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2080	NC_009484	GCC	2	6	1052823	1052828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2081	NC_009484	GCC	2	6	1052870	1052875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2086	NC_009484	GCG	2	6	1056009	1056014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2087	NC_009484	GA	3	6	1056026	1056031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2088	NC_009484	AG	3	6	1059895	1059900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2089	NC_009484	CGGA	2	8	1059912	1059919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2092	NC_009484	GCGG	2	8	1062503	1062510	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2093	NC_009484	AGG	2	6	1062546	1062551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_009484	TGATC	2	10	1064746	1064755	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2095	NC_009484	GCG	2	6	1064831	1064836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2096	NC_009484	CG	3	6	1064835	1064840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2097	NC_009484	GC	3	6	1064841	1064846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2098	NC_009484	GC	3	6	1068773	1068778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2099	NC_009484	GAT	2	6	1068821	1068826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2101	NC_009484	CGTC	2	8	1068890	1068897	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2102	NC_009484	GAC	2	6	1068916	1068921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2103	NC_009484	GTCG	2	8	1068927	1068934	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2104	NC_009484	CAAGT	2	10	1068941	1068950	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2105	NC_009484	CAC	2	6	1068955	1068960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2106	NC_009484	AGA	2	6	1069074	1069079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2107	NC_009484	GC	3	6	1069102	1069107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2108	NC_009484	GCC	2	6	1069126	1069131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2109	NC_009484	C	6	6	1069130	1069135	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2110	NC_009484	GCC	2	6	1069143	1069148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2111	NC_009484	GCC	2	6	1069169	1069174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2113	NC_009484	TTTGC	2	10	1071101	1071110	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2114	NC_009484	GC	3	6	1071829	1071834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2115	NC_009484	GCA	2	6	1076832	1076837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2119	NC_009484	CTC	2	6	1077948	1077953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2120	NC_009484	CCG	2	6	1077957	1077962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2121	NC_009484	CGT	2	6	1078027	1078032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2123	NC_009484	ATA	2	6	1081126	1081131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_009484	TCT	2	6	1081134	1081139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2126	NC_009484	T	7	7	1082428	1082434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2127	NC_009484	CCGCC	2	10	1082480	1082489	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2128	NC_009484	TC	4	8	1082502	1082509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2129	NC_009484	AG	3	6	1082547	1082552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2130	NC_009484	AG	3	6	1082562	1082567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2131	NC_009484	AATA	2	8	1082606	1082613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2133	NC_009484	GC	3	6	1086269	1086274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2500	NC_009484	CG	3	6	1228914	1228919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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