MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009484	GGGC	2	8	1876232	1876239	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
502	NC_009484	CGGG	2	8	1876408	1876415	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
503	NC_009484	GCGG	2	8	1876468	1876475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
504	NC_009484	CGGG	2	8	1876576	1876583	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
505	NC_009484	GGCG	2	8	1876623	1876630	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
506	NC_009484	CGGG	2	8	1876850	1876857	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
507	NC_009484	TTGT	2	8	1878680	1878687	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_009484	GGAT	2	8	1879298	1879305	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009484	GGGC	2	8	1884833	1884840	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
510	NC_009484	CCGG	2	8	1886623	1886630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_009484	CGGG	3	12	1886640	1886651	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
512	NC_009484	GATC	2	8	1887218	1887225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
513	NC_009484	CGGG	2	8	1899546	1899553	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
514	NC_009484	CGTC	2	8	1900688	1900695	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
515	NC_009484	GCCG	2	8	1910419	1910426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_009484	AATA	2	8	1910443	1910450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009484	CGGG	2	8	1914894	1914901	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
518	NC_009484	AATA	2	8	1917718	1917725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009484	CGGC	2	8	1917884	1917891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
520	NC_009484	GCCG	2	8	1917897	1917904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_009484	CCGC	2	8	1922995	1923002	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
522	NC_009484	GGAC	2	8	1923177	1923184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
523	NC_009484	TACA	2	8	1925156	1925163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
524	NC_009484	GGTC	2	8	1926538	1926545	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
525	NC_009484	CAGG	2	8	1933578	1933585	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
526	NC_009484	GAAT	2	8	1947109	1947116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_009484	GCCG	3	12	1952431	1952442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
528	NC_009484	CAAC	2	8	1955971	1955978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_009484	CGGG	2	8	1960160	1960167	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
530	NC_009484	GCTC	2	8	1966910	1966917	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
531	NC_009484	GCGG	2	8	1971022	1971029	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
532	NC_009484	ATGA	2	8	1975842	1975849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_009484	CAGT	2	8	1999598	1999605	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
534	NC_009484	CGGG	2	8	1999689	1999696	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
535	NC_009484	AGTG	2	8	1999798	1999805	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_009484	CCCA	2	8	1999984	1999991	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
537	NC_009484	CGGC	2	8	2000043	2000050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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540	NC_009484	ACCC	2	8	2004519	2004526	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
541	NC_009484	CCTC	2	8	2005129	2005136	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
542	NC_009484	TGGG	2	8	2005650	2005657	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009484	ATTG	2	8	2005673	2005680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009484	GACA	2	8	2009070	2009077	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
545	NC_009484	CTTT	2	8	2009420	2009427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
546	NC_009484	CACC	2	8	2009555	2009562	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
547	NC_009484	GTCT	2	8	2009563	2009570	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
548	NC_009484	TCGC	2	8	2010242	2010249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
549	NC_009484	GGGT	2	8	2010357	2010364	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
550	NC_009484	TTCA	2	8	2010476	2010483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
551	NC_009484	CATT	2	8	2010894	2010901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
552	NC_009484	CAAT	2	8	2011111	2011118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
553	NC_009484	CCCA	2	8	2011815	2011822	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
554	NC_009484	CCCA	2	8	2012777	2012784	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
555	NC_009484	CAGC	2	8	2012915	2012922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
556	NC_009484	AACG	2	8	2012940	2012947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
557	NC_009484	CAGA	2	8	2012986	2012993	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
558	NC_009484	GAAT	2	8	2013019	2013026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009484	GCCT	2	8	2013304	2013311	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
560	NC_009484	CCGG	2	8	2016083	2016090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_009484	TTGT	2	8	2029413	2029420	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009484	TGCG	2	8	2031257	2031264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
563	NC_009484	GGCG	2	8	2032135	2032142	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
564	NC_009484	CCGG	2	8	2033890	2033897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
565	NC_009484	TGGC	2	8	2035678	2035685	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
566	NC_009484	CGCC	2	8	2035732	2035739	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
567	NC_009484	CCGG	2	8	2043273	2043280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_009484	CCGG	2	8	2043291	2043298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
569	NC_009484	TCGC	2	8	2046158	2046165	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
570	NC_009484	CGGG	2	8	2064624	2064631	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
571	NC_009484	GCGG	3	12	2065481	2065492	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
572	NC_009484	GCCG	2	8	2065546	2065553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_009484	ATAA	2	8	2066547	2066554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009484	GGCG	2	8	2074946	2074953	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
575	NC_009484	GCGG	2	8	2077704	2077711	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
576	NC_009484	CGTC	2	8	2080554	2080561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
577	NC_009484	CCCG	2	8	2085848	2085855	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
578	NC_009484	CGCA	2	8	2102437	2102444	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
579	NC_009484	CGCA	2	8	2102463	2102470	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
580	NC_009484	CGCA	2	8	2102489	2102496	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
581	NC_009484	GGCG	2	8	2104170	2104177	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
582	NC_009484	GGGC	2	8	2120767	2120774	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
583	NC_009484	CCAG	2	8	2133073	2133080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
584	NC_009484	GGCG	2	8	2148686	2148693	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
585	NC_009484	GTCG	2	8	2160144	2160151	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
586	NC_009484	AATT	2	8	2165276	2165283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_009484	CGGC	2	8	2165363	2165370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_009484	CGCA	2	8	2169175	2169182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
589	NC_009484	CCGT	2	8	2169184	2169191	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
590	NC_009484	CCGG	2	8	2172835	2172842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_009484	CGCC	2	8	2172845	2172852	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
592	NC_009484	CTTT	2	8	2181258	2181265	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_009484	ATCG	2	8	2181755	2181762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
594	NC_009484	CGAG	2	8	2181898	2181905	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
595	NC_009484	GGAT	2	8	2182027	2182034	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_009484	GCCC	2	8	2186992	2186999	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
598	NC_009484	GCGG	2	8	2187779	2187786	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
599	NC_009484	CGAA	2	8	2194835	2194842	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
600	NC_009484	GCAC	2	8	2207513	2207520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
601	NC_009484	ACGC	2	8	2218102	2218109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
602	NC_009484	CTGC	2	8	2218429	2218436	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
603	NC_009484	GGGC	2	8	2235086	2235093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
604	NC_009484	GCCG	2	8	2237690	2237697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
605	NC_009484	CTGC	2	8	2238634	2238641	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
606	NC_009484	GGCG	2	8	2241863	2241870	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
607	NC_009484	GGCC	2	8	2243899	2243906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
608	NC_009484	CCCG	2	8	2243968	2243975	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
609	NC_009484	CCGG	2	8	2246400	2246407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_009484	CCGG	2	8	2255425	2255432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_009484	CCGC	2	8	2257671	2257678	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
612	NC_009484	CCGC	2	8	2260709	2260716	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
613	NC_009484	GGCG	3	12	2272054	2272065	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
614	NC_009484	CCGG	2	8	2274923	2274930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
615	NC_009484	CAAC	2	8	2275038	2275045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_009484	CCGG	2	8	2276468	2276475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_009484	CGGC	2	8	2284013	2284020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
618	NC_009484	GCCG	2	8	2289826	2289833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
619	NC_009484	CGCC	2	8	2292144	2292151	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
620	NC_009484	GCTG	2	8	2292242	2292249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
621	NC_009484	CGCC	2	8	2292502	2292509	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
622	NC_009484	CCGC	2	8	2292526	2292533	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
623	NC_009484	TCCA	2	8	2308870	2308877	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
624	NC_009484	GCGT	2	8	2309021	2309028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
625	NC_009484	GCCG	2	8	2310946	2310953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
626	NC_009484	CCCG	2	8	2325072	2325079	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
627	NC_009484	CGGG	2	8	2325082	2325089	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
628	NC_009484	TTCA	2	8	2326471	2326478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
629	NC_009484	CGTC	2	8	2335925	2335932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
630	NC_009484	CCGG	2	8	2337279	2337286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
631	NC_009484	CCGC	2	8	2339049	2339056	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
632	NC_009484	CTGG	2	8	2351859	2351866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
633	NC_009484	GACC	2	8	2357832	2357839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
634	NC_009484	GGAC	2	8	2361412	2361419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_009484	CGGA	2	8	2361435	2361442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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637	NC_009484	CCGG	2	8	2367581	2367588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
638	NC_009484	CGGG	2	8	2375215	2375222	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
639	NC_009484	GCGG	2	8	2375344	2375351	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
640	NC_009484	ATCC	2	8	2382062	2382069	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
641	NC_009484	ACGC	2	8	2383948	2383955	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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956	NC_009484	CCGG	2	8	3375281	3375288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
957	NC_009484	ACGC	2	8	3375315	3375322	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
958	NC_009484	TGGG	2	8	3375374	3375381	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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