MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY03

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009469	GCC	2	6	20	25	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009469	GTT	2	6	166	171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009469	CGA	2	6	187	192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009469	AAG	2	6	221	226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009469	GTA	2	6	242	247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009469	GTG	2	6	323	328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009469	GCG	2	6	360	365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009469	TTC	2	6	393	398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009469	GCC	2	6	436	441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009469	CCG	2	6	1076	1081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_009469	TTG	2	6	1082	1087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009469	AGT	2	6	1095	1100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009469	CGT	2	6	1189	1194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009469	AGC	2	6	2506	2511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009469	CCG	2	6	2543	2548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_009469	TCT	2	6	3423	3428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009469	AGC	3	9	6058	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009469	GTC	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009469	AAG	2	6	7335	7340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009469	AGG	2	6	7484	7489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009469	TGC	2	6	8428	8433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009469	AGC	2	6	9110	9115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009469	CGG	2	6	9185	9190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009469	CAC	2	6	9409	9414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009469	CAC	2	6	9429	9434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_009469	GCC	3	9	9440	9448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_009469	TGA	2	6	9578	9583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009469	GGA	2	6	9639	9644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009469	TGA	2	6	12372	12377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009469	GTC	2	6	12443	12448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009469	GGC	2	6	12560	12565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009469	GGA	2	6	12570	12575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009469	GGC	2	6	12605	12610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009469	TTG	2	6	14658	14663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009469	CCT	2	6	17100	17105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009469	CGC	2	6	17109	17114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009469	CGG	2	6	17126	17131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009469	ACC	3	9	17149	17157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009469	AGC	2	6	17164	17169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009469	TTC	2	6	17214	17219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009469	CGT	2	6	17244	17249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009469	CGG	2	6	17309	17314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009469	AGC	2	6	17349	17354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009469	CAG	2	6	18792	18797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009469	GCC	2	6	18846	18851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009469	GGC	2	6	18954	18959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009469	CCG	2	6	19043	19048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_009469	TGC	2	6	19159	19164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009469	ATT	2	6	19200	19205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009469	TTG	2	6	19216	19221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009469	TTC	2	6	19226	19231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009469	ATG	2	6	19291	19296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009469	GGC	2	6	19446	19451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009469	TTC	2	6	19550	19555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009469	TGC	2	6	23970	23975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009469	AGG	2	6	24575	24580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009469	CGG	2	6	25848	25853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009469	TAT	2	6	25855	25860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009469	CAT	2	6	25874	25879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009469	CGG	2	6	25936	25941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009469	GGC	2	6	26027	26032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009469	ATC	2	6	26076	26081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009469	CGG	2	6	33498	33503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009469	ACC	2	6	33511	33516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_009469	CCG	2	6	33720	33725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_009469	CGC	2	6	33737	33742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_009469	TTC	2	6	34535	34540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009469	CGC	2	6	34681	34686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009469	GCG	2	6	34746	34751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009469	GTT	2	6	34853	34858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009469	CTG	2	6	34864	34869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009469	CCT	2	6	35989	35994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_009469	TGT	2	6	36234	36239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009469	CAC	2	6	36253	36258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_009469	CAT	2	6	37672	37677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009469	CCA	2	6	37683	37688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009469	ACG	2	6	37727	37732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009469	AAT	2	6	37781	37786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009469	TGT	2	6	41773	41778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009469	CGA	2	6	41784	41789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009469	GCA	2	6	41808	41813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009469	GCT	2	6	42594	42599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009469	CCA	2	6	42621	42626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_009469	GAT	2	6	42664	42669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009469	TCC	2	6	42693	42698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009469	TTG	2	6	42796	42801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009469	TCT	2	6	42868	42873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009469	ATC	2	6	42927	42932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_009469	TGA	2	6	43002	43007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009469	GGC	2	6	43018	43023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009469	CGG	2	6	43089	43094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009469	CGC	2	6	45619	45624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_009469	GGC	2	6	45652	45657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009469	CAT	2	6	45698	45703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009469	AAG	3	9	45775	45783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009469	ATG	2	6	47249	47254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009469	ATT	2	6	48331	48336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009469	TAT	2	6	48386	48391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009469	GCT	2	6	48440	48445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009469	CCT	2	6	48485	48490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_009469	CGC	2	6	51584	51589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009469	GCC	2	6	51761	51766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_009469	GCA	2	6	51780	51785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009469	TCA	2	6	56503	56508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009469	TAC	2	6	56553	56558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009469	GTT	2	6	56659	56664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009469	GGC	2	6	56666	56671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009469	CAA	2	6	56675	56680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009469	TGT	2	6	57632	57637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009469	CCG	2	6	57775	57780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_009469	AGC	2	6	63805	63810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009469	TTG	2	6	67942	67947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009469	ACA	2	6	67958	67963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009469	CAT	2	6	70442	70447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009469	TGC	2	6	70474	70479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009469	GCG	2	6	70480	70485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009469	GGA	2	6	70582	70587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009469	TCC	2	6	70617	70622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_009469	AGA	2	6	70717	70722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009469	GAT	2	6	70846	70851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009469	GCT	2	6	70878	70883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_009469	CTG	2	6	70886	70891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009469	GTT	2	6	70912	70917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009469	TCC	2	6	70971	70976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_009469	GCA	2	6	71005	71010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009469	ACG	2	6	71212	71217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009469	GAA	2	6	71250	71255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009469	TAG	2	6	72309	72314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009469	GGC	2	6	72524	72529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009469	ATT	2	6	72606	72611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009469	GCA	2	6	73393	73398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009469	GCA	2	6	73543	73548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009469	GGC	2	6	75877	75882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009469	GCC	2	6	75890	75895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009469	GGA	2	6	75904	75909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009469	GTC	2	6	75969	75974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009469	TTG	2	6	75999	76004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009469	AGC	2	6	76071	76076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009469	GAC	2	6	76080	76085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009469	CGG	2	6	81174	81179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.