MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 5

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009350	GT	3	6	1222	1227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009350	AG	3	6	1394	1399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009350	CA	3	6	3108	3113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009350	AT	5	10	6848	6857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009350	AC	3	6	9369	9374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009350	AT	3	6	10985	10990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009350	TG	3	6	11741	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009350	CT	3	6	14871	14876	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009350	TA	3	6	15347	15352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009350	GA	3	6	15920	15925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009350	GT	3	6	17179	17184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009350	AG	3	6	17351	17356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009350	CA	3	6	21282	21287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_009350	TA	3	6	21380	21385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009350	GA	3	6	37209	37214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009350	CT	3	6	37424	37429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009350	AG	4	8	38130	38137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009350	AC	3	6	38947	38952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009350	AC	3	6	39109	39114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009350	AT	3	6	39196	39201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009350	AG	3	6	39937	39942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009350	CT	3	6	53120	53125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009350	AC	3	6	53220	53225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009350	AT	3	6	53729	53734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009350	AG	3	6	64180	64185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009350	TC	3	6	66891	66896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009350	GC	3	6	80129	80134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_009350	GC	3	6	80737	80742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009350	CT	3	6	82151	82156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009350	AT	3	6	83237	83242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009350	AG	4	8	84992	84999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009350	CT	3	6	90937	90942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009350	TC	3	6	91429	91434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009350	AT	3	6	93240	93245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009350	GC	3	6	96244	96249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009350	GT	3	6	96660	96665	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009350	GA	3	6	97154	97159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009350	GA	3	6	98543	98548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009350	GA	3	6	99034	99039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009350	TC	3	6	100063	100068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_009350	CT	3	6	109819	109824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009350	TA	4	8	111225	111232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009350	TG	3	6	113437	113442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009350	TG	4	8	128738	128745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009350	GT	3	6	133260	133265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009350	CT	3	6	133360	133365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009350	CT	4	8	134336	134343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009350	CT	3	6	136135	136140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_009350	AG	4	8	136170	136177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009350	TG	3	6	136795	136800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009350	GC	3	6	139115	139120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009350	CT	3	6	142215	142220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009350	GA	3	6	142484	142489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009350	AT	3	6	148081	148086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009350	TC	3	6	150551	150556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009350	GC	3	6	151063	151068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009350	TG	3	6	152517	152522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009350	AG	3	6	154710	154715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009350	GA	3	6	155067	155072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.