MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449

Total Repeats: 646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009348	AGGAT	2	10	9237	9246	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009348	GGTTG	2	10	10184	10193	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009348	CGATA	2	10	10786	10795	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_009348	TGTGA	2	10	21517	21526	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009348	CAAGT	2	10	31906	31915	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009348	GCTTG	2	10	49419	49428	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_009348	TTTGC	2	10	56875	56884	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_009348	GCTTG	2	10	59482	59491	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_009348	AGGCA	2	10	66807	66816	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_009348	GATGT	2	10	67414	67423	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009348	GGGAG	2	10	68789	68798	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009348	CAAAC	2	10	83328	83337	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_009348	TCGTG	2	10	84411	84420	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_009348	AGTCG	2	10	86490	86499	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_009348	AGCGG	2	10	88623	88632	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009348	TCCGC	2	10	88691	88700	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_009348	TGATC	2	10	94046	94055	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009348	GCTCA	2	10	94520	94529	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_009348	CAAGC	2	10	109745	109754	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_009348	ACAGG	2	10	128234	128243	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009348	GCCAT	2	10	149842	149851	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_009348	AGCGG	2	10	149873	149882	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_009348	TGGCG	2	10	156337	156346	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_009348	CAGCT	2	10	156529	156538	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_009348	TTGTT	2	10	170183	170192	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009348	GCAAA	2	10	181372	181381	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_009348	TGTCA	2	10	190769	190778	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009348	CTTTT	2	10	190996	191005	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009348	GGGAG	2	10	194274	194283	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009348	TGAAA	2	10	194659	194668	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009348	GAGTC	2	10	199207	199216	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_009348	AGGCT	2	10	206242	206251	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_009348	GGGAC	2	10	206263	206272	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009348	CGTGC	2	10	207509	207518	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_009348	AGGGG	2	10	217051	217060	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009348	GCGTC	2	10	224381	224390	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_009348	TCCGT	2	10	224739	224748	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_009348	GGGGC	2	10	225564	225573	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
39	NC_009348	CCATG	2	10	225718	225727	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_009348	AGGGC	2	10	226539	226548	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_009348	TGTGA	2	10	241111	241120	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009348	GCCCG	2	10	257045	257054	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_009348	CAGGG	2	10	258486	258495	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_009348	TGCAC	2	10	260008	260017	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_009348	AAAAG	2	10	260921	260930	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009348	CCTGA	2	10	265844	265853	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_009348	TTGGG	2	10	270405	270414	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009348	ATAAG	2	10	279388	279397	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009348	AATTT	2	10	283738	283747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009348	TACTC	2	10	288052	288061	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_009348	CTCGT	2	10	293123	293132	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009348	CAAAC	2	10	313277	313286	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_009348	TCGTG	2	10	314360	314369	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_009348	AGTCG	2	10	316439	316448	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009348	GTTTT	2	10	319197	319206	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009348	CAAAA	2	10	334200	334209	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_009348	TGGGG	2	10	338070	338079	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009348	TGCAA	2	10	346749	346758	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009348	TCTTT	2	10	349691	349700	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_009348	GGAGG	2	10	358072	358081	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009348	AGCTG	2	10	364882	364891	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_009348	ACTGA	2	10	365093	365102	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_009348	TGGTG	2	10	375278	375287	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009348	TGCAG	2	10	385436	385445	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009348	GCGAT	2	10	421688	421697	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_009348	CCATT	2	10	426227	426236	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009348	AGTGC	2	10	430615	430624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009348	TCATT	2	10	432622	432631	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009348	ACGGT	2	10	437554	437563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009348	ATCCA	2	10	447055	447064	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
71	NC_009348	AAATA	2	10	449116	449125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009348	ATATC	2	10	465325	465334	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_009348	GGAGC	2	10	474253	474262	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_009348	ACCCG	2	10	477712	477721	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_009348	CATGG	2	10	482111	482120	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009348	CGAAA	2	10	507075	507084	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009348	CCTCT	2	10	516902	516911	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_009348	GGGGC	2	10	517039	517048	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
79	NC_009348	GCTGG	2	10	518950	518959	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_009348	TCCAT	2	10	524541	524550	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_009348	TTGTT	2	10	535359	535368	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009348	CCGAA	2	10	541461	541470	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_009348	ATTAA	2	10	557937	557946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009348	TCCAT	2	10	575342	575351	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_009348	GGGGA	2	10	595273	595282	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009348	GAGCG	2	10	606262	606271	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_009348	GAGCG	2	10	606374	606383	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_009348	CGTGG	2	10	629131	629140	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_009348	TCAGG	2	10	629521	629530	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009348	GTTCA	2	10	629723	629732	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_009348	AAGGA	2	10	633614	633623	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009348	GTATA	2	10	637832	637841	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009348	TCATT	2	10	653060	653069	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009348	GTTTT	2	10	654817	654826	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009348	CTTGG	2	10	654877	654886	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_009348	GCCAT	2	10	664300	664309	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_009348	TGAAT	2	10	670023	670032	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009348	GCAGT	2	10	676219	676228	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009348	TTCAT	2	10	691379	691388	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_009348	TCAAA	3	15	691521	691535	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_009348	ATAGA	2	10	722288	722297	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009348	CTTCA	2	10	732857	732866	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_009348	AGATG	2	10	737368	737377	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009348	GATCC	2	10	754628	754637	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_009348	AGATT	2	10	756801	756810	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009348	GAATG	2	10	763331	763340	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009348	ATTTA	2	10	766239	766248	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009348	TTTCA	2	10	783070	783079	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_009348	TTGCC	2	10	808408	808417	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_009348	GGTCG	2	10	817624	817633	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009348	CAAAC	2	10	819400	819409	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_009348	TCGTG	2	10	820483	820492	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_009348	AGTCG	2	10	822536	822545	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_009348	CTGCA	2	10	825618	825627	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009348	CTCTA	2	10	860822	860831	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_009348	GGGAT	2	10	866667	866676	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009348	GAGAC	2	10	869231	869240	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009348	CCCGG	2	10	874505	874514	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
119	NC_009348	TAAAT	2	10	874834	874843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009348	CAATG	2	10	878650	878659	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009348	TTTGT	2	10	883813	883822	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009348	GCATG	2	10	896682	896691	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009348	GCATG	2	10	896786	896795	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_009348	GCATG	2	10	896910	896919	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_009348	GCATG	2	10	897034	897043	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_009348	TTTTG	2	10	897128	897137	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009348	GTGTT	2	10	911307	911316	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009348	GTTTT	2	10	911436	911445	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009348	AAGCA	2	10	920265	920274	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_009348	AAATA	2	10	953208	953217	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009348	AATCA	2	10	956219	956228	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_009348	ATGTT	2	10	956433	956442	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009348	GGCCT	2	10	965396	965405	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_009348	CACCT	2	10	1050107	1050116	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
135	NC_009348	GCTAT	2	10	1076121	1076130	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_009348	ACTGA	2	10	1080507	1080516	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009348	TTAAT	2	10	1085429	1085438	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009348	GTGAA	2	10	1099393	1099402	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009348	GAAAT	2	10	1102787	1102796	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009348	CTGTG	2	10	1123401	1123410	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_009348	TGGGT	2	10	1146779	1146788	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009348	CTTGA	2	10	1152236	1152245	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_009348	GTTTT	2	10	1153212	1153221	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009348	GAGGG	2	10	1188480	1188489	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009348	GGGCA	2	10	1209332	1209341	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_009348	TGTGT	2	10	1218135	1218144	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009348	TTGTT	2	10	1221425	1221434	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009348	TAAAA	2	10	1232325	1232334	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_009348	ATGGC	2	10	1330770	1330779	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_009348	AGGGG	2	10	1332067	1332076	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_009348	CCTGT	2	10	1856626	1856635	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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276	NC_009348	TTGTT	2	10	2046279	2046288	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_009348	ATCAT	2	10	2058657	2058666	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
279	NC_009348	GGGCA	2	10	2084391	2084400	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
280	NC_009348	CTGGA	2	10	2084459	2084468	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
281	NC_009348	CCAAG	2	10	2094122	2094131	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
282	NC_009348	CTGCC	2	10	2111044	2111053	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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285	NC_009348	ATGGT	2	10	2135479	2135488	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
286	NC_009348	CAGAA	2	10	2136222	2136231	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
287	NC_009348	CAGAA	2	10	2143979	2143988	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
288	NC_009348	CCCTG	2	10	2153542	2153551	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
289	NC_009348	GTCTG	2	10	2169069	2169078	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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292	NC_009348	CAAGC	2	10	2172553	2172562	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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295	NC_009348	TGGAG	2	10	2173043	2173052	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_009348	TGGTA	2	10	2257107	2257116	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_009348	TGAAT	2	10	2329612	2329621	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_009348	GTCTG	2	10	2421055	2421064	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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359	NC_009348	TGGCG	2	10	2621276	2621285	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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407	NC_009348	TGTGC	2	10	2936276	2936285	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
408	NC_009348	AGCCC	2	10	2941669	2941678	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
409	NC_009348	TCAGT	2	10	2964253	2964262	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
410	NC_009348	CCAAT	2	10	2981001	2981010	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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412	NC_009348	CCAAG	2	10	3021732	3021741	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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414	NC_009348	GTGTG	2	10	3036922	3036931	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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419	NC_009348	TCACC	2	10	3048232	3048241	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
420	NC_009348	ATTTT	2	10	3048552	3048561	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_009348	GGTAA	2	10	3054255	3054264	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_009348	GGCCC	2	10	3662322	3662331	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

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