MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter baumannii ATCC 17978 chromosome

Total Repeats: 493

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009085	CAAAAA	2	12	12443	12454	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_009085	ATCAAG	2	12	18039	18050	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_009085	CGCTTT	2	12	23843	23854	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009085	GCAAAG	2	12	23956	23967	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_009085	GAATCA	2	12	24549	24560	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009085	AGAAAA	2	12	38359	38370	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009085	ATAAAA	2	12	40616	40627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009085	CACCAG	2	12	41991	42002	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009085	AAAAAG	2	12	45108	45119	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009085	TATTTT	2	12	48244	48255	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009085	ATAACT	2	12	55951	55962	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_009085	TTATTT	2	12	70114	70125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009085	ATCAAG	2	12	74303	74314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_009085	CTGAAC	2	12	87391	87402	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009085	TCCTGT	2	12	95595	95606	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009085	TTTCAG	2	12	96509	96520	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_009085	TCCTGT	2	12	96769	96780	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009085	TCCTGT	2	12	97686	97697	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009085	TTAGGC	2	12	97798	97809	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_009085	TCTTAA	2	12	102166	102177	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_009085	AATTTA	2	12	107482	107493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009085	AATTTT	2	12	131857	131868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009085	ATTAAA	2	12	132926	132937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009085	TTTATG	2	12	133045	133056	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009085	TAATTA	2	12	133490	133501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009085	ATAAAT	2	12	155210	155221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009085	ATCCTG	2	12	155398	155409	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_009085	CAAGGT	2	12	162415	162426	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_009085	TTCAAT	2	12	164164	164175	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_009085	TTTCAT	2	12	169225	169236	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009085	ATTGAC	2	12	171431	171442	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_009085	TTGCGT	2	12	172733	172744	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_009085	TAAAAT	2	12	180850	180861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009085	AATTTT	2	12	192903	192914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009085	GAAATC	2	12	197464	197475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009085	AATTTG	2	12	202017	202028	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009085	GATCAA	2	12	203296	203307	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_009085	CTTTAT	2	12	220166	220177	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_009085	ACTTTA	2	12	220644	220655	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_009085	ATTTTT	2	12	241798	241809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009085	ATTTTA	2	12	242693	242704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009085	ATCAAG	2	12	243148	243159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_009085	ACCTCA	2	12	244236	244247	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009085	CCAAAT	2	12	247379	247390	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009085	TAAATC	2	12	259065	259076	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_009085	GTACTG	2	12	262480	262491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_009085	TGGTTG	2	12	274960	274971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009085	ATTTTA	2	12	293690	293701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009085	CCGTAT	2	12	309860	309871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009085	AAATAA	2	12	315083	315094	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009085	TTAGTG	2	12	315822	315833	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009085	TAAAAA	3	18	318371	318388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009085	ATTGCA	2	12	325105	325116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_009085	GCTCAT	2	12	336588	336599	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009085	TCAGAA	2	12	343332	343343	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_009085	TTGATT	2	12	347529	347540	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009085	ATTTTT	2	12	351793	351804	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009085	GCAGAA	2	12	362249	362260	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_009085	AAAAGC	2	12	362329	362340	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_009085	AACCAG	2	12	362972	362983	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009085	TAATTC	2	12	363585	363596	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_009085	CGTGAA	2	12	363922	363933	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_009085	ACTCAA	2	12	380188	380199	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009085	TATAAA	2	12	429273	429284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009085	CTTTAT	2	12	429900	429911	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_009085	ATGAAG	2	12	439695	439706	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009085	ATTCAT	2	12	444491	444502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_009085	TTAATC	2	12	453524	453535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_009085	TTGAAT	2	12	464924	464935	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009085	GTTTTT	2	12	468003	468014	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009085	TTTGTT	2	12	488867	488878	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009085	ATGCAG	2	12	491849	491860	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_009085	AGTTTA	2	12	496280	496291	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009085	TTGATA	2	12	496754	496765	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009085	TCAAAA	2	12	505186	505197	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_009085	GTTGAT	2	12	518973	518984	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009085	TGATAG	2	12	530277	530288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009085	AAAAAT	2	12	541664	541675	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009085	CTCGAT	2	12	541677	541688	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009085	TAAGGG	2	12	556428	556439	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009085	TTTAGG	2	12	559898	559909	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009085	ATATTC	2	12	560579	560590	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009085	CTTTAT	2	12	583687	583698	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_009085	TGACTT	2	12	583857	583868	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_009085	TCATGC	2	12	586769	586780	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009085	TAAAAT	2	12	608739	608750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009085	TTTTAT	2	12	637811	637822	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009085	ATATTT	2	12	645916	645927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009085	TAAGCT	2	12	678185	678196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_009085	CTTCAG	2	12	684830	684841	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009085	ATTTTT	2	12	685995	686006	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009085	AATATA	2	12	690795	690806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009085	TAAATT	2	12	691322	691333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009085	AAGCAA	2	12	692533	692544	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_009085	AGAAGC	2	12	699547	699558	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_009085	AAATAT	2	12	703846	703857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009085	AAATTT	2	12	711371	711382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009085	TACCAT	2	12	712358	712369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009085	ATCAAA	2	12	714869	714880	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_009085	GTTAAC	2	12	714888	714899	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_009085	AAATTA	2	12	715042	715053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009085	GATCAA	2	12	727185	727196	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_009085	TAAATT	2	12	729215	729226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009085	TCATCT	2	12	729597	729608	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009085	TGAAGA	2	12	730661	730672	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009085	CAGCAA	2	12	744801	744812	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009085	CCGGAA	2	12	746929	746940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009085	CAGACA	2	12	747555	747566	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_009085	AGCTCC	2	12	747704	747715	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009085	AAGTTG	2	12	748905	748916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009085	TTAAGG	2	12	754648	754659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009085	CCTTTT	2	12	754681	754692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009085	AAGGAA	2	12	757762	757773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009085	AAAATG	2	12	758313	758324	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009085	ATATAA	2	12	761517	761528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009085	TTCCAT	2	12	764247	764258	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009085	TATCTT	2	12	768034	768045	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_009085	CTTGAT	2	12	774075	774086	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_009085	ACTAAA	2	12	775122	775133	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_009085	ATAAAA	2	12	775423	775434	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009085	AATATC	2	12	775913	775924	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_009085	CGGGAT	2	12	796873	796884	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_009085	CGATTT	2	12	802197	802208	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_009085	CGATTT	2	12	808022	808033	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_009085	CTTTAC	2	12	816374	816385	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009085	ATTTTA	2	12	816469	816480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009085	TTTTTC	2	12	817034	817045	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_009085	TAGTTC	2	12	823389	823400	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_009085	GTAGAT	2	12	823438	823449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009085	TATTCC	2	12	837900	837911	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009085	ATTTTA	2	12	841893	841904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009085	TAAAAA	2	12	867379	867390	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009085	ATATTT	2	12	874927	874938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009085	AAGATT	2	12	884745	884756	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_009085	GAAAAT	2	12	892476	892487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_009085	AATTTA	2	12	968873	968884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_009085	TTTGGT	2	12	1830995	1831006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_009085	ATCGAC	2	12	1848579	1848590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_009085	TCTTAA	2	12	1850643	1850654	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
256	NC_009085	TTAAAG	2	12	1851083	1851094	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_009085	TAATAT	2	12	1899206	1899217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_009085	TGCCAG	2	12	1906009	1906020	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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260	NC_009085	CTCTTC	2	12	1913134	1913145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
261	NC_009085	ATTGGA	2	12	1914784	1914795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_009085	AATTTA	2	12	1944877	1944888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.