MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 6847

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009053	ATTTCA	2	12	1759060	1759071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5002	NC_009053	CAT	2	6	1759099	1759104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_009053	GCC	2	6	1759174	1759179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_009053	GGCA	2	8	1759245	1759252	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5005	NC_009053	TAA	2	6	1759299	1759304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_009053	CAGC	2	8	1759312	1759319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5007	NC_009053	TC	3	6	1759427	1759432	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_009053	ACC	2	6	1759457	1759462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_009053	TCA	2	6	1759556	1759561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_009053	TAACC	2	10	1759639	1759648	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5011	NC_009053	CAA	2	6	1759898	1759903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_009053	CGACT	2	10	1759967	1759976	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5013	NC_009053	CTTT	2	8	1759991	1759998	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5014	NC_009053	ATG	2	6	1760001	1760006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_009053	GCT	2	6	1760007	1760012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_009053	GTT	2	6	1760097	1760102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_009053	ACG	2	6	1760112	1760117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_009053	GT	3	6	1760134	1760139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_009053	TCGGT	2	10	1760342	1760351	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5020	NC_009053	GTAC	2	8	1760555	1760562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_009053	GGA	2	6	1760661	1760666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_009053	C	6	6	1760671	1760676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5023	NC_009053	ATA	2	6	1760730	1760735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_009053	TCGC	2	8	1760829	1760836	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_009053	TTA	2	6	1760908	1760913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_009053	TAA	2	6	1760929	1760934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_009053	TAG	2	6	1760935	1760940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_009053	TTC	2	6	1760942	1760947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_009053	CTT	2	6	1760988	1760993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_009053	CTT	2	6	1761030	1761035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_009053	GCT	2	6	1761165	1761170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_009053	TAC	2	6	1761210	1761215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_009053	CTTT	2	8	1761221	1761228	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5034	NC_009053	TC	3	6	1761235	1761240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_009053	T	6	6	1761261	1761266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_009053	ACA	2	6	1761281	1761286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_009053	CCG	2	6	1761334	1761339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_009053	ACA	2	6	1761376	1761381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_009053	TCAT	3	12	1761476	1761487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5040	NC_009053	TG	3	6	1761497	1761502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_009053	AGG	2	6	1761531	1761536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_009053	C	6	6	1761612	1761617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5043	NC_009053	GT	3	6	1761672	1761677	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_009053	GT	3	6	1761841	1761846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_009053	ATG	2	6	1761866	1761871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_009053	TCC	2	6	1761892	1761897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_009053	CAA	2	6	1761944	1761949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_009053	GAC	2	6	1762005	1762010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_009053	GCA	2	6	1762017	1762022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_009053	TTC	2	6	1762093	1762098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_009053	GCT	2	6	1762333	1762338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_009053	TTC	2	6	1762382	1762387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_009053	GCCTTC	2	12	1762626	1762637	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_009053	TCC	2	6	1762643	1762648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_009053	CCCT	2	8	1762688	1762695	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5056	NC_009053	GCT	2	6	1762833	1762838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_009053	CTT	2	6	1762858	1762863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_009053	CTT	2	6	1762942	1762947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_009053	C	7	7	1762976	1762982	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5060	NC_009053	CTG	2	6	1763001	1763006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_009053	TCG	2	6	1763076	1763081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_009053	TCG	2	6	1763257	1763262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_009053	AAAG	2	8	1763265	1763272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_009053	GCC	2	6	1763317	1763322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_009053	TTCAA	2	10	1763352	1763361	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5066	NC_009053	T	6	6	1763486	1763491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_009053	TCAA	2	8	1763500	1763507	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5068	NC_009053	CA	3	6	1763516	1763521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_009053	GTT	2	6	1763535	1763540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_009053	A	6	6	1763548	1763553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_009053	CCA	2	6	1763736	1763741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_009053	GC	3	6	1763772	1763777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_009053	TCA	2	6	1763856	1763861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5075	NC_009053	TGT	2	6	1763911	1763916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_009053	A	6	6	1763931	1763936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_009053	A	7	7	1763941	1763947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_009053	TCAT	2	8	1763948	1763955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_009053	AAT	3	9	1763979	1763987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_009053	TAT	2	6	1767150	1767155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_009053	AAT	2	6	1767215	1767220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_009053	TCT	2	6	1767299	1767304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_009053	CTA	2	6	1767348	1767353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5087	NC_009053	TTG	2	6	1769121	1769126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_009053	A	7	7	1770206	1770212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5091	NC_009053	A	6	6	1777734	1777739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_009053	GT	3	6	1777740	1777745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_009053	T	7	7	1777777	1777783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_009053	T	8	8	1777797	1777804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_009053	T	6	6	1777941	1777946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_009053	CGA	2	6	1779309	1779314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5098	NC_009053	CGC	2	6	1782070	1782075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5099	NC_009053	T	6	6	1782136	1782141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_009053	TC	3	6	1782149	1782154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5101	NC_009053	TGT	2	6	1782212	1782217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_009053	A	7	7	1782229	1782235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_009053	T	6	6	1782351	1782356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_009053	ACCG	2	8	1782672	1782679	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_009053	T	7	7	1782689	1782695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_009053	A	6	6	1788668	1788673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_009053	TAA	2	6	1788697	1788702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_009053	TGGG	2	8	1788794	1788801	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_009053	ATT	2	6	1788826	1788831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_009053	T	7	7	1789329	1789335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_009053	TAA	2	6	1789367	1789372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_009053	ATT	2	6	1789389	1789394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_009053	TA	3	6	1789399	1789404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_009053	ATAA	2	8	1789409	1789416	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_009053	ATA	2	6	1789466	1789471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_009053	AT	3	6	1789491	1789496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_009053	TGA	2	6	1789538	1789543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5120	NC_009053	GAA	2	6	1789642	1789647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_009053	TAT	2	6	1789648	1789653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_009053	TA	3	6	1789670	1789675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_009053	ATC	2	6	1789702	1789707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5126	NC_009053	AG	3	6	1789800	1789805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_009053	TAT	2	6	1789821	1789826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_009053	TATAAT	2	12	1789836	1789847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_009053	ATT	2	6	1789855	1789860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_009053	TTA	2	6	1789867	1789872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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