MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008782	CGGGGC	2	12	55135	55146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008782	GACCGC	2	12	73596	73607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008782	GCCGTC	2	12	108435	108446	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008782	GCCGCT	2	12	147181	147192	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008782	ACCGCT	2	12	264319	264330	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008782	GGCGCC	2	12	266591	266602	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008782	CCACGA	2	12	330375	330386	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008782	CAGGAA	2	12	330538	330549	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008782	GGTGCC	2	12	331348	331359	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008782	CCTGGC	2	12	375466	375477	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008782	GGCCGG	2	12	386813	386824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008782	GTGTCC	2	12	392678	392689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008782	CCACCG	2	12	411812	411823	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008782	TTTTTG	2	12	414234	414245	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008782	GCGCTG	2	12	420467	420478	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008782	GGCCTG	2	12	435108	435119	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008782	CCAGTT	2	12	436860	436871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008782	ATCTGA	2	12	458160	458171	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008782	AGGCAA	2	12	556429	556440	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008782	TTCCCG	2	12	591399	591410	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008782	CCAAGA	2	12	613132	613143	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008782	GCAAGC	2	12	636276	636287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008782	CAAAAG	2	12	645429	645440	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008782	GGCCGC	2	12	675931	675942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008782	CGGGGG	2	12	684557	684568	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008782	GGCGCC	2	12	711422	711433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008782	GTGGGC	2	12	720927	720938	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008782	CGTGGC	2	12	721037	721048	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008782	GGCCAC	2	12	721399	721410	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008782	GAAAAG	2	12	909515	909526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008782	GCGCCG	2	12	933506	933517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008782	GCCCGC	2	12	966607	966618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008782	CAGGTC	2	12	971824	971835	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008782	TCTGGC	2	12	1014154	1014165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008782	GCTGTG	2	12	1059827	1059838	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008782	CTGGCC	2	12	1060352	1060363	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008782	GGGCCA	2	12	1060946	1060957	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008782	CCGGGC	2	12	1064695	1064706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008782	CTTCTC	2	12	1066550	1066561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008782	GTGCGT	2	12	1074402	1074413	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008782	ACGCTG	2	12	1087743	1087754	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008782	GCAGGG	2	12	1087862	1087873	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008782	GCATCG	2	12	1093276	1093287	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008782	GGGCCT	2	12	1093364	1093375	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008782	CGGGCG	2	12	1094749	1094760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008782	AAAAAC	2	12	1107532	1107543	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008782	CGGGCG	2	12	1129740	1129751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008782	GCCCGT	2	12	1156673	1156684	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008782	AGCGCG	2	12	1158119	1158130	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008782	TGGCGG	2	12	1158738	1158749	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008782	CGGGCG	2	12	1218740	1218751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008782	TCGATG	2	12	1219459	1219470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008782	TGAGCG	2	12	1219505	1219516	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008782	CTATTG	2	12	1242365	1242376	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008782	GTAAAG	2	12	1262786	1262797	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008782	GGCGCT	2	12	1264352	1264363	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008782	GCAAGA	2	12	1304341	1304352	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008782	GGATGA	2	12	1360777	1360788	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008782	GTCGCT	2	12	1366562	1366573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008782	ACGCGC	2	12	1366774	1366785	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008782	TGCTTG	2	12	1367742	1367753	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008782	GCACCG	2	12	1378102	1378113	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008782	TGGGAA	2	12	1387571	1387582	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008782	AGAAGG	2	12	1401252	1401263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008782	AGCGCG	2	12	1413005	1413016	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008782	GGGGAC	2	12	1497729	1497740	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008782	GCACCG	2	12	1505158	1505169	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008782	GAGGCC	2	12	1541448	1541459	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008782	TGCGCG	2	12	1544635	1544646	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008782	CGATTT	2	12	1572503	1572514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008782	GGACAA	2	12	1575046	1575057	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008782	GGATCC	2	12	1620327	1620338	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008782	CGGGGC	2	12	1655255	1655266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008782	GTCTGG	2	12	1655649	1655660	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_008782	GGCGAC	2	12	1681059	1681070	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008782	CGGTGG	2	12	1699505	1699516	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008782	TGGCGC	2	12	1709587	1709598	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008782	GCGCTC	2	12	1710805	1710816	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008782	GGGGCG	2	12	1777894	1777905	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_008782	TTTTTC	2	12	1795895	1795906	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008782	GCAAGA	2	12	1804946	1804957	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008782	GTTTTT	2	12	1838376	1838387	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008782	CAAATT	2	12	1872701	1872712	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008782	TGCCTA	2	12	1873953	1873964	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008782	TTCTTT	2	12	1875038	1875049	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008782	GTGTTT	2	12	1934957	1934968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008782	CAGAAG	2	12	1942470	1942481	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_008782	GCTGCG	2	12	1942661	1942672	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008782	GCCATC	2	12	2021200	2021211	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008782	CTGGCG	2	12	2046969	2046980	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008782	CGCATG	2	12	2058166	2058177	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008782	GCTCAA	2	12	2071724	2071735	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008782	GATCAA	2	12	2075255	2075266	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_008782	CTGCGC	2	12	2134843	2134854	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008782	GGGTGT	2	12	2225298	2225309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008782	TCGCCC	2	12	2225902	2225913	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008782	TCGACG	2	12	2231601	2231612	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008782	AAAGGA	2	12	2231702	2231713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008782	GGGTGT	2	12	2236104	2236115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008782	TCGCCC	2	12	2236708	2236719	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_008782	GCTTGG	2	12	2242200	2242211	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008782	CTGGGC	2	12	2295840	2295851	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008782	GAAACC	2	12	2311902	2311913	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008782	TTGCGC	2	12	2355841	2355852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008782	GCCGGT	2	12	2371700	2371711	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008782	CCGCGC	2	12	2379638	2379649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_008782	TGGCGA	2	12	2393871	2393882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008782	CCACGC	2	12	2472077	2472088	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_008782	CCGGGG	2	12	2484202	2484213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008782	TGCGCC	2	12	2488500	2488511	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008782	AGCCCT	2	12	2550419	2550430	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008782	GCATGC	2	12	2557805	2557816	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008782	CGCCGA	2	12	2577998	2578009	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008782	AGCCGC	2	12	2620675	2620686	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008782	TGGCAT	2	12	2645782	2645793	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008782	CCACGT	2	12	2659381	2659392	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008782	GGCCGA	2	12	2700479	2700490	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008782	AACGGT	2	12	2755023	2755034	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_008782	GGCAGG	2	12	2809537	2809548	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_008782	CGCACA	2	12	2826123	2826134	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008782	GCCTGG	2	12	2826432	2826443	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008782	GATCTT	2	12	2863423	2863434	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_008782	GACGCG	2	12	2880304	2880315	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008782	GGCCGA	2	12	2894304	2894315	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008782	TTCACG	2	12	2909226	2909237	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008782	CCCCAC	2	12	2999182	2999193	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
127	NC_008782	CTGCGG	2	12	3049486	3049497	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008782	TGCGCC	2	12	3058512	3058523	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008782	GCAAGC	2	12	3069865	3069876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008782	GCCGCT	2	12	3102461	3102472	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008782	CTGGCC	2	12	3111077	3111088	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008782	GCCAGC	2	12	3171243	3171254	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008782	CCTGCG	2	12	3217537	3217548	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008782	GGGCCA	2	12	3217912	3217923	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008782	CGCTGA	2	12	3279564	3279575	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_008782	ATAAAA	2	12	3342320	3342331	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_008782	GCAAGC	2	12	3382408	3382419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_008782	CAAAGC	2	12	3386516	3386527	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008782	GCCTGG	2	12	3405090	3405101	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008782	GCCATT	2	12	3459734	3459745	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_008782	GCAAGC	2	12	3464388	3464399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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145	NC_008782	GCGCGG	3	18	3484471	3484488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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147	NC_008782	CGCCCT	2	12	3517679	3517690	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_008782	GCCAGC	2	12	3524226	3524237	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_008782	TTGGCT	2	12	3533568	3533579	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_008782	CGGCCC	2	12	3537279	3537290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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159	NC_008782	CGCCCG	2	12	3687436	3687447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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165	NC_008782	CCTGCG	2	12	3858251	3858262	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.