MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 11953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008782	GAC	2	6	399366	399371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_008782	TGC	2	6	399378	399383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_008782	GGC	2	6	399386	399391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_008782	TGGC	2	8	399439	399446	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_008782	A	6	6	401495	401500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008782	TGCG	2	8	401507	401514	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_008782	CGG	2	6	401524	401529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_008782	AAC	2	6	401560	401565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_008782	GAG	2	6	401655	401660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008782	GCG	2	6	405198	405203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_008782	GAC	2	6	405206	405211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_008782	GACT	2	8	405220	405227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_008782	GCC	2	6	405237	405242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_008782	GCAG	2	8	406857	406864	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_008782	GA	3	6	406865	406870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008782	GAG	2	6	407282	407287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008782	AAG	2	6	410773	410778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008782	CCACCG	2	12	411812	411823	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_008782	TGG	2	6	411838	411843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008782	CG	3	6	414117	414122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_008782	TTTTTG	2	12	414234	414245	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008782	GCT	2	6	414251	414256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_008782	CTT	2	6	414260	414265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_008782	GCG	2	6	414272	414277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_008782	CG	3	6	414276	414281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_008782	CGGA	2	8	414293	414300	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_008782	TGT	2	6	414311	414316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008782	GC	3	6	418221	418226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_008782	TG	3	6	418227	418232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_008782	CGG	2	6	418237	418242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_008782	CG	3	6	418250	418255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_008782	GC	3	6	418258	418263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_008782	TGGCC	2	10	420315	420324	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1034	NC_008782	GATG	2	8	420367	420374	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008782	GCG	2	6	420430	420435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_008782	GCGCTG	2	12	420467	420478	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_008782	TGC	2	6	421856	421861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_008782	GCT	2	6	423169	423174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_008782	GCCC	2	8	423228	423235	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1040	NC_008782	AG	3	6	424209	424214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_008782	G	8	8	424232	424239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_008782	GT	3	6	424243	424248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_008782	GTC	2	6	425405	425410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_008782	TGT	3	9	425418	425426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008782	G	6	6	426137	426142	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008782	GCC	2	6	427950	427955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_008782	CGG	2	6	429123	429128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_008782	TAG	2	6	430556	430561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008782	GC	3	6	431106	431111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_008782	GC	3	6	431135	431140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_008782	GTG	2	6	431141	431146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008782	GCC	2	6	432636	432641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_008782	GCTTG	2	10	432667	432676	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1054	NC_008782	GTA	2	6	433983	433988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_008782	GCCGC	2	10	434078	434087	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1056	NC_008782	GCC	2	6	434109	434114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_008782	TGC	2	6	434975	434980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_008782	GCA	2	6	434988	434993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_008782	GGCCTG	2	12	435108	435119	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_008782	GGCG	2	8	435120	435127	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_008782	GCC	2	6	435128	435133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_008782	CTG	2	6	435173	435178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_008782	CTG	2	6	435218	435223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_008782	GGCT	2	8	435224	435231	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_008782	CTG	2	6	435233	435238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_008782	GC	3	6	435272	435277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_008782	TGC	2	6	435291	435296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_008782	CGCC	2	8	435303	435310	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1069	NC_008782	GCC	2	6	435336	435341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_008782	GC	3	6	435472	435477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_008782	GAGC	2	8	435580	435587	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_008782	ACC	2	6	435591	435596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_008782	CG	4	8	435634	435641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_008782	GGC	2	6	435676	435681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_008782	GGT	2	6	435685	435690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_008782	ACA	2	6	435693	435698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_008782	GTG	2	6	435710	435715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008782	CG	3	6	435807	435812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_008782	GGC	2	6	435825	435830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_008782	GCGCG	2	10	435955	435964	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1081	NC_008782	AGC	2	6	436095	436100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_008782	GCG	2	6	436131	436136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_008782	CTG	2	6	436148	436153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_008782	CGA	2	6	436210	436215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_008782	CA	3	6	436226	436231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_008782	CTG	2	6	436267	436272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_008782	GGC	2	6	436274	436279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_008782	CGA	2	6	436287	436292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_008782	CGC	2	6	436359	436364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_008782	GGT	3	9	436401	436409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_008782	ACC	2	6	436453	436458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_008782	GCT	2	6	436464	436469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_008782	GC	3	6	436475	436480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1094	NC_008782	GCGCG	2	10	436512	436521	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1095	NC_008782	CTT	2	6	436527	436532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_008782	CG	4	8	436554	436561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_008782	TAC	2	6	436621	436626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_008782	CCGG	2	8	436649	436656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_008782	GCTG	2	8	436682	436689	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1100	NC_008782	AGG	2	6	436697	436702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_008782	CG	3	6	436716	436721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_008782	GC	3	6	436779	436784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_008782	GC	3	6	436809	436814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_008782	CGC	2	6	436853	436858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_008782	CCAGTT	2	12	436860	436871	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_008782	GCC	2	6	436882	436887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_008782	CGA	2	6	436974	436979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_008782	TGC	2	6	436991	436996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_008782	GCA	2	6	437004	437009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_008782	GAC	2	6	437032	437037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_008782	GATC	2	8	437097	437104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_008782	CGA	2	6	437136	437141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_008782	GCC	2	6	437155	437160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_008782	CGC	2	6	437216	437221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_008782	AGC	2	6	437222	437227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_008782	GCC	2	6	437279	437284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_008782	CGG	2	6	437291	437296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_008782	GCT	2	6	437310	437315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_008782	GAGC	2	8	437342	437349	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_008782	GGC	2	6	438243	438248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_008782	GAG	2	6	438279	438284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_008782	GCG	2	6	438303	438308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_008782	GGC	2	6	438321	438326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_008782	CCG	2	6	438377	438382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1125	NC_008782	CG	3	6	438435	438440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_008782	GCC	2	6	438459	438464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_008782	CGG	2	6	440970	440975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_008782	A	6	6	440995	441000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_008782	TGC	2	6	441015	441020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_008782	GGC	2	6	441049	441054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_008782	ATGG	2	8	441064	441071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008782	TGA	2	6	441083	441088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_008782	GGC	2	6	443747	443752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1410	NC_008782	T	7	7	596086	596092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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